En biología molecular, la familia de glucósido hidrolasas 97 es una familia de glucósido hidrolasas .
Glucósido hidrolasa 97 | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | Glyco_hydro_97 | |||||||
Pfam | PF10566 | |||||||
Clan pfam | CL0058 | |||||||
InterPro | IPR019563 | |||||||
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Glucósido hidrolasas EC 3.2.1. son un grupo extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicosídico entre dos o más carbohidratos, o entre un resto carbohidrato y no carbohidrato. Un sistema de clasificación de glucósido hidrolasas, basado en la similitud de secuencia, ha llevado a la definición de más de 100 familias diferentes. [1] [2] [3] Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , [4] [5] y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas de carbohidratos. [6] [7]
La familia de glucósido hidrolasa 97 (GH97) es una familia bacteriana . La parte central de las secuencias de proteínas de la familia GH97 representa un dominio de tipo TIM-barril catalítico o de 8 barriles (beta / alfa) típico y completo . Las partes N- y C-terminales de las secuencias, que consisten principalmente en cadenas beta , muy probablemente forman dos dominios no catalíticos adicionales con funciones aún desconocidas. Los dominios no catalíticos de glicosidasas de las superfamilias de alfa-galactosidasa y alfa-glucosidasa también están compuestos predominantemente por cadenas beta, y al menos algunos de estos dominios están implicados en la oligomerización y unión de carbohidratos. En todas las glicosidasas conocidas con el doblez de (beta-alfa) 8 barriles, los residuos de aminoácidos en el sitio activo se localizan en los extremos C-terminales de las cadenas beta. [8]
enlaces externos
- GH97 en CAZypedia
Referencias
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Mornon JP, Fabrega S, Lehn P, Davies G (1995). "Maquinaria catalítica conservada y la predicción de un pliegue común para varias familias de glicosil hidrolasas" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (15): 7090–7094. doi : 10.1073 / pnas.92.15.7090 . PMC 41477 . PMID 7624375 .
- ^ Henrissat B, Davies G (1995). "Estructuras y mecanismos de glicosil hidrolasas". Estructura . 3 (9): 853–859. doi : 10.1016 / S0969-2126 (01) 00220-9 . PMID 8535779 .
- ^ Bairoch, A. "Clasificación de familias de glicosil hidrolasa e índice de entradas de glicosil hidrolasa en SWISS-PROT". 1999.
- ^ "Inicio" . CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
- ^ Lombard, Vincent; Golaconda Ramulu, Hemalatha; Drula, Elodie; Coutinho, Pedro M .; Henrissat, Bernard (1 de enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas en carbohidratos (CAZy) en 2013" . Investigación de ácidos nucleicos . 42 (D1): D490 – D495. doi : 10.1093 / nar / gkt1178 . ISSN 0305-1048 . PMC 3965031 . PMID 24270786 .
- ^ "Familia 97 de glucósido hidrolasa" . CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
- ^ Consorcio CAZypedia (2018-12-01). "Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viva de enzimas activas en carbohidratos" . Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093 / glycob / cwx089 . hdl : 21.11116 / 0000-0003-B7EB-6 . ISSN 1460-2423 . PMID 29040563 .
- ^ Naumoff DG (2005). "GH97 es una nueva familia de glucósido hidrolasas, que está relacionada con la superfamilia de alfa-galactosidasa" . BMC Genomics . 6 : 112. doi : 10.1186 / 1471-2164-6-112 . PMC 1249566 . PMID 16131397 .