Matemáticas aplicadas

Matemáticas aplicadas

Industria	Bioinformática , Biotecnología
Fundado	1992 ( 1992 )
Sede	Sint-Martens-Latem , Bélgica
Productos	BIONUMERICS, GelCompar II, servidor BIONUMERICS
Sitio web	www .applied-maths .com

Applied Maths NV, una empresa de bioMérieux con sede en Sint-Martens-Latem , Bélgica , es una empresa de bioinformática que desarrolla software para las biociencias.

Historia

Applied Maths fue fundada en 1992 y ganó reconocimiento mundial con el software GelCompar, utilizado como herramienta estándar para la normalización y análisis comparativo de patrones de electroforesis ( PFGE , AFLP , RAPD , REP-PCR y variantes, etc.). ^[1]^[2]

GelCompar II se lanzó en 1998 para hacer frente a la creciente cantidad de información tras el éxito y la expansión de la electroforesis y otras técnicas de toma de huellas dactilares en varios campos de aplicación en microbiología , virología y micología . Tras la introducción de los conceptos de taxonomía polifásica ^[3] y la creciente necesidad de combinar información genotípica , fenotípica , electroforesis y secuencial, Applied Maths lanzó en 1996 el paquete de software BIONUMERICS que todavía hoy es una plataforma para la gestión, almacenamiento y (estadística ) análisis de todo tipo de datos biológicos. ^[4]BIONUMERICS y GelCompar II son utilizados por varias redes en todo el mundo, como PulseNet y CaliciNet, para compartir e identificar información sobre cepas. ^[5]^[6]

En enero de 2016, Applied Maths fue adquirida por bioMérieux . ^[7]

Productos

BIONUMERICS : BIONUMERICS es un conjunto comercial de 4 configuraciones utilizadas para el análisis de todas las aplicaciones principales en bioinformática: geles de electroforesis 1D ,perfiles cromatográficos y espectrométricos ,caracteres fenotípicos , microarrays , secuencias , etc.

GelCompar II : GelCompar II es un conjunto de 5 módulos desarrollados para el análisis de patrones de huellas dactilares, que abarcan la normalización, la importación a una base de datos relacional y el análisis comparativo.

BNServer : BNserver es la plataforma basada en web que generalmente se instala entre una base de datos mantenida de forma centralizada y clientes distribuidos que utilizan BIONUMERICS, GelCompar II o un navegador web para intercambiar información biológica y resultados de análisis. BNServer se ha utilizado desde los años noventa en la detección de brotes alimentarios. ^[8]

Recepción

Más de 15000 artículos de investigación revisados por pares mencionan el uso de los paquetes de software Applied Maths BIONUMERICS o Gelcompar II. ^[9]

Referencias

^ Dijkshoorn L., Towner KJ, Struelens M., 2001. Nuevos enfoques para la generación y análisis de datos de tipificación microbiana. Elsevier, ISBN 0-444-50740-X , ISBN 978-0-444-50740-2 .
^ Vauterin L. y P. Vauterin. 1992. Comparación objetiva asistida por computadora de patrones de electroforesis para agrupación e identificación de microorganismos. EUR. Microbiol. 1: 37-41.
^ [1] Vandamme et al., Taxonomía polifásica, un enfoque de consenso para la sistemática bacteriana. Microbiol. Mol. Biol. Rev. Junio de 1996 vol. 60 no. 2 407-438.
^ Vauterin L, Vauterin P. Análisis y base de datos integrados. En: Identificación molecular, sistemática y estructura poblacional de procariotas (ed. Erko Stackebrandt). Springer, 2006. ISBN 978-3-540-23155-4
^ Hunter SB, Vauterin P, Lambert-Fair MA, Van Duyne MS, Kubota K, Graves L, Wrigley D, Barrett T, Ribot E (2005). "Establecimiento de una cepa estándar de tamaño universal para su uso con los protocolos de electroforesis en gel de campo pulsado estandarizados de PulseNet: conversión de las bases de datos nacionales al nuevo estándar de tamaño" . J. Clin. Microbiol . 43 (3): 1045–1050. doi : 10.1128 / JCM.43.3.1045-1050.2005 . PMC 1081233 . PMID 15750058 .
^ Vega E .; Barclay L .; Gregoricus N .; Williams K .; Lee D .; Vinjé J. (2011). "Red de vigilancia novedosa para brotes de gastroenteritis por norovirus, Estados Unidos" . Emerg Infect Dis . 17 (8): 1389–95. doi : 10.3201 / eid1708.101837 . PMC 3381557 . PMID 21801614 .
^ bioMérieux adquiere Applied Maths y mejora sus capacidades bioinformáticas con experiencia y soluciones de vanguardia para el uso inteligente de datos biológicos complejos
^ Swaminathan B, Gerner-Smidt P, Ng LK, Lukinmaa S, Kam KM, Rolando S, Gutiérrez EP, Binsztein N., 2006. "Building PulseNet International : un sistema interconectado de redes de laboratorio para facilitar el reconocimiento y la respuesta oportuna de la salud pública a Brotes de enfermedades transmitidas por alimentos y enfermedades emergentes de transmisión alimentaria ". Patógenos y enfermedades transmitidos por los alimentos. Primavera de 2006, 3 (1): 36-50. doi : 10.1089 / fpd.2006.3.36
^ Artículos científicos que utilizan productos de software Applied Maths obtenidos el 20 de junio de 2014

enlaces externos

Página web oficial

[1] Dijkshoorn L., Towner KJ, Struelens M., 2001. Nuevos enfoques para la generación y análisis de datos de tipificación microbiana. Elsevier, ISBN 0-444-50740-X , ISBN 978-0-444-50740-2 .

[2] Vauterin L. y P. Vauterin. 1992. Comparación objetiva asistida por computadora de patrones de electroforesis para agrupación e identificación de microorganismos. EUR. Microbiol. 1: 37-41.

[3] [1] Vandamme et al., Taxonomía polifásica, un enfoque de consenso para la sistemática bacteriana. Microbiol. Mol. Biol. Rev. Junio de 1996 vol. 60 no. 2 407-438.

[4] Vauterin L, Vauterin P. Análisis y base de datos integrados. En: Identificación molecular, sistemática y estructura poblacional de procariotas (ed. Erko Stackebrandt). Springer, 2006. ISBN 978-3-540-23155-4

[5] Hunter SB, Vauterin P, Lambert-Fair MA, Van Duyne MS, Kubota K, Graves L, Wrigley D, Barrett T, Ribot E (2005). "Establecimiento de una cepa estándar de tamaño universal para su uso con los protocolos de electroforesis en gel de campo pulsado estandarizados de PulseNet: conversión de las bases de datos nacionales al nuevo estándar de tamaño" . J. Clin. Microbiol . 43 (3): 1045–1050. doi : 10.1128 / JCM.43.3.1045-1050.2005 . PMC 1081233 . PMID 15750058 .

[6] Vega E .; Barclay L .; Gregoricus N .; Williams K .; Lee D .; Vinjé J. (2011). "Red de vigilancia novedosa para brotes de gastroenteritis por norovirus, Estados Unidos" . Emerg Infect Dis . 17 (8): 1389–95. doi : 10.3201 / eid1708.101837 . PMC 3381557 . PMID 21801614 .

[7] Mérieux adquiere Applied Maths y mejora sus capacidades bioinformáticas con experiencia y soluciones de vanguardia para el uso inteligente de datos biológicos complejos

[8] Swaminathan B, Gerner-Smidt P, Ng LK, Lukinmaa S, Kam KM, Rolando S, Gutiérrez EP, Binsztein N., 2006. "Building PulseNet International : un sistema interconectado de redes de laboratorio para facilitar el reconocimiento y la respuesta oportuna de la salud pública a Brotes de enfermedades transmitidas por alimentos y enfermedades emergentes de transmisión alimentaria ". Patógenos y enfermedades transmitidos por los alimentos. Primavera de 2006, 3 (1): 36-50. doi : 10.1089 / fpd.2006.3.36

[9] Artículos científicos que utilizan productos de software Applied Maths obtenidos el 20 de junio de 2014

[1]