El banco de datos de dinámica conformacional (CDDB) es una base de datos sobre la dinámica conformacional de proteínas pesadas y ensamblajes de proteínas . El CDDB es útil cuando se usa junto con datos estructurales estáticos para ayudar en la investigación de la función de las proteínas . También es útil para identificar conjuntos de proteínas que son esenciales para la función celular . [1]
Contenido | |
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Descripción | dinámica conformacional de proteínas y ensamblajes de proteínas supramoleculares. |
Contacto | |
Cita primaria | PMID 21051356 |
Fecha de lanzamiento | 2010 |
Acceso | |
Sitio web | http://www.cdyn.org |
El análisis se lleva a cabo mediante el cálculo de grano grueso de las estructuras presentes en el banco de datos de microscopía electrónica (EMDB). Este análisis muestra fluctuaciones térmicas de equilibrio y distribuciones de energía de deformación elástica , lo que permite la identificación de dominios proteicos rígidos y flexibles. Los resultados también proporcionan información sobre las correlaciones en los movimientos moleculares que se pueden utilizar para identificar regiones moleculares que están altamente acopladas dinámicamente. [1]
Referencias
- ^ a b Kim, Do-Nyun; Altschuler Josiah; Fuerte Campbell; McGill Gaël; Bathe Mark (enero de 2011). "Banco de datos de dinámica conformacional: una base de datos para la dinámica conformacional de proteínas y ensamblajes de proteínas supramoleculares" . Ácidos nucleicos Res . Inglaterra. 39 (Problema de la base de datos): D451-5. doi : 10.1093 / nar / gkq1088 . PMC 3013685 . PMID 21051356 .