GENSCAN


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En bioinformática , GENSCAN es un programa para identificar estructuras genéticas completas en el ADN genómico . Es un programa basado en G HMM que puede usarse para predecir la ubicación de genes y sus límites exón - intrón en secuencias genómicas de una variedad de organismos. El servidor web GENSCAN se puede encontrar en MIT . [1]

GENSCAN fue desarrollado por Christopher Burge en el grupo de investigación de Samuel Karlin en la Universidad de Stanford . [2] [3] [4]

Referencias

  1. ^ http://genes.mit.edu/GENSCAN.html Archivado 2013-09-06 en Wayback Machine El servidor web GENSCAN en MIT
  2. ^ Burge, CB (1998) Modelado de dependencias en señales de empalme de pre-mRNA. En Salzberg, S. , Searls, D. y Kasif, S., eds. Métodos computacionales en biología molecular, Elsevier Science, Amsterdam, págs. 127-163. ISBN  978-0-444-50204-9
  3. ^ Burge, Christopher ; Karlin, Samuel (1997). "Predicción de estructuras génicas completas en el ADN genómico humano" (PDF) . Revista de Biología Molecular . 268 (1): 78–94. CiteSeerX 10.1.1.115.3107 . doi : 10.1006 / jmbi.1997.0951 . PMID 9149143 . Archivado desde el original (PDF) el 20 de junio de 2015.   
  4. ^ Burge, C .; Karlin, S. (1998). "Encontrar los genes en el ADN genómico". Opinión actual en biología estructural . 8 (3): 346–354. doi : 10.1016 / S0959-440X (98) 80069-9 . PMID 9666331 . 
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