Hay muchas variantes del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2), el virus que causa la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19). Se cree, o se ha declarado, que algunos son de particular importancia debido a su potencial para aumentar la transmisibilidad, [1] aumentar la virulencia o reducir la eficacia de las vacunas contra ellos. [2] [3] Estas variantes contribuyen a la continuación de la pandemia de COVID-19 .
A partir de octubre de 2022 [actualizar], la Organización Mundial de la Salud solo designa la variante Omicron como una variante circulante preocupante . [4]
La aparición del SARS-CoV-2 puede haber resultado de eventos de recombinación entre un coronavirus similar al SARS de murciélago y un coronavirus de pangolín a través de la transmisión entre especies. [5]Los primeros genomas virales del SARS-CoV-2 disponibles se recolectaron de pacientes en diciembre de 2019, y los investigadores chinos compararon estos primeros genomas con cepas de coronavirus de murciélago y pangolín para estimar el tipo ancestral de coronavirus humano; el tipo de genoma ancestral identificado se denominó "S" y su tipo derivado dominante se denominó "L" para reflejar los cambios de aminoácidos mutantes. Independientemente, los investigadores occidentales llevaron a cabo análisis similares, pero etiquetaron el tipo ancestral como "A" y el tipo derivado como "B". El tipo B mutó a otros tipos, incluido B.1, que es el antepasado de las principales variantes globales de preocupación, etiquetadas en 2021 por la OMS como variantes alfa , beta , gamma , delta y omicron .[7] [8]
Al principio de la pandemia, el número relativamente bajo de infecciones (en comparación con las etapas posteriores de la pandemia) resultó en menos oportunidades para la mutación del genoma viral y, por lo tanto, menos oportunidades para la aparición de variantes diferenciadas. [9] Dado que la aparición de variantes era más rara, la observación de mutaciones de la proteína S en la región del dominio de unión al receptor (RBD) que interactúa con ACE2 tampoco fue frecuente. [10]
Con el paso del tiempo, la evolución del genoma del SARS-CoV-2 (por medio de mutaciones aleatorias) condujo a la selección natural de especímenes mutantes del virus (es decir, variantes genéticas), que se observó que eran más transmisibles. En particular, se observó que tanto la variante Alfa como la Delta eran más transmisibles que las cepas virales previamente identificadas. [11]
Algunas variantes del SARS-CoV-2 se consideran preocupantes, ya que mantienen (o incluso aumentan) su capacidad de replicación ante el aumento de la inmunidad de la población, [12] ya sea mediante la recuperación de la infección o mediante la vacunación. Algunas de las variantes de interés muestran mutaciones en el RBD de la proteína S. [13]