La proteína receptora de AMPc ( CRP ; también conocida como proteína activadora de catabolitos , CAP ) es una proteína reguladora en las bacterias . La proteína CRP se une al cAMP , lo que provoca un cambio conformacional que permite que CRP se una estrechamente a un sitio de ADN específico en los promotores de los genes que controla. [1] [2] La CRP activa la transcripción a través de interacciones directas proteína-proteína con la ARN polimerasa . [1] [2]
Proteína del receptor CAMP | ||||||
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Identificadores | ||||||
Símbolo | CRP | |||||
Alt. simbolos | GORRA | |||||
Gen NCBI | 947867 | |||||
PDB | 1I5Z | |||||
RefSeq | NP_417816.1 | |||||
UniProt | P0ACJ8 | |||||
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Los genes regulados por la PCR están involucrados principalmente en el metabolismo energético, como la galactosa , el citrato o el sistema de translocación del grupo PEP . [3] [4] En Escherichia coli , la proteína receptora de AMP cíclica (CRP) puede regular la transcripción de más de 100 genes.
La señal para activar la CRP es la unión de AMP cíclico. La unión de AMPc a CRP conduce a una transducción de señales a larga distancia desde el dominio de unión de AMPc N-terminal al dominio C-terminal de la proteína, que es responsable de la interacción con secuencias específicas de ADN. [5]
En los promotores dependientes de CRP "Clase I", CRP se une a un sitio de ADN ubicado corriente arriba de los elementos promotores centrales y activa la transcripción a través de interacciones proteína-proteína entre la "región de activación 1" de CRP y el dominio C-terminal de la subunidad alfa de la ARN polimerasa . [1] [2] [6] En los promotores dependientes de CRP "Clase II", CRP se une a un sitio de ADN que se superpone al elemento promotor -35 y activa la transcripción a través de dos conjuntos de interacciones proteína-proteína: (1) una interacción entre "región de activación 1" de CRP y el dominio C-terminal de la subunidad alfa de la ARN polimerasa , y (2) una interacción entre la "región de activación 2" de CRP y el dominio N-terminal de la subunidad alfa de la ARN polimerasa . [1] [2] En los promotores dependientes de CRP "Clase III", CRP funciona junto con una o más proteínas " coactivadoras ". [1] [2]
En la mayoría de los promotores dependientes de CRP, CRP activa la transcripción principal o exclusivamente a través de un mecanismo de "reclutamiento", en el que las interacciones proteína-proteína entre CRP y la ARN polimerasa ayudan a la unión de la ARN polimerasa al promotor. [1]
Referencias
- ^ a b c d e f Busby S., Ebright RH. (1999). "Activación de la transcripción por proteína activadora de catabolitos (CAP)". J. Mol. Biol . 293 (2): 199–213. doi : 10.1006 / jmbi.1999.3161 . PMID 10550204 .
- ^ a b c d e Lawson CL, Swigon D, Murakami KS, Darst SA, Berman HM, Ebright RH (2004). "Proteína activadora de catabolitos: activación de la transcripción y unión al ADN" . Curr. Opin. Struct. Biol . 14 (1): 10-20. doi : 10.1016 / j.sbi.2004.01.012 . PMC 2765107 . PMID 15102444 .
- ^ Weickert MJ, Adhya S (1993). "El regulón de galactosa de Escherichia coli" (PDF) . Mol. Microbiol . 10 (2): 245–51. doi : 10.1111 / j.1365-2958.1993.tb01950.x . PMID 7934815 .
- ^ Bott M. (1997). "Metabolismo anaeróbico del citrato y su regulación en enterobacterias". Arco. Microbiol . 167 (2–3): 78–88. doi : 10.1007 / s002030050419 . PMID 9133329 .
- ^ Popovych, N .; Tzeng, S. -R .; Tonelli, M .; Ebright, RH; Kalodimos, CG (2009). "Base estructural para el control alostérico mediado por AMPc de la proteína activadora del catabolito" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 106 (17): 6927–6932. doi : 10.1073 / pnas.0900595106 . PMC 2678429 . PMID 19359484 .
- ^ Hudson, BP; Quispe, J .; Lara-González, S .; Kim, Y .; Berman, HM; Arnold, E .; Ebright, RH; Lawson, CL (2009). "Estructura tridimensional de EM de un complejo de iniciación de la transcripción dependiente del activador intacto" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 106 (47): 19830–19835. doi : 10.1073 / pnas.0908782106 . PMC 2775702 . PMID 19903881 .