Dominio GGDEF

regulador de respuesta PleD en complejo con c-diGMP

Identificadores

Símbolo

GGDEF

Pfam

Clan pfam

InterPro

SCOP2

CDD

Estructuras proteicas disponibles:
Pfam	estructuras / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum	resumen de estructura

En biología molecular, el dominio GGDEF es un dominio proteico que parece ser omnipresente en las bacterias y, a menudo, está vinculado a un dominio regulador, como un receptor de fosforilación o un dominio sensor de oxígeno . Su función es actuar como diguanilato ciclasa y sintetizar di-GMP cíclico , que se utiliza como molécula de señalización intracelular en una amplia variedad de bacterias . ^[1]^[2] La actividad enzimática puede verse fuertemente influenciada por los dominios adyacentes . Los procesos regulados por este dominio incluyen síntesis de exopolisacáridos , formación de biopelículas , motilidad y diferenciación celular .

Los estudios estructurales de PleD de Caulobacter crescentus muestran que este dominio forma una hoja beta de cinco hebras rodeada de hélices , similar al núcleo catalítico de la adenilato ciclasa . ^[3]

Referencias

^ Paul R, Weiser S, Amiot NC, Chan C, Schirmer T, Giese B, Jenal U (marzo de 2004). "Localización dinámica dependiente del ciclo celular de un regulador de respuesta bacteriana con un nuevo dominio de salida de di-guanilato ciclasa" . Genes Dev . 18 (6): 715–27. doi : 10.1101 / gad.289504 . PMC 387245 . PMID 15075296 .
^ Ryjenkov DA, Tarutina M, Moskvin OV, Gomelsky M (marzo de 2005). "El diguanilato cíclico es una molécula de señalización ubicua en las bacterias: conocimientos sobre la bioquímica del dominio de la proteína GGDEF" . J. Bacteriol . 187 (5): 1792–8. doi : 10.1128 / JB.187.5.1792-1798.2005 . PMC 1064016 . PMID 15716451 .
^ Chan C, Paul R, Samoray D, Amiot NC, Giese B, Jenal U, Schirmer T (diciembre de 2004). "Base estructural de la actividad y control alostérico de la diguanilato ciclasa" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (49): 17084–9. Código Bibliográfico : 2004PNAS..10117084C . doi : 10.1073 / pnas.0406134101 . PMC 535365 . PMID 15569936 .

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