David Bartel


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David P. Bartel es un biólogo molecular estadounidense más conocido por su trabajo con microARN . Bartel es profesor de biología en el Instituto de Tecnología de Massachusetts , miembro del Instituto Whitehead e investigador del Instituto Médico Howard Hughes (HHMI).

Biografía

Bartel obtuvo su BA grado en Biología de Goshen College en 1982 y su Ph.D. Licenciada en Virología de la Universidad de Harvard en 1993, bajo la tutela de Jack W. Szostak . [1]

Mientras estaba en el laboratorio de Szostak, Bartel aisló las primeras ribozimas directamente de una secuencia aleatoria, usando evolución in vitro (entre ellas, la ligasa de Clase I). [2] Después de independizarse en el Instituto Whitehead, desarrolló aún más esta ribozima para que funcione como una ARN polimerasa dependiente de ARN para extender los cebadores en moldes de ARN externos, reforzando la teoría del "mundo del ARN". [3] [4]

Bartel luego cambió su enfoque de investigación hacia la biología de microARN y, en particular, hacia la comprensión de sus funciones reguladoras. [5] Los microARN son piezas cortas de ARN, de aproximadamente 22 nucleótidos de largo, que amortiguan la expresión génica mediante el silenciamiento de los ARN mensajeros (ARNm). Su laboratorio fue uno de los tres que encontraron que los animales tienen muchos de estos pequeños ARN reguladores, [6] [7] [8] y fue el primero en describir microARN en plantas. [9] [10] A través de su trabajo con microARN, desarrolló una metodología que predice sus objetivos regulatorios y creó la herramienta basada en la web TargetScan , que hace que estas predicciones estén disponibles para la comunidad de investigadores. [11] [12][13] [14] [15] Su investigación también ha demostrado que la mayoría de los ARNm humanos están regulados por microARN y que los microARN actúan predominantemente para disminuir los niveles de sus objetivos de ARNm. [13] [16]

Bartel también descubrió varios otros tipos de ARN reguladores, incluidos los ARNip heterocromáticos, que silencian el ADN en lugar del ARN. [17] Además, Bartel está investigando las funciones de los ARN largos no codificantes (lncRNA) y cómo las regiones no traducidas y las colas de los ARNm reclutan y median los fenómenos regulatorios. [5]

Bartel es uno de los fundadores y asesor científico de Alnylam Pharmaceuticals, una empresa fundada en 2002 para promover la “terapéutica de ARNi (interferencia de ARN) como una nueva clase de medicamentos innovadores”. [18]

En 2006, Bartel fue colocado en segundo lugar por Thomson Reuters en un ranking de "citas" en el campo de la Biología Molecular / Genética. Ha recibido varios premios y fue elegido miembro de la Academia Nacional de Ciencias en 2011. [19]

Referencias

  1. ^ "David P. Bartel '82" . Boletín de Goshen . 2007 . Consultado el 8 de marzo de 2014 .
  2. ^ Ciencia . 10 de septiembre de 1993; 261 (5127): 1411-8. " Aislamiento de nuevas ribozimas a partir de un gran conjunto de secuencias aleatorias ". Bartel DP, Szostak JW.
  3. ^ Tendencias Cell Biol. Diciembre de 1999; 9 (12): M9-M13. " Construyendo un mundo de ARN ". Bartel DP, Unrau PJ.
  4. ^ Johnston, WK; Unrau, PJ; Lawrence, MS; Glasner, ME; Bartel, DP (18 de mayo de 2001). "Polimerización de ARN catalizada por ARN: extensión de cebador de plantilla de ARN precisa y general". Ciencia . 292 (5520): 1319–25. Código Bibliográfico : 2001Sci ... 292.1319J . CiteSeerX 10.1.1.70.5439 . doi : 10.1126 / science.1060786 . PMID 11358999 . S2CID 14174984 .   
  5. ^ a b "David Bartel" . HHMI . Consultado el 7 de octubre de 2016 .
  6. ^ "Ciencia". 26 de octubre de 2001; 294 (5543): 853-8. "Identificación de nuevos genes que codifican pequeños ARN expresados". Lagos-Quintana M1, Rauhut R, Lendeckel W, Tuschl T.
  7. ^ "Ciencia". 26 de octubre de 2001; 294 (5543): 858-62. " Una clase abundante de ARN diminutos con probables funciones reguladoras en Caenorhabditis elegans ". Lau NC1, Lim LP, Weinstein EG, Bartel DP.
  8. ^ "Ciencia". 26 de octubre de 2001; 294 (5543): 862-4. " Una clase extensa de ARN pequeños en Caenorhabditis elegans . Lee RC1, Ambros V.
  9. ^ "Genes Dev". 2002 1 de julio; 16 (13): 1616-26. " MicroARN en plantas ". Reinhart BJ1, Weinstein EG, Rhoades MW, Bartel B, Bartel DP.
  10. ^ "Celda". 2002 23 de agosto; 110 (4): 513-20. " Predicción de objetivos de microARN de plantas ". Rhoades MW1, Reinhart BJ, Lim LP, Burge CB, Bartel B, Bartel DP.
  11. ^ "Celda". 14 de enero de 2005; 120 (1): 15-20. "El emparejamiento de semillas conservadas, a menudo flanqueadas por adenosinas, indica que miles de genes humanos son objetivos de microARN ". Lewis BP, Burge CB, Bartel DP.
  12. ^ "Mol Cell". 2007 6 de julio; 27 (1): 91-105. " Especificidad dirigida a microARN en mamíferos: determinantes más allá del emparejamiento de semillas ". Grimson A1, Farh KK, Johnston WK, Garrett-Engele P, Lim LP, Bartel DP.
  13. ^ a b "Genoma Res." Enero de 2009; 19 (1): 92-105. " La mayoría de los ARNm de mamíferos son dianas conservadas de los microARN ". Friedman RC1, Farh KK, Burge CB, Bartel DP.
  14. ^ Agarwal, Vikram; Bell, George W .; Nam, Jin-Wu; Bartel, David P. (12 de agosto de 2015). "Predicción de sitios diana de microARN efectivos en ARNm de mamíferos" . eLife . 4 : e05005. doi : 10.7554 / eLife.05005 . ISSN 2050-084X . PMC 4532895 . PMID 26267216 .   
  15. ^ Agarwal, V; Subtelny, AO; Thiru, P; Ulitsky, yo; Bartel, DP (4 de octubre de 2018). "Predicción de la eficacia de direccionamiento de microARN en Drosophila" . Biología del genoma . 19 (1): 152. doi : 10.1186 / s13059-018-1504-3 . PMC 6172730 . PMID 30286781 .  
  16. ^ Guo, H; Ingolia, NT; Weissman, JS; Bartel, DP (12 de agosto de 2010). "Los microARN de mamíferos actúan predominantemente para disminuir los niveles de ARNm diana" . Naturaleza . 466 (7308): 835–40. Código bibliográfico : 2010Natur.466..835G . doi : 10.1038 / nature09267 . PMC 2990499 . PMID 20703300 .  
  17. ^ Reinhart, BJ; Bartel, DP (13 de septiembre de 2002). "Los ARN pequeños corresponden a las repeticiones heterocromáticas del centrómero". Ciencia . 297 (5588): 1831. doi : 10.1126 / science.1077183 . PMID 12193644 . S2CID 42288846 .  
  18. ^ "Junta de asesoramiento científico" . Alnylam.com . Consultado el 5 de octubre de 2016 .
  19. ^ "David Bartel miembro de Whitehead elegido a la Academia Nacional de Ciencias" . Consultado el 25 de enero de 2015 .

enlaces externos

  • Su biografía del Instituto Médico Howard Hughes
  • Sitio web de Bartel Lab
  • TargetScan
  • Seminario David Bartel: microARN
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