• citoplasma • endosoma • membrana • complejo represor transcripcional • región extracelular • núcleo celular • superficie celular • membrana celular • nucleoplasma • cromosoma • cromosoma condensado • retículo endoplásmico-compartimento intermedio de Golgi • lumen de los gránulos secretores • lumen de los gránulos ricos en ficolina-1 • extracelulares • endosoma temprano • proyección de neuronas • cromatina nuclear • complejo de integrina alfav-beta3-HMGB1
Proceso biológico
• Activación de células T-helper 1 • Fragmentación apoptótica del ADN • Respuesta inmune adaptativa • Regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • Regulación positiva de la ligadura del ADN • Regulación positiva de la cascada JNK • Respuesta celular al estímulo de daño del ADN • Aclaramiento celular apoptótico • Regulación positiva de la actividad endopeptidasa de tipo cisteína implicada en el proceso apoptótico • regulación positiva de la vía de señalización del receptor 9 tipo toll • regulación negativa del conjunto del complejo de preiniciación transcripcional de ARN polimerasa II • regulación positiva de la diferenciación de células dendríticas • regulación positiva de la unión al ADN • desarrollo de la proyección de neuronas • regulación negativa de la migración de células endoteliales de los vasos sanguíneos • regulación positiva de la producción de interleucina-12 • regulación positiva de la quimiotaxis de monocitos • secreción del factor de necrosis tumoral • activación de la respuesta inmune innata • Ligadura del ADN involucrada en la reparación del ADN • Sistema inmunológico innato • Respuesta inflamatoria • Reparación del ADN • Regulación positiva de la cascada MAPK • regulación positiva de la proliferación de células T activadas • cambio geométrico del ADN • recombinación del ADN • respuesta inflamatoria al estímulo antigénico • regulación positiva de la producción de interleucina-10 • proceso del sistema inmunológico • regulación negativa de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • regulación de la actividad endodesoxirribonucleasa de restricción • quimiotaxis • regulación positiva de la reparación del desajuste • regulación negativa de la diferenciación de células T alfa-beta CD4-positivas • regulación negativa de la producción de interferón-gamma • regulación positiva de la concentración de iones calcio citosólico • diferenciación de células T-helper 1 • quimiotaxis de células dendríticas • autofagia • aclaramiento de neutrófilos • recombinación V (D) J • regulación positiva del proceso apoptótico • cambio topológico del ADN • quimiotaxis positiva • vía de señalización del receptor de peaje • desgranulación de neutrófilos • desarrollo ocular • activación de células dendríticas mieloides • regulación positiva de la fosforilación de proteínas • proliferación de células endoteliales • Activación de células dendríticas plasmocitoides • Activación de macrófagos involucrada en la respuesta inmune • Regulación de la inducción de tolerancia • Regulación de la respuesta inmune mediada por células T a las células tumorales • Reparación de escisión de base • Regulación de la autofagia • Desarrollo pulmonar • Ensamblaje de cromatina • Activación de la actividad de la proteína quinasa • Positivo regulación de la producción de interferón-alfa • regulación positiva de la producción de interferón-beta • regulación positiva de la producción de interleucina-6 • regulación positiva de la producción del factor de necrosis tumoral • regulación positiva de la vía de señalización del receptor toll-like 2 • regulación positiva de la vía de señalización del receptor toll-like 4 • quimiotaxis de las células endoteliales • regulación positiva de la respuesta inmune innata • regulación positiva de la diferenciación de las células mieloides • regulación positiva del proceso catabólico del glucógeno • regulación de la proteína actividad quinasa • regulación positiva de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II • respuesta al glucocorticoide • regulación positiva de la cascada ERK1 y ERK2 • regulación positiva de la cicatrización de heridas • regulación positiva de la señalización de NIK / NF-kappaB • regulación positiva de la que brota la angiogénesis • regulación negativa de separación celular por apoptosis • regulación de la reparación por escisión de nucleótidos • regulación de la actividad del receptor • remodelación de la cromatina • cromatina silenciamiento • regulación positiva de la autofagia • proceso de desarrollo • positivo regulación de la migración de células endoteliales de los vasos sanguíneos • quimiotaxis celular • respuesta celular al lipopolisacárido • regulación positiva de la proliferación de células endoteliales vasculares • regulación positiva de la producción de proteína 1 quimiotáctica de monocitos • respuesta celular a la interleucina-7
La proteína de la caja 1 del grupo de alta movilidad , también conocida como proteína 1 del grupo de alta movilidad (HMG-1) y anfoterina , es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen HMGB1 . [3] [4]
HMG-1 pertenece al grupo de alta movilidad y contiene un dominio de caja HMG .
Contenido
1 función
2 Papel en la inflamación
3 Interacciones
3.1 Interacción a través de TLR4
4 Importancia clínica
5 referencias
6 Lecturas adicionales
7 Enlaces externos
Función [ editar ]
Al igual que las histonas , HMGB1 se encuentra entre las proteínas de cromatina más importantes. En el núcleo, HMGB1 interactúa con nucleosomas , factores de transcripción e histonas . [5] Esta proteína nuclear organiza el ADN y regula la transcripción. [6] Después de unirse, HMGB1 dobla [7] el ADN , lo que facilita la unión de otras proteínas. HMGB1 apoya la transcripción de muchos genes en interacciones con muchos factores de transcripción. También interactúa con los nucleosomas para aflojar el ADN empaquetado y remodelar la cromatina. El contacto con las histonas centrales cambia la estructura de los nucleosomas.
La presencia de HMGB1 en el núcleo depende de modificaciones postraduccionales. Cuando la proteína no está acetilada, permanece en el núcleo, pero la hiperacetilación de los residuos de lisina hace que se trasloque al citosol. [6]
HMGB1 se ha demostrado que desempeñan un papel importante en ayudar a la endonucleasa de RAG forma un complejo emparejado durante V (D) J recombinación . [8]
Papel en la inflamación [ editar ]
La HMGB1 es secretada por células inmunes (como macrófagos , monocitos y células dendríticas ) a través de una vía secretora sin líder . [6] Los macrófagos y monocitos activados secretan HMGB1 como mediador de citocinas de la inflamación . [9] Los anticuerpos que neutralizan HMGB1 confieren protección contra el daño y la lesión tisular durante la artritis , colitis , isquemia , sepsis , endotoxemia y lupus eritematoso sistémico . [ cita requerida ]El mecanismo de inflamación y daño consiste en la unión a TLR2 y TLR4 , que media la activación dependiente de HMGB1 de la liberación de citocinas de macrófagos. Esto coloca a HMGB1 en la intersección de las respuestas inflamatorias infecciosas y estériles. [10] [11]
La ADP-ribosilación de HMGB1 por PARP1 inhibe la eliminación de células apoptóticas , manteniendo así la inflamación. [12] La unión de TLR4 por HMGB1 o LPS ( lipopolisacárido ) mantiene la ribosilación de ADP de HMGB1 por PARP1, lo que sirve como un bucle de amplificación para la inflamación. [12]
Se ha propuesto la HMGB1 como adyuvante de vacuna de ADN . [13] Se demostró que la HMGB1 liberada de las células tumorales medía las respuestas inmunitarias antitumorales activando la señalización del receptor tipo Toll 2 (TLR2) en las CD infiltrantes de GBM derivadas de la médula ósea. [14]
Interacciones [ editar ]
HMGB1 tiene que interactuar con p53 . [15] [16]
HMGB1 es una proteína nuclear que se une al ADN y actúa como un factor arquitectónico de unión a la cromatina. También se puede liberar de las células, en cuya forma extracelular puede unirse al receptor inflamatorio RAGE (Receptor for Advanced Glycation End-products) y a los receptores Toll-like (TLR). La liberación de las células parece implicar dos procesos distintos: necrosis, en cuyo caso las membranas celulares se permeabilizan y los constituyentes intracelulares pueden difundirse fuera de la célula; y alguna forma de secreción activa o facilitada inducida por señalización a través del NF-κB. HMGB1 también se transloca al citosol en condiciones estresantes, como un aumento de ROS dentro de las células. En tales condiciones, HMGB1 promueve la supervivencia celular al mantener la autofagia a través de interacciones con beclin-1. Se considera en gran medida como una proteína antiapoptótica.
HMGB1 puede interactuar con ligandos TLR y citocinas, y activa células a través de múltiples receptores de superficie, incluidos TLR2 , TLR4 y RAGE. [17]
Interacción a través de TLR4 [ editar ]
Algunas acciones de HMGB1 están mediadas a través de los receptores tipo toll (TLR) . [18] La interacción entre HMGB1 y TLR4 da como resultado una regulación positiva de NF-κB , lo que conduce a una mayor producción y liberación de citocinas . HMGB1 también puede interactuar con TLR4 en neutrófilos para estimular la producción de especies reactivas de oxígeno por la NADPH oxidasa. [6] [19] El complejo HMGB1-LPS activa TLR4 y provoca la unión de proteínas adaptadoras (MyD88 y otras), lo que lleva a la transducción de señales y la activación de varias cascadas de señalización. El efecto aguas abajo de esta señalización es activar MAPKy NF-κB, y por tanto provocan la producción de moléculas inflamatorias como las citoquinas. [20] [21]
Importancia clínica [ editar ]
HMGB1 se ha propuesto como un objetivo para la terapia del cáncer, [22] y como un vector para reducir la inflamación de la infección por SARS-CoV-2 . [23]
La enfermedad neurodegenerativa ataxia espinocerebelosa tipo 1 (SCA1) es causada por una mutación en el gen de la ataxina 1 . En un modelo de ratón de SCA1, la proteína ataxina 1 mutante mediaba la reducción o inhibición de HMGB1 en las mitocondrias de las neuronas . [24] HMGB1 regula los cambios en la arquitectura del ADN esenciales para reparar el daño del ADN . En el modelo de ratón SCA1, la sobreexpresión de la proteína HMGB1 por medio de un vector de virus introducido que lleva el gen HMGB1 facilitó la reparación del daño del ADN mitocondrial, mejoró la neuropatología.y los defectos motores de los ratones SCA1, y también extendieron su vida útil. [24] Por lo tanto, el deterioro de la función de HMGB1 parece tener un papel clave en la patogénesis de SCA1.
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Andersson U, Ottestad W, Tracey KJ (mayo de 2020). "HMGB1 extracelular: ¿un objetivo terapéutico en la inflamación pulmonar grave, incluido COVID-19?" . Mol Med . 26 (1): 42 (2020). doi : 10.1186 / s10020-020-00172-4 . PMC 7203545 . PMID 32380958 .
Enlaces externos [ editar ]
HMGB1 + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
Investigación del cáncer de páncreas y vía de señalización HMGB1
PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para la proteína B1 del grupo de alta movilidad humana (HMGB1)
PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para la proteína B1 del grupo de alta movilidad de rata (HMGB1)
vtmiGalería PDB
1aab : ESTRUCTURA DE RMN DEL FRAGMENTO DE RAT HMG1 HMGA
1ckt : ESTRUCTURA CRISTALINA DEL DOMINIO HMG1 UNIDO A UN DÚPLEX DE ADN MODIFICADO EN CISPLATINA
1hme : ESTRUCTURA DEL MOTIVO DE CAJA HMG EN EL DOMINIO B DE HMG1
1hmf : ESTRUCTURA DEL MOTIVO DE CAJA HMG EN EL DOMINIO B DE HMG1
1hsm : LA ESTRUCTURA DE LA CAJA HMG Y SU INTERACCIÓN CON EL ADN
1hsn : LA ESTRUCTURA DE LA CAJA DE HMG Y SU INTERACCIÓN CON EL ADN
1j3x : Estructura de la solución del dominio N-terminal del HMGB2
1nhm : LA ESTRUCTURA DE LA CAJA HMG Y SU INTERACCIÓN CON EL ADN
1nhn : LA ESTRUCTURA DE LA CAJA DE HMG Y SU INTERACCIÓN CON EL ADN
vtmiFactores de transcripción y receptores intracelulares
(1) Dominios básicos
(1.1) Cremallera básica de leucina ( bZIP )
Factor de transcripción activador
AATF
1
2
3
4
5
6
7
AP-1
c-Fos
FOSB
FOSL1
FOSL2
JDP2
c-jun
JUNB
JunD
LLEVAR UNA VIDA DE SOLTERO
1
2
BATF
BLZF1
C / EBP
α
β
γ
δ
ε
ζ
CREB
1
3
L1
CREM
DBP
DDIT3
GABPA
GCN4
HLF
MAF
B
F
GRAMO
K
NFE
2
L1
L2
L3
NFIL3
NRL
NRF
1
2
3
XBP1
(1.2) Hélice-bucle-hélice básica ( bHLH )
Grupo A
AS-C
ASCL1
ASCL2
ATOH1
MANO
1
2
MESP2
Factores reguladores miogénicos
MyoD
Miogenina
MYF5
MYF6
NeuroD
1
2
Neurogeninas
1
2
3
OLIG
1
2
Paraxis
TCF15
Escleraxis
SLC
LYL1
TAL
1
2
Giro
Grupo B
FIGLA
Mi c
c-Myc
l-Myc
n-Myc
MXD4
TCF4
Grupo C bHLH- PAS
AhR
AHRR
ARNT
ARNTL
ARNTL2
RELOJ
HIF
1A
EPAS1
3A
NPAS
1
2
3
SIM
1
2
Grupo D
BHLH
2
3
9
Pho4
IDENTIFICACIÓN
1
2
3
4
Grupo E
ÉL ES
1
2
3
4
5
6
7
OYE
1
2
L
Grupo F bHLH-COE
EBF1
(1.3) bHLH-ZIP
AP-4
MAX
MXD1
MXD3
MITF
MNT
MLX
MLXIPL
MXI1
Mi c
SREBP
1
2
USF1
(1,4) NF-1
NFI
A
B
C
X
SMAD
R-SMAD
1
2
3
5
9
ESTÁ LOCO
6
7
4 )
(1,5) RF-X
RFX
1
2
3
4
5
6
ANK
(1.6) Hélice-tramo-hélice básica (bHSH)
AP-2
α
β
γ
δ
ε
(2) Dominios de unión al ADN con dedos de zinc
(2.1) Receptor nuclear (Cys 4 )
subfamilia 1
Hormona tiroidea
α
β
AUTO
FXR
LXR
α
β
PPAR
α
β / δ
γ
PXR
RAR
α
β
γ
ROR
α
β
γ
Rev-ErbA
α
β
VDR
subfamilia 2
GOLPE-TF
( Yo
II
Oreja-2
HNF4
α
γ
PNR
RXR
α
β
γ
Receptor testicular
2
4
TLX
subfamilia 3
Hormona esteroide
Andrógino
Estrógeno
α
β
Glucocorticoide
Mineralocorticoide
Progesterona
Relacionado con el estrógeno
α
β
γ
subfamilia 4
NUR
NGFIB
NOR1
NURR1
subfamilia 5
LRH-1
SF1
subfamilia 6
GCNF
subfamilia 0
DAX1
SHP
(2.2) Otras Cys 4
GATA
1
2
3
4
5
6
MTA
1
2
3
TRPS1
(2.3) Cys 2 His 2
Factores de transcripción generales
TFIIA
TFIIB
TFIID
TFIIE
1
2
TFIIF
1
2
TFIIH
1
2
4
2I
3A
3C1
3C2
ATBF1
BCL
6
11A
11B
CTCF
E4F1
EGR
1
2
3
4
ERV3
GFI1
GLI- Familia Krüppel
1
2
3
DESCANSO
S1
S2
YY1
HIC
1
2
HIVEP
1
2
3
IKZF
1
2
3
ILF
2
3
KLF
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
17
MTF1
MYT1
OSR1
PRDM9
VENDER
1
2
3
4
SP
1
2
4
7
8
TSHZ3
WT1
Zbtb7
7A
7B
ZBTB
11
dieciséis
17
20
32
33
40
dedo de zinc
3
7
9
10
19
22
24
33B
34
35
41
43
44
51
74
143
146
148
165
202
217
219
238
239
259
267
268
281
295
300
318
330
346
350
365
366
384
423
451
452
471
593
638
644
649
655
804A
(2.4) Cys 6
HIVEP1
(2.5) Composición alternante
AIRE
DIDO1
GRLF1
EN G
1
2
4
JARID
1A
1B
1C
1D
2
JMJD1B
(2.6) WRKY
WRKY
(3) Dominios de hélice-vuelta-hélice
(3.1) Homeodominio
Clase ANTP de Antennapedia
protoHOX Hox-like
ParaHox
Gsx
1
2
Xlox
PDX1
Cdx
1
2
4
Hox extendido: Evx1
Evx2
MEOX1
MEOX2
Homeobox
A1
A2
A3
A4
A5
A7
A9
A10
A11
A13
B1
B2
B3
B4
B5
B6
B7
B8
B9
B13
C4
C5
C6
C8
C9
C10
C11
C12
C13
D1
D3
D4
D8
D9
D10
D11
D12
D13
GBX1
GBX2
MNX1
tipo metaHOX NK
BARHL1
BARHL2
BARX1
BARX2
BSX
DBX
1
2
DLX
1
2
3
4
5
6
EMX
1
2
ES
1
2
HHEX
HLX
LBX1
LBX2
MSX
1
2
NANOG
NKX
2-1
2-2
2-3
2-5
3-1
3-2
HMX1
HMX2
HMX3
6-1
6-2
OTAN
TLX1
TLX2
TLX3
VAX1
VAX2
otro
ARX
CRX
CUTL1
FHL
1
2
3
HESX1
HOPX
LMX
1A
1B
SIN CAJA
CUENTO
IRX
1
2
3
4
5
6
MKX
MEIS
1
2
PBX
1
2
3
PKNOX
1
2
SEIS
1
2
3
4
5
PHF
1
3
6
8
10
dieciséis
17
20
21A
Dominio de POU
PIT-1
BRN-3 : A
B
C
Factor de transcripción de octamer : 1
2
3/4
6
7
11
SATB2
ZEB
1
2
(3.2) Caja emparejada
PAZ
1
2
3
4
5
6
7
8
9
PRRX
1
2
PROP1
PHOX
2A
2B
RAX
SHOX
SHOX2
VSX1
VSX2
Bicoide
GSC
BICD2
OTX
1
2
PITX
1
2
3
(3.3) Cabeza de horquilla / hélice alada
E2F
1
2
3
4
5
Proteínas FOX
A1
A2
A3
C1
C2
D3
D4
E1
E3
F1
G1
H1
I1
J1
J2
K1
K2
L2
M1
N1
N3
O1
O3
O4
P1
P2
P3
P4
(3.4) Factores de choque térmico
HSF
1
2
4
(3.5) Clústeres de triptófano
DUENDE
2
4
5
EGF
ALCE
1
3
4
ERF
ETS
1
2
ERGIO
SPIB
ETV
1
4
5
6
FLI1
Factores reguladores del interferón
1
2
3
4
5
6
7
8
MI B
MYBL2
(3.6) dominio TEA
factor potenciador transcripcional
1
2
3
4
(4) factores β-andamio con contactos de ranura menores
(4.1) Región de homología rel
NF-κB
NFKB1
NFKB2
REL
RELA
RELB
NFAT
C1
C2
C3
C4
5
(4.2) ESTADÍSTICA
ESTADÍSTICA
1
2
3
4
5
6
(4.3) similar a p53
p53 p63 p73 familia
p53
TP63
p73
TBX
1
2
3
5
19
21
22
TBR1
TBR2
TFT
MYRF
(4.4) Caja MADS
Mef2
A
B
C
D
SRF
(4.6) Proteínas de unión a TATA
TBP
TBPL1
(4.7) Grupo de alta movilidad
BBX
HMGB
1
2
3
4
HMGN
1
2
3
4
HNF
1A
1B
SOX
1
2
3
4
5
6
8
9
10
11
12
13
14
15
18
21
SRY
SSRP1
TCF / LEF
TCF
1
3
4
LEF1
TOX
1
2
3
4
(4.9) Granulado
TFCP2
(4.10) Dominio de choque frío
CSDA
YBX1
(4.11) Enano
CBF
CBFA2T2
CBFA2T3
RUNX1
RUNX2
RUNX3
RUNX1T1
(0) Otros factores de transcripción
(0,2) HMGI (Y)
HMGA
1
2
HBP1
(0.3) Dominio de bolsillo
Rb
RBL1
RBL2
(0.5) Factores relacionados con AP-2 / EREBP
Apetala 2
EREBP
B3
(0.6) Varios
ÁRIDO
1A
1B
2
3A
3B
4A
GORRA
SI YO
dieciséis
35
MLL
2
3
T1
MNDA
NFY
A
B
C
Rho / Sigma
ver también deficiencias de factor de transcripción / corregulador