B elemento de reconocimiento
El elemento de reconocimiento B ( BRE ) es una secuencia de ADN que se encuentra en la región promotora de la mayoría de los genes [ aclaración necesaria ] en eucariotas y arqueas . [1] [2] El BRE es un elemento regulador cis que se encuentra inmediatamente cerca de la caja TATA y consta de 7 nucleótidos . Hay dos conjuntos de BRE: uno (BREu) que se encuentra inmediatamente aguas arriba de la caja TATA, con el consenso SSRCGCC; el otro (BREd) encontró alrededor de 7 nucleótidos corriente abajo, con el consenso RTDKKKK. [a] [3] [4]
El BREu fue descubierto en 1998 por Richard Ebright y sus colaboradores. [1] El BREd fue nombrado en 2005 por Deng y Roberts; [5] Este reconocimiento aguas abajo se informó a principios de 2000 en la estructura cristalina de Tsai y Sigler. [6]
El factor de transcripción II B (TFIIB) reconoce BRE y se une a él. Ambos BRE funcionan junto con la caja TATA (y la proteína de unión a la caja TATA ) y tienen varios efectos sobre los niveles de transcripción. [4]
TFIIB utiliza repeticiones similares a ciclina para reconocer el ADN. Las hélices alfa C-terminales de TFIIB se intercalan con el surco principal del ADN en el BREu. Las hélices N-terminales se unen al surco menor en BREd. TFIIB es una parte del complejo de preiniciación que ayuda a que la ARN polimerasa II se una al ADN. [6]
Además de la estructura de TFIIB-BRE humana, se han resuelto estructuras de muchos otros organismos. Entre ellos se encuentran el factor de transcripción B (TFB) del archaeon Pyrococcus woesei que presenta una orientación invertida [7] y un TFIIB del parásito Trypanosoma brucei que a pesar de algunas inserciones específicas muestran un pliegue similar. [8]
