Helen Miriam Berman es profesora de la Junta de Gobernadores de Química y Biología Química en la Universidad de Rutgers y ex directora del RCSB Protein Data Bank (una de las organizaciones miembros del Worldwide Protein Data Bank ). Bióloga estructural, su trabajo incluye el análisis estructural de complejos proteína-ácido nucleico y el papel del agua en las interacciones moleculares. También es la fundadora y directora de la base de datos de ácidos nucleicos y dirigió la base de conocimientos de genómica estructural de la Iniciativa de estructura de proteínas. [1] [2] [3]
Helen Berman | |
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Nació | Helen Miriam Berman 1943 (77 a 78 años) Chicago, Illinois |
alma mater | |
Esposos) |
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Niños | Jason Asher Young [ cita requerida ] |
Premios |
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Carrera científica | |
Campos | |
Instituciones | Universidad Rutgers |
Tesis | Las estructuras cristalinas de Alpha Prime y Beta-D-Mannitol, Galacticol, Methyl Aalpha-D-Glucopyranoside and Hydroxyurea (1967) |
Asesor de doctorado | George A. Jeffrey [ cita requerida ] |
Otros asesores académicos | Barbara Low , Jenny Glusker |
Sitio web | rutchem |
Antecedentes y educación
Berman nació en Chicago, Illinois y creció en Brooklyn, Nueva York. Su padre, David Bernstein, era médico y su madre, Dorothy Bernstein (de soltera Skupsky), administraba la consulta del consultorio de su padre. Inspirada por su padre trabajador y erudito, se interesó en la ciencia cuando era niña y planeaba convertirse en científica o médica. Su madre, que estaba muy involucrada en la comunidad y el trabajo voluntario, la influyó para que participara en actividades comunitarias a lo largo de su vida.
Durante la escuela secundaria, Berman trabajó en el laboratorio de Ingrith Deyrup en Barnard College . Deyrup animó a Berman a asistir a Barnard como estudiante. Mientras estaba en la universidad, trabajó en un laboratorio del Colegio de Médicos y Cirujanos de la Universidad de Columbia con Barbara Low . Allí, Berman aprendió sobre la cristalografía , que se convertiría en una pasión para toda la vida. Se graduó de Barnard con un AB en química en 1964.
Después de la universidad, Berman asistió a la Universidad de Pittsburgh para realizar un posgrado, un lugar que eligió porque era el único lugar en el país con un departamento de cristalografía, y uno de los pocos donde se ofrecía la cristalografía como asignatura. Allí trabajó con George A. Jeffrey en la estructura de los carbohidratos, recibiendo su Ph.D. en 1967. Berman permaneció en la Universidad de Pittsburgh durante dos años más como investigador postdoctoral .
Carrera profesional
En 1969, Berman se mudó al Fox Chase Cancer Center en Filadelfia, donde trabajó en el laboratorio de Jenny P. Glusker antes de comenzar su propio programa de investigación independiente como miembro de la facultad en 1973. En Fox Chase, Berman se interesó en las estructuras de ácidos nucleicos. y en bioinformática. Sabía que la organización lógica de los datos los haría útiles para una variedad de científicos.
En junio de 1971, Berman asistió a un simposio en el Laboratorio Cold Spring Harbor , donde varios científicos acordaron que los datos sobre el creciente número de estructuras de proteínas deberían archivarse en una base de datos. [4] Esa reunión llevó a la creación del Protein Data Bank (PDB) en el Laboratorio Nacional de Brookhaven . [5] [6]
En 1989, Berman se mudó a Rutgers y en 1992, junto con otros científicos, cofundó la base de datos de ácidos nucleicos (NDB) para recopilar y difundir información sobre la estructura de los ácidos nucleicos. [7] En Rutgers, continuó estudiando los ácidos nucleicos, sus interacciones con las proteínas, [8] y también investigó la estructura del colágeno en colaboración con Barbara Brodsky y Jordi Bella. [9] Ella figura como depositante en 38 estructuras en el AP de 1992 a 2011, de complejos de proteína / ácido nucleico y sus componentes (por ejemplo, 1RUN, 3SSX, 2B1B), fragmentos de colágeno (por ejemplo, 1CGD, 1EI8) y otras macromoléculas. .
En 1998, Berman y Philip Bourne compitieron juntos y ganaron el contrato para el Protein Data Bank y la base de datos se trasladó de Brookhaven a los auspicios del Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), actualmente una colaboración entre Rutgers y la Universidad de California. San Diego. Con sus colegas, Berman rediseñó el sistema de administración de datos, agregó nuevas herramientas de usuario e hizo que la base de datos se pudiera buscar. [10] Desde 2003, el archivo de PDB ha sido administrado por el Protein Data Bank mundial (wwPDB), una asociación fundada por Berman que consta de organizaciones que actúan como centros de depósito, procesamiento de datos y distribución de datos de PDB: el RCSB, el PDBe. en Europa y el PDBj en Japón. [11] En 2006, el banco de datos BioMagResData (BMRB) para estructuras de resonancia magnética nuclear (RMN) [12] se convirtió en el cuarto miembro de la wwPDB. [13] En julio de 2018, el NDB contiene más de 9600 estructuras de ácido nucleico y el PDB tiene más de 142,000 estructuras macromoleculares.
También liderada por la RCSB, la Base de Conocimiento de Genómica Estructural de la Iniciativa de Estructura de Proteínas (PSI) se lanzó en la primavera de 2008 para proporcionar un portal actualizado continuamente para investigar datos y otros recursos de los esfuerzos de la PSI. [14]
Berman también ha estado activo en la comunidad científica, sirviendo como presidente de la Asociación Cristalográfica Estadounidense en 1988, asesorando tanto a los Institutos Nacionales de Salud como a la Fundación Nacional de Ciencias, y sirviendo en el consejo editorial de varias revistas. Su trabajo ha sido ampliamente publicado en revistas científicas revisadas por pares . [8] [9] [15] [16] [17]
Berman fue el productor ejecutivo y creador de la serie documental Target Zero que se centra en los aspectos médicos y sociales del tratamiento y la prevención del VIH. [18] Los tres cortometrajes entrelazan historias de pacientes de la vida real, entrevistas con médicos, proveedores médicos y científicos destacados; y animaciones moleculares de última generación. Estos relatos iluminan la compleja historia del control de la epidemia del VIH y revelan la necesidad continua de una atención compasiva y centrada en el paciente y una verdadera comprensión a nivel celular de la ciencia detrás de los tratamientos. [19]
Honores y premios
- Mujer de logros de Nueva Jersey (1993)
- Miembro de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia (1996)
- Premio a la mujer científica destacada, Asociación de Mujeres en la Ciencia , Capítulo de Nueva York (1999)
- Conferencista distinguido, Sigma Xi : The Scientific Research Society (2007-2009) [20]
- Premio al Servicio Distinguido, Sociedad Biofísica (2000) [1]
- Miembro de la Sociedad de Biofísica (2001) [21]
- Premio MJ Buerger, Asociación Cristalográfica Estadounidense (2006) [22]
- Premio al alumno del Departamento de Química de la Universidad de Pittsburgh (2010)
- Miembro de la American Crystallographic Association (2011) [2]
- Premio Carl Brändén de la Protein Society (2012)
- Premio DeLano de Biociencias Computacionales de la Sociedad Estadounidense de Bioquímica y Biología Molecular (2013) [23]
- Premio Benjamin Franklin de Acceso Abierto a las Ciencias de la Vida (2014)
Vida personal
Berman ha estado casada dos veces, con el ingeniero Victor Berman en la década de 1960 y con el biólogo molecular Peter Young de 1976 a 1999. Del segundo matrimonio tiene un hijo, Jason Asher Young (nacido en 1979), físico.
Durante la década de 1980, a Berman le diagnosticaron cáncer de mama. La experiencia la hizo estar más enfocada en su vida y su carrera, e interesada en apoyar a otras mujeres que enfrentan el mismo diagnóstico.
Referencias
- ^ a b Publicaciones de Helen M. Berman indexadas por Google Scholar
- ^ Demasters K: EN EL MAPA; Un banco donde la moneda son las moléculas . New York Times 26 de noviembre de 2000. Consultado el 22 de octubre de 2008.
- ^ La historia de Helen Berman de la Oficina de la Universidad de Rutgers para la Promoción de la Mujer en la Ciencia, la Ingeniería y las Matemáticas
- ^ Simposios de Cold Spring Harbor sobre biología cuantitativa, vol. XXXVI (1972)
- ^ Bernstein FC, Koetzle TF, Williams GJ, Meyer EF, Brice MD, Rodgers JR, Kennard O, Shimanouchi T, Tasumi M (1977). "Protein Data Bank: un archivo informático para estructuras macromoleculares". Revista de Biología Molecular . 112 (3): 535–542. doi : 10.1016 / S0022-2836 (77) 80200-3 . PMID 875032 .
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- ^ a b Bella J, Eaton M, Brodsky B, Berman HM (1994). "Estructura cristalina y molecular de un péptido similar al colágeno con una resolución de 1,9 Å". Ciencia . 266 (5182): 75–81. Código Bibliográfico : 1994Sci ... 266 ... 75B . doi : 10.1126 / science.7695699 . PMID 7695699 .
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- ^ Posatko, Mary (1 de mayo de 2017). "Objetivo cero" . imdb.com . Consultado el 17 de enero de 2021 .
- ^ Conferencistas distinguidos Sigma Xi
- ^ "Dos distinguidos químicos de Rutgers nombrados Becarios de la Sociedad Biofísica". Biomedicina
- ^ Profesora de Rutgers Helen M. Berman para recibir el prestigioso premio MJ Buerger, comunicado de prensa de Rutgers, 16 de agosto de 2006 Archivado el 20 de julio de 2011 en la Wayback Machine.
- ^ "Berman es reconocida por sus esfuerzos para eliminar las barreras al acceso a los datos" . Consultado el 22 de enero de 2015 .