Tres dedos proteínas o de tres dedos dominios de la proteína ( 3Fp o TFPD ) son una superfamilia de proteínas que consiste en pequeño, más o menos 60-80 aminoácidos de residuos dominios de la proteína con una común estructura terciaria : tres hebra beta bucles extendido desde un núcleo hidrófobo estabilizadas por disulfuro bonos . La familia lleva el nombre de los "dedos" extendidos de los tres bucles. Los miembros de la familia no tienen actividad enzimática , pero son capaces de formar interacciones proteína-proteína con alta especificidad y afinidad.. Los miembros fundadores de la familia, también los mejor caracterizados por su estructura, son las toxinas de tres dedos que se encuentran en el veneno de serpiente , que tienen una variedad de efectos farmacológicos , más típicamente por la interrupción de la señalización colinérgica . La familia también está representada en proteínas no tóxicas, que tienen una amplia distribución taxonómica ; Los dominios 3FP se encuentran en los dominios extracelulares de algunos receptores de la superficie celular , así como en las proteínas globulares secretadas y ancladas a GPI , generalmente involucradas en la señalización. [2] [3] [4] [5]
Los miembros fundadores de la familia 3FP son las toxinas de los tres dedos (3FTx) que a menudo se encuentran en el veneno de serpientes . Las proteínas 3FTx se distribuyen ampliamente en las familias de serpientes venenosas, pero están particularmente enriquecidas en la familia Elapidae , en la que la proporción relativa de 3FTx con respecto a otras toxinas venenosas puede alcanzar el 95%. [4] [6] Muchas proteínas 3FTx son neurotoxinas , aunque el mecanismo de toxicidad varía significativamente incluso entre proteínas de identidad de secuencia relativamente alta ; Los objetivos comunes de las proteínas incluyen aquellos involucrados en la señalización colinérgica , como los receptores nicotínicos de acetilcolina ,receptores muscarínicos de acetilcolina y acetilcolinesterasa . Otra gran subfamilia de proteínas 3FTx son las cardiotoxinas (también conocidas como citotoxinas o citolisinas); este grupo es directamente citotóxico muy probablemente debido a interacciones con fosfolípidos y posiblemente con otros componentes de la membrana celular . [2]
La familia Ly6 / uPAR describe ampliamente una familia de genes que contiene dominios proteicos de tres dedos que no son tóxicos y no son componentes de veneno; estos a menudo se conocen como dominios LU y se pueden encontrar en los dominios extracelulares de los receptores de la superficie celular y en proteínas globulares ancladas a GPI o secretadas . [4] [8] La familia lleva el nombre de dos grupos representativos de miembros, la familia del antígeno de linfocitos de proteínas globulares pequeñas 6 (LY6) y el receptor del activador del plasminógeno de uroquinasa (uPAR). [9]Otros receptores con dominios LU incluyen miembros de la superfamilia del receptor beta del factor de crecimiento transformante (TGF-beta), como el receptor de activina tipo 2 ; [10] y receptor de proteína morfogenética ósea, tipo IA . [11] Otras proteínas del dominio LU son proteínas globulares pequeñas como el antígeno CD59 , LYNX1 , SLURP1 y SLURP2 . [4] [12]
Muchas proteínas que contienen el dominio LU están implicadas en la señalización colinérgica y se unen a los receptores de acetilcolina , vinculando notablemente su función a un mecanismo común de toxicidad 3FTx. [4] [8] [13] Se cree que los miembros de la familia Ly6 / uPAR son los ancestros evolutivos de las toxinas 3FTx. [14] Otras proteínas LU, como el antígeno CD59 , tienen funciones bien estudiadas en la regulación del sistema inmunológico . [13]
Las toxinas de serpientes de tres dedos y los miembros de la familia Ly6 / uPAR comparten una estructura genética común , que generalmente consta de dos intrones y tres exones . La secuencia del primer exón generalmente está bien conservada en comparación con los otros dos. [4] El tercer exón contiene las principales características diferenciadoras entre los dos grupos, ya que aquí es donde se codifica el péptido de anclaje GPI C-terminal común entre las proteínas globulares Ly6 / uPAR. [4] [13]
Las proteínas del pliegue general de tres dedos se distribuyen ampliamente entre los metazoos . [4] Un estudio bioinformático de 2008 identificó alrededor de 45 ejemplos de tales proteínas, que contienen hasta tres dominios de tres dedos, representados en el genoma humano . [12] Un perfil más reciente de la familia de genes Ly6 / uPAR identificó 35 miembros de la familia de seres humanos y al menos 61 de ratones en los genomas respectivos de los organismos. [8]