ClpS es un N-reconocimiento en la vía de la regla N-end. [1] ClpS interactúa con sustratos de proteínas que tienen un residuo hidrófobo voluminoso (leucina, fenilalanina, tirosina y triptófano) en el extremo N-terminal. El sustrato proteico es luego degradado por la proteasa ClpAP. [2] [3]
ClpS | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identificadores | ||||||||
Símbolo | ClpS | |||||||
Pfam | PF02617 | |||||||
InterPro | IPR003769 | |||||||
SCOP2 | 1mbx / SCOPe / SUPFAM | |||||||
|
En biología molecular, la proteína adaptadora de proteasa Clp dependiente de ATP ClpS es una proteína bacteriana . En el citosol bacteriano , la degradación de la proteína dependiente de ATP se lleva a cabo mediante varios pares de chaperona - proteasa diferentes , incluido ClpAP. ClpS influye directamente en la máquina ClpAP uniéndose al dominio N-terminal del chaperón ClpA. La degradación de los sustratos de ClpAP, tanto las proteínas marcadas con SsrA como la propia ClpA, es inhibida específicamente por ClpS. ClpS modifica el sustrato de ClpA especificidad, potencialmente redireccionando la degradación por ClpAP hacia proteínas agregadas . [4]
ClpS es una pequeña proteína alfa / beta que consta de tres hélices alfa conectadas a tres hebras beta antiparalelas . [5] La proteína tiene una forma globular, con una capa curva de tres hélices alfa antiparalelas sobre una hoja beta antiparalela retorcida . La dimerización de ClpS puede ocurrir a través de su dominio N-terminal. Esta región N-terminal corta y extendida en ClpS es seguida por la hebra beta central de siete residuos, que está flanqueada por otras dos hebras beta en una pequeña hoja beta.
Ver también
Referencias
- ^ Varshavsky A (agosto de 2011). "La vía de la regla del extremo N y la regulación por proteólisis" . Ciencia de las proteínas . 20 (8): 1298–345. doi : 10.1002 / pro.666 . PMC 3189519 . PMID 21633985 .
- ^ Tasaki T, Sriram SM, Park KS, Kwon YT (10 de abril de 2012). "La vía de la regla N-end" . Revisión anual de bioquímica . 81 : 261–89. doi : 10.1146 / annurev-biochem-051710-093308 . PMC 3610525 . PMID 22524314 .
- ^ Erbse A, Schmidt R, Bornemann T, Schneider-Mergener J, Mogk A, Zahn R, et al. (Febrero de 2006). "ClpS es un componente esencial de la vía de la regla N-end en Escherichia coli". Naturaleza . 439 (7077): 753–6. Código Bibliográfico : 2006Natur.439..753E . doi : 10.1038 / nature04412 . PMID 16467841 . S2CID 4406838 .
- ^ Dougan DA, Reid BG, Horwich AL, Bukau B (marzo de 2002). "ClpS, un modulador de sustrato de la máquina ClpAP" . Célula molecular . 9 (3): 673–83. doi : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00485-9 . PMID 11931773 .
- ^ Zeth K, Ravelli RB, Paal K, Cusack S, Bukau B, Dougan DA (diciembre de 2002). "Análisis estructural de la proteína adaptadora ClpS en complejo con el dominio N-terminal de ClpA". Biología estructural de la naturaleza . 9 (12): 906-11. doi : 10.1038 / nsb869 . PMID 12426582 . S2CID 28459237 .