El Centro Nacional de Información Biotecnológica ( NCBI ) [1] [2] es parte de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos (NLM), una rama de los Institutos Nacionales de Salud (NIH). Está aprobado y financiado por el gobierno de los Estados Unidos . El NCBI está ubicado en Bethesda, Maryland y fue fundado en 1988 a través de una legislación patrocinada por el congresista estadounidense Claude Pepper .
El NCBI alberga una serie de bases de datos relevantes para la biotecnología y la biomedicina y es un recurso importante para herramientas y servicios bioinformáticos. Las principales bases de datos incluyen GenBank para secuencias de ADN y PubMed , una base de datos bibliográfica para literatura biomédica. Otras bases de datos incluyen la base de datos NCBI Epigenomics . Todas estas bases de datos están disponibles en línea a través del motor de búsqueda Entrez . El NCBI fue dirigido por David Lipman , [2] uno de los autores originales del programa de alineación de secuencias BLAST [3] y una figura ampliamente respetada en bioinformática .
El NCBI tenía la responsabilidad de poner a disposición la base de datos de secuencias de ADN GenBank desde 1992. [4] GenBank coordina con laboratorios individuales y otras bases de datos de secuencias como las del Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL) y el Banco de Datos de ADN de Japón (DDBJ). [4]
Desde 1992, NCBI ha crecido para proporcionar otras bases de datos además de GenBank. NCBI proporciona genes , herencia mendeliana en línea en el hombre , la base de datos de modelado molecular (estructuras de proteínas 3D), dbSNP (una base de datos de polimorfismos de un solo nucleótido ), la colección de secuencias de referencia, un mapa del genoma humano y un navegador de taxonomía , y coordenadas. con el Instituto Nacional del Cáncer para proporcionar el Proyecto de Anatomía del Genoma del Cáncer. El NCBI asigna un identificador único (número de identificación de taxonomía) a cada especie de organismo. [5]
El NCBI tiene herramientas de software que están disponibles a través de navegadores de Internet o por FTP. Por ejemplo, BLAST es un programa de búsqueda de similitudes de secuencia. BLAST puede realizar comparaciones de secuencias con la base de datos de ADN de GenBank en menos de 15 segundos.
El NCBI Bookshelf [6] es una colección de versiones en línea, de libre acceso y descargables, de libros biomédicos seleccionados. La estantería cubre una amplia gama de temas que incluyen biología molecular , bioquímica , biología celular , genética , microbiología , estados patológicos desde un punto de vista molecular y celular, métodos de investigación y virología . Algunos de los libros son versiones en línea de libros publicados anteriormente, mientras que otros, como Coffee Break , están escritos y editados por personal de NCBI. Bookshelf es un complemento del repositorio Entrez PubMed de publicaciones revisadas por pares.Los resúmenes en los que los contenidos de Bookshelf brindan perspectivas establecidas sobre áreas de estudio en evolución y un contexto en el que se pueden organizar muchas piezas individuales dispares de investigación informada. [ cita requerida ]