El Atlas de células humanas es un proyecto para describir todos los tipos de células del cuerpo humano . La iniciativa fue anunciada por un consorcio después de su reunión inaugural en Londres en octubre de 2016, que estableció la primera fase del proyecto. [1] [2] Aviv Regev y Sarah Teichmann definieron los objetivos del proyecto en esa reunión, [3] que fue convocada por el Broad Institute , el Wellcome Trust Sanger Institute y Wellcome Trust . [4] Regev y Teichmann lideran el proyecto. [5]
Contenido | |
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Organismos | Humano |
Acceso | |
Sitio web | www |
Descripción
El Atlas de células humanas catalogará una célula en función de varios criterios, específicamente el tipo de célula , su estado, su ubicación en el cuerpo, las transiciones que sufre y su linaje. [6] Recopilará datos de investigaciones existentes y los integrará con los datos recopilados en futuros proyectos de investigación. [2] Entre los datos que recopilará se encuentran el fluxoma , el genoma , el metaboloma , el proteoma y el transcriptoma . [2]
Su alcance es categorizar los 37 billones de células del cuerpo humano para determinar qué genes expresa cada célula tomando muestras de células de todas las partes del cuerpo. [7]
Todos los aspectos del proyecto se pondrán "a disposición del público de forma gratuita", incluido el software y los resultados. [8]
En abril de 2018, el proyecto incluía a más de 480 investigadores que realizaban 185 proyectos. [9]
Fondos
En octubre de 2017, la Iniciativa Chan Zuckerberg anunció la financiación de 38 proyectos relacionados con Human Cell Atlas. [10] Entre ellos se encontraba una subvención de valor no revelado al Instituto Zuckerman del Centro Médico de la Universidad de Columbia en la Universidad de Columbia . [8] La subvención, titulada "Una estrategia para mapear la médula espinal humana con resolución de una sola célula", financiará la investigación para identificar y catalogar la actividad genética en todas las células de la médula espinal . [8] El Instituto de Investigación de Genómica Traslacional recibió una subvención para desarrollar un estándar para el "procesamiento y almacenamiento de tejidos sólidos para la secuenciación de ARN de una sola célula ", en comparación con la práctica típica de confiar en el promedio de secuenciación de múltiples células. [10]
El programa también cuenta con el respaldo de la Unión Europea , los Institutos Nacionales de Salud de Estados Unidos y la Fundación Manton. [7]
Datos
En abril de 2018, se publicó el primer conjunto de datos del proyecto, que representa 530,000 células del sistema inmunológico recolectadas de la médula ósea y la sangre del cordón . [9]
Un programa de investigación del Instituto Max Planck de Inmunobiología y Epigenética publicó un atlas de las células del hígado , utilizando secuenciación de ARN de una sola célula en 10,000 células normales obtenidas de nueve donantes. [11]
Ver también
- Lista de distintos tipos de células en el cuerpo humano adulto
- Proyecto Genoma Humano
- ENCODE - Enciclopedia de elementos de ADN (ENCODE)
- Atlas de proteínas humanas
Notas
- ^ Preidt 2016 .
- ^ a b c Sí, 2017 .
- ^ Muestra 2017 .
- ^ Bienvenidos Trust Sanger Institute 2016 .
- ^ Nowogrodzki 2017 .
- ^ Regev , pág. 4.
- ^ a b Apple 2018 .
- ↑ a b c Silva, 2017 .
- ↑ a b Daley, 2018 .
- ^ a b AZ Big Media 2017 .
- ^ Aizarani y col. 2019 .
Referencias
- Aizarani, Nadim; Saviano, Antonio; Sagar, Laurent Mailly; Durand, Sarah; Herman, Josip S .; Pessaux, Patrick; Baumert, Thomas F .; Grün, Dominic (10 de julio de 2019). "Un atlas de células hepáticas humanas revela heterogeneidad y progenitores epiteliales" . Naturaleza . 572 (7768): 199–204. doi : 10.1038 / s41586-019-1373-2 . PMC 6687507 . PMID 31292543 .
- Apple, Sam (22 de agosto de 2018). "El cartógrafo de las células" . MIT Technology Review (publicado en septiembre de 2018).
- Daley, Jason (19 de abril de 2018). "Human Cell Atlas publica el primer conjunto de datos importante" . Revista Smithsonian . Consultado el 26 de diciembre de 2019 .
- Farivar, Cyrus (30 de septiembre de 2017). "Para asimilar mejor cómo funcionan las 37 billones de células humanas, necesitamos nuevas herramientas" . Ars Technica . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
- Nowogrodzki, Anna (5 de julio de 2017). "Cómo construir un atlas de células humanas" . Naturaleza . 547 (7661): 24-26. Código Bib : 2017Natur.547 ... 24N . doi : 10.1038 / 547024a . PMID 28682347 . S2CID 211067156 . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
- Preidt, Robert (17 de octubre de 2016). "Los científicos planean mapear cada célula del cuerpo humano" . CBS News . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
- Regev, Aviv. "El Atlas de células humanas" (PDF) . Departamento de Biología, Instituto de Tecnología de Massachusetts . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
- Sample, Ian (14 de octubre de 2016). "El proyecto Atlas de células humanas tiene como objetivo mapear los 35 billones de células del cuerpo humano" . The Guardian . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
- Silva, Catarina (20 de octubre de 2017). "Los investigadores de Columbia reciben financiación del fundador de Facebook para crear un atlas de células de la médula espinal" . Noticias de ALS hoy . Consultado el 20 de octubre de 2017 .
- Sí, Sang (26 de junio de 2017). "Atlas de células humanas abre una nueva ventana a la salud y la enfermedad" . Scientific American . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
- "TGen desarrolla procedimientos de procesamiento para la secuenciación 'unicelular'" . AZ Big Media. 19 de octubre de 2017 . Consultado el 20 de octubre de 2017 .
- "Iniciativa internacional del Atlas de células humanas" (Comunicado de prensa). Wellcome Trust Sanger Institute . 14 de octubre de 2016 . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
Otras lecturas
- Rozenblatt-Rosen, O .; Stubbington, MJT; Regev, A .; Teichmann, SA (18 de octubre de 2017). "El Atlas de la célula humana: de la visión a la realidad" . Naturaleza . 550 (7677): 451–453. Código Bib : 2017Natur.550..451R . doi : 10.1038 / 550451a . PMID 29072289 . S2CID 205095818 . Consultado el 28 de abril de 2020 .Mantenimiento CS1: fecha y año ( enlace )
enlaces externos
- Página web oficial
- Participantes en la reunión Human Cell Atlas (8 de mayo de 2017). "El Atlas de células humanas" . doi : 10.1101 / 121202 . S2CID 196651314 . Consultado el 1 de octubre de 2017 . Cite journal requiere
|journal=
( ayuda )Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace ) - Ledford, Heidi (23 de febrero de 2017). "La carrera para mapear el cuerpo humano - una célula a la vez" . Naturaleza . 542 (7642): 404–405. Código Bib : 2017Natur.542..404L . doi : 10.1038 / nature.2017.21508 . PMID 28230136 . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
- Cepelewicz, Jordana (12 de julio de 2017). "Atlas de células revelan las fronteras de la biología" . Revista Quanta . Consultado el 1 de octubre de 2017 .
- "La plataforma de datos Human Cell Atlas comienza con el apoyo de CZI" (Comunicado de prensa). Iniciativa Chan Zuckerberg . 1 de junio de 2017 . Consultado el 4 de octubre de 2017 .
- Regev, Aviv (junio de 2017). "Creación de un censo de células humanas" . Nautilus . Consultado el 4 de octubre de 2017 .
- Yong, Ed (14 de octubre de 2016). "Un Google Maps para el cuerpo humano" . El Atlántico . Consultado el 4 de octubre de 2017 .