Christophe Dessimoz es profesor de la Fundación Nacional de Ciencias de Suiza (SNSF) en la Universidad de Lausana , profesor asociado en el University College de Londres y líder de grupo en el Instituto Suizo de Bioinformática . [5] [3] [6] [7] [8] Fue galardonado con el Premio Overton en 2019 por sus contribuciones a la biología computacional . [2]
Christophe Dessimoz | |
---|---|
Nació | Christophe Dessimoz 1980 (40 a 41 años) |
alma mater | ETH Zúrich (MSc, PhD) |
Conocido por | Matriz ortóloga (OMA) [1] |
Premios | Premio Overton (2019) [2] |
Carrera científica | |
Campos | Bioinformática Genómica Filogenética Evolución Biología Computacional [3] |
Instituciones | Universidad de Lausana Instituto Europeo de Bioinformática University College London Instituto Suizo de Bioinformática |
Tesis | Genómica comparada usando distancias evolutivas por pares (2009) |
Asesor de doctorado | Gaston Gonnet [4] |
Sitio web | lab |
Educación
Dessimoz obtuvo su Maestría en Ciencias grado en 2003 [5] y de doctorado en Ciencias de la Computación en 2009 de ETH Zurich en Suiza [9] donde su investigación doctoral fue supervisada por Gaston Gonnet [4] y examinado por Amos Bairoch . [9]
Carrera e investigación
Después de una investigación postdoctoral en el Instituto Europeo de Bioinformática (EBI) en el Wellcome Genome Campus en Hinxton , Cambridgeshire , [10] se unió a University College London (UCL) como profesor en 2013 y fue ascendido a Lector en 2015. [5] En 2015 , se incorporó a la Universidad de Lausana como profesor, conservando un puesto en la UCL. [11] Desde 2016, Dessimoz se ha desempeñado como líder de grupo en el Instituto Suizo de Bioinformática [5], donde sus intereses de investigación se encuentran en bioinformática , genómica , filogenética , evolución y biología computacional . [3] [12] [13] [14] [15]
Dessimoz es conocido por su manejo de la matriz ortóloga (OMA) [1] que proporciona información sobre proteínas ortólogas . OMA tiene aplicaciones importantes en la predicción de la función de las proteínas . [2] El enfoque de Dessimoz para la evaluación comparativa tuvo un gran impacto en tres subcampos clave de la biología computacional: inferencia de ortología , alineación de secuencias y ontología genética (GO). [2] [16] [17]
Premios y honores
Dessimoz recibió el Premio Overton de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) en 2019 por sus destacadas contribuciones a la biología computacional. [2]
Referencias
- ↑ a b Altenhoff, Adrian M; Glover, Natasha M; Tren, Clément-Marie; Kaleb, Klara; Warwick Vesztrocy, Alex; Dylus, David; de Farias, Tarcisio M; Zile, Karina; Stevenson, Charles; Long, Jiao; Redestig, Henning; Gonnet, Gaston H; Dessimoz, Christophe (2018). "La base de datos de ortología OMA en 2018: recuperando relaciones evolutivas entre todos los dominios de la vida a través de interfaces web y programáticas más ricas" . Investigación de ácidos nucleicos . 46 (D1): D477 – D485. doi : 10.1093 / nar / gkx1019 . ISSN 0305-1048 . PMC 5753216 . PMID 29106550 .
- ^ a b c d e Kovats, Diane; Shamir, Ron; Fogg, Christiana (2019). "Premio ISCB Overton 2019: Christophe Dessimoz" . F1000Research . 8 : 722. doi : 10.12688 / f1000research.19220.1 . ISSN 2046-1402 . PMC 6534074 . PMID 31164977 .
- ^ a b c Publicaciones de Christophe Dessimoz indexadas por Google Scholar
- ^ a b Christophe Dessimoz en el Proyecto de genealogía de las matemáticas
- ^ a b c d Dessimoz, Christophe (2019). "Laboratorio Dessimoz" . lab.dessimoz.org .
- ^ Publicaciones de Christophe Dessimoz de Europa PubMed Central
- ^ Publicaciones de Christophe Dessimoz indexadas por labase de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
- ^ Christophe Dessimoz en Twitter
- ^ a b Dessimoz, Christophe (2009). Genómica comparada utilizando distancias evolutivas por pares . ethz.ch (tesis doctoral). ETH Zurich. doi : 10.3929 / ethz-a-005762050 . OCLC 935351416 .
- ^ Goldman, Nick; Bertone, Paul; Chen, Siyuan; Dessimoz, Christophe; LeProust, Emily M .; Sipos, Botond; Birney, Ewan (2013). "Hacia el almacenamiento de información práctico, de alta capacidad y bajo mantenimiento en ADN sintetizado" . Naturaleza . 494 (7435): 77–80. Código Bibliográfico : 2013Natur.494 ... 77G . doi : 10.1038 / nature11875 . ISSN 0028-0836 . PMC 3672958 . PMID 23354052 .
- ^ "Dr. Christophe Dessimoz" . ucl.ac.uk . Consultado el 6 de marzo de 2019 .
- ^ Wodak, Shoshana ; Sunnåker, Mikael; Busetto, Alberto Giovanni; Numminen, Elina; Corander, Jukka; Foll, Matthieu; Dessimoz, Christophe (2013). "Computación bayesiana aproximada" . PLOS Biología Computacional . 9 (1): e1002803. Código Bibliográfico : 2013PLSCB ... 9E2803S . doi : 10.1371 / journal.pcbi.1002803 . ISSN 1553-7358 . PMC 3547661 . PMID 23341757 .
- ^ Anisimova, Maria; Gil, Manuel; Dufayard, Jean-François; Dessimoz, Christophe; Gascuel, Olivier (2011). "La encuesta de métodos de soporte de rama demuestra precisión, potencia y solidez de los esquemas de aproximación basados en la probabilidad rápida" . Biología sistemática . 60 (5): 685–699. doi : 10.1093 / sysbio / syr041 . ISSN 1076-836X . PMC 3158332 . PMID 21540409 .
- ^ Eisen, Jonathan A .; Altenhoff, Adrian M .; Dessimoz, Christophe (2009). "Evaluación filogenética y funcional de proyectos y métodos de inferencia de ortólogos" . PLOS Biología Computacional . 5 (1): e1000262. Código Bibliográfico : 2009PLSCB ... 5E0262A . doi : 10.1371 / journal.pcbi.1000262 . ISSN 1553-7358 . PMC 2612752 . PMID 19148271 .
- ^ Abbosh, Christopher; Birkbak, Nicolai J .; Wilson, Gareth A .; Jamal-Hanjani, Mariam; Constantin, Tudor; Salari, Raheleh; Le Quesne, John; Moore, David A .; Veeriah, Selvaraju; Rosenthal, Rachel; Marafioti, Teresa; et al. (2017). "El análisis de ctDNA filogenético representa la evolución del cáncer de pulmón en etapa temprana" . Naturaleza . 545 (7655): 446–451. Código Bib : 2017Natur.545..446A . doi : 10.1038 / nature22364 . ISSN 0028-0836 . PMC 5812436 . PMID 28445469 .
- ^ Dessimoz, Christophe (2017). Dessimoz, Christophe; Škunca, Nives (eds.). El manual de ontología genética . Métodos en Biología Molecular. 1446 . doi : 10.1007 / 978-1-4939-3743-1 . ISBN 9781493937431. ISSN 1064-3745 . S2CID 3708801 .
- ^ Gaudet, Pascale; Škunca, Nives; Hu, James C .; Dessimoz, Christophe (2017). "Introducción a la ontología genética". El manual de ontología genética . Métodos en Biología Molecular. 1446 . págs. 25–37. doi : 10.1007 / 978-1-4939-3743-1_3 . ISBN 978-1-4939-3741-7. ISSN 1064-3745 . PMC 6377150 . PMID 27812933 .