Una repetición de armadillo es el nombre de una secuencia de aminoácidos repetitiva característica de aproximadamente 40 residuos de longitud que se encuentra en muchas proteínas. Las proteínas que contienen repeticiones de armadillo suelen contener varias copias repetidas en tándem . [2] [3] Cada repetición de armadillo se compone de un par de hélices alfa que forman una estructura de horquilla. Múltiples copias de la repetición forman lo que se conoce como estructura de solenoide alfa .
Dominio de repetición de armadillo | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | Brazo | |||||||
Pfam | PF00514 | |||||||
Clan pfam | CL0020 | |||||||
InterPro | IPR000225 | |||||||
INTELIGENTE | SM00185 | |||||||
PROSITE | PS50176 | |||||||
SCOP2 | 3bct / SCOPe / SUPFAM | |||||||
CDD | cd00020 | |||||||
Membranome | 350 | |||||||
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Ejemplos de proteínas que contienen repeticiones de armadillo incluyen β-catenina , α-importina , [4] placoglobina , [5] poliposis coli adenomatosa (APC), [6] y muchas otras.
El término armadillo deriva del nombre histórico del gen de la β-catenina en la mosca de la fruta Drosophila, donde se descubrió por primera vez la repetición del armadillo. Aunque anteriormente se creía que la β-catenina era una proteína involucrada en la unión de las proteínas de adhesión celular de cadherina al citoesqueleto , trabajos recientes indican que la β-catenina regula la homodimerización de la alfa-catenina, que a su vez controla la ramificación y agrupamiento de actina . [7] Pero la repetición del armadillo se encuentra en una amplia gama de proteínas con otras funciones. Este tipo de dominio proteico es importante en la transducción de señales de WNT durante el desarrollo embrionario .
Estructura
El pliegue tridimensional de una repetición de armadillo se observó por primera vez en la estructura cristalina de la beta-catenina, donde las 12 repeticiones en tándem forman una superhélice de hélices alfa con tres hélices por unidad. [1] La estructura cilíndrica presenta un surco cargado positivamente, que presumiblemente interactúa con las superficies ácidas de los socios de interacción conocidos de la beta-catenina. [8]
Referencias
- ^ a b Huber AH, Nelson WJ, Weis WI (septiembre de 1997). "Estructura tridimensional de la región de repetición de armadillo de beta-catenina" . Celular . 90 (5): 871–82. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 80352-9 . PMID 9298899 . S2CID 18612343 .
- ^ Peifer M, Berg S, Reynolds AB (1994). "Un motivo de aminoácidos repetido compartido por proteínas con diversas funciones celulares". Celular . 76 (5): 789–91. doi : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90353-0 . PMID 7907279 . S2CID 26528190 .
- ^ Groves MR, Barford D (1999). "Características topológicas de las proteínas de repetición helicoidal". Opinión actual en biología estructural . 9 (3): 383–9. doi : 10.1016 / S0959-440X (99) 80052-9 . PMID 10361086 .
- ^ Herold A, Truant R, Wiegand H, Cullen BR (octubre de 1998). "Determinación de la organización del dominio funcional del factor de importación nuclear alfa importin" . J. Cell Biol . 143 (2): 309-18. doi : 10.1083 / jcb.143.2.309 . PMC 2132842 . PMID 9786944 .
- ^ McCrea PD, Turck CW, Gumbiner B (noviembre de 1991). "Un homólogo de la proteína armadillo en Drosophila (plakoglobin) asociado con E-cadherin". Ciencia . 254 (5036): 1359–61. Código Bibliográfico : 1991Sci ... 254.1359M . doi : 10.1126 / science.1962194 . PMID 1962194 .
- ^ Hirschl D, Bayer P, Müller O (marzo de 1996). "Estructura secundaria de una sola repetición de armadillo de la proteína APC" . FEBS Lett . 383 (1–2): 31–6. doi : 10.1016 / 0014-5793 (96) 00215-3 . PMID 8612785 . S2CID 36190869 .
- ^ Nusse, Roel y Hans Clevers. "Señalización de Wnt / β-catenina, enfermedad y modalidades terapéuticas emergentes". Cell, vol. 169, no. 6, 1 de junio de 2017, págs. 985–999., Doi: 10.1016 / j.cell.2017.05.016.
- ^ "Armadillo (IPR000225)" . InterPro . EMBL-EBI.
enlaces externos
- Clase de motivo de recurso de motivo lineal eucariota TRG_NLS_Bipartite_1
- Motivo lineal eucariota clase de motivo de recurso TRG_NLS_MonoCore_2
- Motivo lineal eucariota clase de motivo de recurso TRG_NLS_MonoExtC_3
- Motivo lineal eucariota clase de motivo de recurso TRG_NLS_MonoExtN_4
- Armadillo + Dominio + Proteínas en la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU. Encabezamientos de temas médicos (MeSH)
- Armadillo / plakoglobin ARM repetir en PROSITE