Las matrices de glicanos , como la que ofrece el Consortium for Functional Glycomics (CFG), el National Center for Functional Glycomics (NCFG) y Z Biotech, LLC , contienen compuestos de carbohidratos que se pueden analizar con lectinas, anticuerpos o receptores celulares para definir la especificidad de los carbohidratos e identificar ligandos. El cribado de matrices de glicanos funciona de manera muy similar a otras micromatrices que se utilizan, por ejemplo, para estudiar la expresión génica de las micromatrices de ADN o la interacción de proteínas .
Las matrices de glicanos están compuestas por varios oligosacáridos y / o polisacáridos inmovilizados sobre un soporte sólido en una disposición definida espacialmente. [1] Esta tecnología proporciona los medios para estudiar las interacciones glucano-proteína en un entorno de alto rendimiento. Estos glicanos naturales o sintéticos (ver síntesis de carbohidratos ) se incuban luego con cualquier proteína de unión a glicanos, como lectinas , receptores de superficie celular o posiblemente un organismo completo, como un virus . La unión se cuantifica utilizando métodos de detección basados en fluorescencia.
Aplicaciones
La tecnología de matriz de glucanos se ha aplicado y se sigue aplicando para estudiar la especificidad de las interacciones huésped-patógeno . [2]
Desde el principio, se demostró que las matrices de glucanos eran útiles para determinar la especificidad de la hemaglutinina (influenza) del virus de la influenza A que se une al hospedador y distingue entre diferentes cepas de influenza (incluida la aviar de la de mamífero). Esto se demostró con matrices CFG [3] , así como con matrices personalizadas. [4] Los puntos de referencia multiplataforma llevaron a destacar el efecto de la presentación y el espaciado de glucanos en la unión. [5]
Las matrices de glicanos posiblemente se combinan con otras técnicas como la resonancia de plasmón superficial (SPR) para refinar la caracterización de la unión de glicanos . Por ejemplo, esta combinación condujo a demostrar la unión de heparina dependiente de calcio de la anexina A1 que está involucrada en varios procesos biológicos que incluyen inflamación , apoptosis y tráfico de membranas . [6]
Referencias
- ^ Oyelaran O, Gildersleeve JC (octubre de 2009). "Matrices de glicanos: avances recientes y retos de futuro" . Curr Opin Chem Biol . 13 (4): 406–413. doi : 10.1016 / j.cbpa.2009.06.021 . PMC 2749919 . PMID 19625207 .
- ^ Geissner A, Anish C, Seeberger PH (febrero de 2014). "Matrices de glicanos como herramientas para la investigación de enfermedades infecciosas". Curr Opin Chem Biol . 18 : 38–45. doi : 10.1016 / j.cbpa.2013.11.013 . PMID 24534751 .
- ^ Stevens J, Blixt O, Tumpey TM, Taubenberger JK, Paulson JC, Wilson IA (abril de 2006). "Estructura y especificidad del receptor de la hemaglutinina de un virus de influenza H5N1" . Ciencia . 312 (5772): 404–410. Código Bibliográfico : 2006Sci ... 312..404S . doi : 10.1126 / science.1124513 . PMID 16543414 .
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- ^ Wang L, Cummings RD, Smith DF, Huflejt M, Campbell CT, Gildersleeve JC, Gerlach JQ, Kilcoyne M, Joshi L, Serna S, Reichardt NC, Parera Pera N, Pieters RJ, Eng W, Mahal LK (junio de 2014). "Comparación multiplataforma de formatos de microarrays de glucanos" . Glicobiología . 24 (6): 507-17. doi : 10.1093 / glycob / cwu019 . PMC 4001710 . PMID 24658466 .
- ^ Horlacher T, Noti C, de Paz JL, Bindschädler P, Hecht ML, Smith DF, Fukuda MN, Seeberger PH (abril de 2011). "La caracterización de la unión de glicanos de anexina A1 revela la unión a glicanos altamente sulfatados con preferencia por heparina y sulfato de heparán altamente sulfatados" . Bioquímica . 50 (13): 2650–9. doi : 10.1021 / bi101121a . PMC 3068229 . PMID 21370880 .