DPANN es un superfilo de Archaea propuesto por primera vez en 2013. Muchos miembros muestran signos novedosos de transferencia horizontal de genes desde otros dominios de la vida. [2] Se les conoce como nanoarchaea o arqueas ultrapequeñas debido a su tamaño más pequeño (nanométrico) en comparación con otras arqueas.
DPANN | |
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Parvarchaeum acidiphilum | |
clasificación cientifica | |
Dominio: | |
Superphylum: | DPANN Rinke y col. 2013 |
Phyla [1] | |
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DPANN es un acrónimo formado por las iniciales de los primeros cinco grupos descubiertos, Diapherotrites , Parvarchaeota , Aenigmarchaeota , Nanoarchaeota y Nanohaloarchaeota . Más tarde, Woesearchaeota y Pacearchaeota fueron descubiertos y propuestos dentro del superfilo DPANN. [3] En 2017, otro filo Altiarchaeota fue colocado en este superfilo. [4] La monofilia de DPANN no se considera establecida hasta ahora, debido a la alta tasa de mutación de los filos incluidos, lo que puede conducir al artefacto de atracción de rama larga.(LBA) donde los linajes se agrupan de forma básica o articular en la base del árbol filogenético sin estar relacionados. [5] [6] Estos análisis en cambio sugieren que DPANN pertenece a Euryarchaeota o es polifilético que ocupa varias posiciones dentro de Euryarchaeota. [5] [6] [7]
El DPANN agrupa diferentes filos con una variedad de distribución ambiental y metabolismo, que van desde formas simbióticas y termofílicas como Nanoarchaeota , acidófilos como Parvarchaeota y no extremófilos como Aenigmarchaeota y Diapherotrites . También se detectó DPANN en aguas subterráneas ricas en nitratos, en la superficie del agua pero no debajo, lo que indica que estos taxones aún son bastante difíciles de localizar. [8]
Caracteristicas
Se caracterizan por ser de pequeño tamaño en comparación con otras arqueas (tamaño nanométrico) y, en consonancia con su pequeño genoma , tienen capacidades catabólicas limitadas pero suficientes para llevar una vida libre, aunque muchos son episbiontes que dependen de una asociación simbiótica o parasitaria con otros organismos. Muchas de sus características son similares o análogas a las de las bacterias ultrapequeñas (grupo CPR). [3]
Las capacidades metabólicas limitadas son un producto del genoma pequeño y se reflejan en el hecho de que muchos carecen de vías biosintéticas centrales para nucleótidos , aminoácidos y lípidos ; de ahí la mayoría de las arqueas DPANN, como las ARMAN , que dependen de otros microbios para satisfacer sus necesidades biológicas. Pero los que tienen el potencial de vivir libremente son los heterótrofos fermentativos y aeróbicos . [3]
En su mayoría son anaeróbicos que no se pueden cultivar. Viven en ambientes extremos como termófilos, hiperacidófilos, hiperhalófilos o resistentes a los metales; o también en el ambiente templado de sedimentos marinos y lacustres . Rara vez se encuentran en el suelo o en mar abierto. [3]
Clasificación
- Diaferotritas . Encontrado mediante análisis filogenético de los genomas recuperados de la filtración de aguas subterráneas de una mina de oro abandonada en Estados Unidos. [9] [10]
- Parvarchaeota y Micrarchaeota . Descubierto en 2006 en un drenaje ácido de una mina de EE. UU. [11] [12] [13] Son de tamaño muy pequeño y provisionalmente se denominan ARMAN (nanoorganismos acidófilos de la mina Archaeal Richmond).
- Woesearchaeota y Pacearchaeota . Se han identificado tanto en sedimentos como en aguas superficiales de acuíferos y lagos, abundando especialmente en condiciones salinas. [3] [14]
- Aenigmarchaeota . Se encuentra en aguas residuales de minas y en sedimentos de fuentes termales. [15]
- Nanohaloarchaeota . Distribuido en ambientes con alta salinidad. [dieciséis]
- Nanoarchaeota . Fueron los primeros descubiertos (en 2002) en una fuente hidrotermal próxima a la costa de Islandia. Viven como simbiontes de otras arqueas. [17] [18]
Filogenia
Tom A. Williams y col. 2017, [19] Castelle et al. 2015 [3] y Dombrowski et al. 2020. [20] | Jordan y col. 2017 [7] y Cavalier-Smith2020. [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DPANN puede ser el primer clado divergente de arqueas según algunos análisis filogenéticos. Los análisis filogenéticos recientes han encontrado la siguiente filogenia entre phyla. [3] [19] [20]
| Otros análisis filogenéticos han sugerido que DPANN podría pertenecer a Euryarchaeota o que incluso podría ser polifilético ocupando diferentes posiciones dentro de Euryarchaeota. También se debate si el phylum Altiarchaeota debe clasificarse en DPANN o Euryarchaeota. [20] [5] Una ubicación alternativa para DPANN en el árbol filogenético es la siguiente. [7] [6] Los grupos marcados entre comillas son linajes asignados a DPANN, pero filogenéticamente separados del resto.
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Taxonomía
Filogenia de "DPANN" [21] [22] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Super Phylum "DPANN" Rinke et al. 2013
- Phylum Altiarchaeota Probst et al. 2018 (SM1)
- Clase "Altiarchaeia" Probst et al. 2014
- Orden "Altiarchaeales" Probst et al. 2014
- Clase "Altiarchaeia" Probst et al. 2014
- Phylum "Iainarchaeota" [" Diapherotrites " Rinke et al. 2013 ] (DUSEL-3)
- Clase "Iainarchaeia" Rinke et al. 2020
- Orden "Iainarchaeales" Rinke et al. 2020
- Clase "Iainarchaeia" Rinke et al. 2020
- Phylum " Micrarchaeota " Baker & Dick 2013
- Clase "Micrarchaeia"
- Pedido "Micrarchaeales"
- Orden? Fermentimicrarchaeales Kadnikov et al. 2020
- Clase "Micrarchaeia"
- Phylum " Undinarchaeota " Dombrowski et al. 2020
- Clase "Undinarchaeia" Dombrowski et al. 2020
- Orden "Naiadarchaeales" Dombrowski et al. 2020
- Orden "Undinarchaeales" Dombrowski et al. 2020
- Clase "Undinarchaeia" Dombrowski et al. 2020
- Phylum " Aenigmatarchaeota " corrig. Rinke y col. 2013 (DSEG, DUSEL2)
- Clase "Aenigmatarchaeia" Rinke et al. 2020
- Orden "Aenigmatarchaeales" Rinke et al. 2020
- Clase "Aenigmatarchaeia" Rinke et al. 2020
- Phylum " Huberarchaeota " Probst et al. 2019
- Clase "Huberarchaeia" corrig. Probst y col. 2019
- Orden "Huberarchaeales" Rinke et al. 2020
- Clase "Huberarchaeia" corrig. Probst y col. 2019
- Phylum " Nanohaloarchaeota " Rinke et al. 2013
- ¿Clase? "Nanohalobia" La Cono et al. 2020
- Orden "Nanohalobiales" La Cono et al. 2020
- Clase? Corrig "Nanohaloarchaeia" . Narasingarao y col. 2012
- Orden "Nanohaloarchaeales"
- Clase "Nanosalinia" Rinke et al. 2020
- Orden "Nanosalinales" Rinke et al. 2020
- ¿Clase? "Nanohalobia" La Cono et al. 2020
- Phylum " Nanoarchaeota " Huber et al. 2002
- Clase "Nanoarchaeia"
- Orden " Nanoarchaeales " Huber et al. 2011
- Clase "Nanoarchaeia"
- Filo " Mamarchaeota "
- Phylum " Pacearchaeota " Castelle et al. 2015 (DHVE-5, DUSEL-1)
- Phylum " Parvarchaeota " Rinke et al. 2013 (ARMAN 4 y 5)
- Phylum " Woesearchaeota " Castelle et al. 2015 (DHVE-6)
Referencias
- ^ Castelle CJ, Banfield JF (2018). "Grandes nuevos grupos microbianos amplían la diversidad y alteran nuestra comprensión del árbol de la vida" . Celular . 172 (6): 1181-1197. doi : 10.1016 / j.cell.2018.02.016 . PMID 29522741 .
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enlaces externos
- Datos relacionados con el grupo DPANN en Wikispecies