Los genomas de adenovirus son moléculas de ADN de doble hebra (ds) lineales no segmentadas que suelen tener una longitud de 26 a 46 Kbp y que contienen 23 a 46 genes que codifican proteínas . [1] El ejemplo utilizado para la siguiente descripción es el adenovirus E humano, un mastadenovirus con un genoma de 36 Kbp que contiene 38 genes que codifican proteínas. [2] Si bien el número exacto y la identidad de los genes varía entre los adenovirus, los principios básicos de la organización del genoma y las funciones de la mayoría de los genes descritos en este artículo se comparten entre todos los adenovirus.
Unidades de transcripción
Los 38 genes del genoma del adenovirus E humano están organizados en 17 unidades de transcripción , cada una de las cuales contiene 1-8 secuencias codificantes. [3] El empalme alternativo durante el procesamiento de los pre-mRNA producidos por cada unidad de transcripción permite que se produzcan múltiples mRNA diferentes a partir de una unidad de transcripción.
Las unidades de transcripción E1A, E1B, E2A, E2B, E3 y E4 se transcriben sucesivamente al principio del ciclo reproductivo viral . Las proteínas codificadas por genes dentro de estas unidades de transcripción están involucradas principalmente en la regulación de la transcripción viral, en la replicación del ADN viral y en la supresión de la respuesta del huésped a la infección. [4]
Las unidades de transcripción L1-L5 se transcriben más tarde en el ciclo reproductivo viral y codifican principalmente proteínas que forman componentes de la cápside viral o están involucradas en el ensamblaje de la cápside. Las unidades de transcripción L1-L5 están todas reguladas por la misma región promotora y comparten el mismo sitio de inicio de la transcripción. Como resultado, la transcripción de las cinco unidades de transcripción tardía comienza en el mismo punto del ciclo reproductivo viral. [5]
La transcripción de pre-ARNm que comienza en el promotor tardío se termina aleatoriamente en uno de los cinco sitios de terminación, produciendo una población de transcripciones de cinco longitudes diferentes. Los pre-ARNm de cualquier longitud dada se empalman entonces alternativamente para producir 1-4 ARNm diferentes que codifican un número correspondiente de proteínas.
Genes que codifican proteínas
En la siguiente tabla se dan los nombres, ubicaciones y propiedades de los 38 genes que codifican proteínas en el genoma del adenovirus E humano. [6] [7]
Nombre de la proteína | Identificador de proteína | Unidad de transcripción | Base de inicio | Base de parada | Hebra | Longitud (aminoácidos) |
---|---|---|---|---|---|---|
proteína de control E1A | YP_068018.1 | E1A | 576 | 1441 | + | 257 |
proteína de control E1B 19K | YP_068019.1 | E1B | 1600 | 2115 | + | 171 |
proteína de control E1B 55K | YP_068020.1 | E1B | 1905 | 3356 | + | 483 |
proteína de la cápside IX | YP_068021.1 | IX | 3441 | 3869 | + | 142 |
proteína de encapsidación IVa2 | YP_068022.1 | IVa2 | 3930 | 5554 | - | 448 |
ADN polimerasa | YP_068023.1 | E2B | 5033 | 13773 | - | 1193 |
proteína 13.6K | YP_001661328.1 | L1 | 7814 | 9476 | + | 139 |
precursor de proteína terminal pTP | YP_068024.1 | E2B | 8404 | 13773 | - | 642 |
proteína de encapsidación 52K | YP_068025.1 | L1 | 10765 | 11937 | + | 390 |
precursor de la proteína de la cápside pIIIa | YP_068026.1 | L1 | 11961 | 13736 | + | 591 |
base de pentona (proteína de la cápside III) | YP_068027.1 | L2 | 13815 | 15422 | + | 535 |
precursor de la proteína central pVII | YP_068028.1 | L2 | 15426 | 16007 | + | 193 |
proteína central V | YP_068029.1 | L2 | 16055 | 17080 | + | 341 |
precursor de proteína central pX | YP_068030.1 | L2 | 17103 | 17336 | + | 77 |
precursor de la proteína de la cápside pVI | YP_068031.1 | L3 | 17413 | 18141 | + | 242 |
hexon (proteína de la cápside II) | YP_068032.1 | L3 | 18248 | 21058 | + | 936 |
proteasa | YP_068033.1 | L3 | 21082 | 21702 | + | 206 |
proteína de unión a ADN monocatenario | YP_068034.1 | E2A-L | 21774 | 23312 | - | 512 |
proteína de ensamblaje hexon 100K | YP_068035.1 | L4 | 23341 | 25716 | + | 791 |
proteína 33K | YP_068036.1 | L4 | 25439 | 26252 | + | 214 |
proteína de encapsidación 22K | YP_068037.1 | L4 | 25439 | 25978 | + | 179 |
precursor de la proteína de la cápside pVIII | YP_068038.1 | L4 | 26321 | 27004 | + | 227 |
proteína de control E3 12.5K | YP_068039.1 | E3 | 27005 | 27325 | + | 106 |
glucoproteína de membrana E3 CR1-alfa | YP_068040.1 | E3 | 27279 | 27911 | + | 210 |
glicoproteína de membrana E3 gp19K | YP_068041.1 | E3 | 27893 | 28417 | + | 174 |
glicoproteína de membrana E3 CR1-beta | YP_068042.1 | E3 | 28449 | 29111 | + | 220 |
glucoproteína de membrana E3 CR1-delta | YP_068043.1 | E3 | 29440 | 30264 | + | 274 |
proteína de membrana E3 RID-alfa | YP_068044.1 | E3 | 30273 | 30548 | + | 91 |
proteína de membrana E3 RID-beta | YP_068045.1 | E3 | 30554 | 30994 | + | 146 |
proteína de control E3 14.7K | YP_068046.1 | E3 | 30987 | 31388 | + | 133 |
proteína U | YP_068047.1 | U | 31481 | 31632 | - | 50 |
fibra (proteína de la cápside IV) | YP_068048.1 | L5 | 31649 | 32926 | + | 425 |
proteína de control E4orf6 / 7 | YP_068049.1 | E4 | 33022 | 34169 | - | 141 |
proteína de control E4 34K | YP_068050.1 | E4 | 33270 | 34169 | - | 299 |
proteína de control E4orf4 | YP_068051.1 | E4 | 34072 | 34440 | - | 122 |
proteína de control E4orf3 | YP_068052.1 | E4 | 34449 | 34802 | - | 117 |
proteína de control E4orf2 | YP_068053.1 | E4 | 34799 | 35188 | - | 129 |
proteína de control E4orf1 | YP_068054.1 | E4 | 35236 | 35610 | - | 124 |
Se conocen las funciones de muchas proteínas de adenovirus: [5]
- Las proteínas estructurales incluyen proteínas de la cápside II ( hexón ), III (base de pentona), IIIa, IV (fibra), VI, VIII y IX; y las proteínas centrales V, VII, X y la proteína terminal TP.
- Las proteínas de encapsidación IVa2, 52K y L1, y la proteína de ensamblaje de hexones 100K están involucradas en el ensamblaje de las cápsides virales.
- La proteasa L3 escinde las proteínas precursoras virales pTP, pVI, pVII, pVIII y IIIa para producir las proteínas virales maduras.
- La proteína de control E1A activa la transcripción de varios genes virales, así como genes de la célula huésped.
- La proteína de control E1B 19K suprime la apoptosis imitando la acción de la proteína celular Bcl-2.
- La proteína de control E1B 55K se une e inactiva el regulador transcripcional p53, bloqueando así la transcripción de genes normalmente activados por p53 y contribuyendo a la supresión de la apoptosis.
- Las tres proteínas codificadas por las unidades de transcripción E2A y E2B están involucradas en la replicación del ADN viral. La replicación del ADN del adenovirus comienza en cada extremo del ADN viral, utilizando la proteína TP (en lugar del ARN) como cebador, por lo que la ADN polimerasa viral replica todas las bases del genoma.
- La proteína de membrana E3 RID-alfa y la proteína de membrana E3 RID-beta realizan una variedad de funciones moleculares que contribuyen a inhibir la apoptosis. [8]
- La glucoproteína de membrana beta CR1 modula la respuesta inmune del huésped. [9]
- La glicoproteína de membrana E3 gp19K inhibe la inserción de proteínas MHC de clase I en la membrana de la célula huésped, evitando así que los linfocitos de células T reconozcan que la célula huésped ha sido infectada por un virus. [10]
- La proteína de control E3 14.7K protege al virus de las respuestas antivirales del huésped. [11]
- Las proteínas de control de la unidad de transcripción E4 participan en la regulación de la transcripción del ADN viral. [12]
Referencias
- ^ "Virus - genomas completos" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ "Genoma humano del adenovirus E" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ "Descripción general del adenovirus E humano" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ "Adenovirus" . MicrobiologyBytes. Archivado desde el original el 20 de abril de 2013 . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ a b Branton, Philip; Marcelo, Richard C. (2011). "23". En Nicholas H. Acheson (ed.). Adenovirus . Fundamentos de virología molecular (2 ed.). John Wiley & Sons, Inc.
- ^ "Detalles de proteínas para el adenovirus E humano" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ Russell, WC (enero de 2009). "Adenovirus: actualización sobre estructura y función" . Revista de Virología General . 90 (Parte 1): 1–20. doi : 10.1099 / vir.0.003087-0 . PMID 19088268 . Archivado desde el original el 31 de octubre de 2014 . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ "PHA3612: proteína alfa de internalización y degradación del receptor" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ "PHA3620: glucoproteína de membrana beta CR1" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ "PHA3615: proteína E3 gp19K" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ "PHA3613: proteína E3 14.7K" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
- ^ "PHA3605: proteína de control E4orf4" . NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .