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Comité Internacional de Taxonomía de Virus
Logotipo oficial
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AbreviaturaICTV
Formación1966 ; Hace 55 años ( 1966 )
PropósitoRegulación de la taxonomía de virus.
CamposVirología de la taxonomía
Presidente (2020-2023)Murilo Zerbini
Vicepresidente (2020-2023)Stuart Siddell
Organización matrizUnión Internacional de Sociedades Microbiológicas , División de Virología
Afiliaciones
Bienvenidos a la Sociedad de Microbiología
Sitio webhablar .ictvonline .org Edita esto en Wikidata

El Comité Internacional de Taxonomía de Virus ( ICTV ) autoriza y organiza la clasificación taxonómica y las nomenclaturas de virus . [1] [2] [3] El ICTV ha desarrollado un esquema taxonómico universal para los virus y, por lo tanto, tiene los medios para describir, nombrar y clasificar adecuadamente todos los virus que afectan a los organismos vivos. Los miembros del Comité Internacional de Taxonomía de Virus se consideran virólogos expertos . [4] El ICTV se formó y está gobernado por la División de Virología de la Unión Internacional de Sociedades Microbiológicas . [5]El trabajo detallado, como delimitar los límites de las especies dentro de una familia, normalmente lo realizan grupos de estudio de expertos en las familias. [2]

Historia [ editar ]

La Clasificación Internacional de Virus fue un grupo establecido en 1966 para estandarizar la denominación de virus. El grupo pasó a llamarse Comité Internacional de Taxonomía de Virus en 1975. [ cita requerida ]

En 1971, la clasificación de la ICTV para los virus que infectan a los vertebrados incluía 19 géneros, 2 familias y otros 24 grupos no clasificados.

Estructura organizativa [ editar ]

La organización está dividida en un comité ejecutivo, que incluye funciones elegidas de duración determinada, y seis subcomités, cada uno de los cuales se divide en numerosos 'grupos de estudio', que constan de un presidente y un número variable de miembros dedicados a la taxonomía. de un taxón específico, como una orden o una familia. Esta estructura se puede visualizar de la siguiente manera: [6]

Comité Ejecutivo
  • presidente
  • Vicepresidente
  • Secretarios
  • Secretaria comercial
  • Secretario de Propuestas
  • Secretario de datos
  • Presidentes - puestos: 6 (uno para cada subcomité)
  • Miembros electos - posiciones: 8
Subcomités
  • Subcomité de virus y retrovirus del ADN animal - grupos de estudio: 18
  • Animal dsRNA y ssRNA- Subcomité de Virus - Grupos de estudio: 22
  • Subcomité de virus ssRNA + animales - grupos de estudio: 15
  • Subcomité de virus bacterianos y arqueales - grupos de estudio: 19
  • Subcomité de virus fúngicos y protistas - grupos de estudio: 11
  • Subcomité de virus vegetales - grupos de estudio: 22

Objetivos [ editar ]

Los objetivos del Comité Internacional de Taxonomía de Virus son:

  1. Desarrollar una taxonomía de virus acordada internacionalmente.
  2. Establecer nombres acordados internacionalmente para taxones de virus.
  3. Comunicar a los virólogos las decisiones tomadas en materia de clasificación y nomenclatura de virus mediante la celebración de reuniones y publicación de informes.
  4. Mantener un índice oficial de nombres acordados de taxones de virus.
  5. Estudiar los efectos de los virus en la sociedad moderna y su comportamiento.

Principios de nomenclatura [ editar ]

Los principios esenciales de la nomenclatura de virus de ICTV son:

  • Estabilidad
  • Para evitar o rechazar el uso de nombres que puedan causar error o confusión.
  • Para evitar la creación innecesaria de nombres

El sistema de clasificación de virus universal de ICTV utiliza una versión ligeramente modificada del sistema de clasificación biológica estándar . Solo reconoce el orden, la familia, la subfamilia, el género y la especie de los taxones . Cuando no se sabe cómo clasificar una especie en un género, pero su clasificación en una familia es clara, se clasificará como una especie no asignada de esa familia. Muchos taxones permanecen sin clasificar. También hay, a partir de 2005, secuencias de GenBank asignadas a 3,142 "especies" que no se contabilizan en el informe de ICTV (debido a la forma en que funciona GenBank, sin embargo, el número real de especies adecuadas es probablemente significativamente menor). [2] Solo se espera que el número de secuencias de virus no identificadas aumente a medida que la tasa de secuenciación de virus aumente drásticamente. [2]

La ICTV ha tenido un éxito sorprendente en el logro de la estabilidad, desde su creación en 1962. Todos los géneros y familias reconocidos en la década de 1980 continuaron en uso a partir de 2005, por ejemplo. [2]

Nombrar y cambiar taxones [ editar ]

Las propuestas de nuevos nombres, cambios de nombre y el establecimiento y ubicación taxonómica de los taxones son manejadas por el Comité Ejecutivo de la ICTV en forma de propuestas. Se consulta a todos los subcomités y grupos de estudio relevantes de ICTV antes de tomar una decisión.

El nombre de un taxón no tiene estatus oficial hasta que haya sido aprobado por ICTV, y los nombres solo serán aceptados si están vinculados a taxones jerárquicos aprobados. Si no se propone un nombre adecuado para un taxón, el taxón puede aprobarse y dejarse indeciso hasta que se adopte un nombre internacional aceptable, cuando ICTV proponga y acepte uno. Los nombres no deben transmitir un significado para el taxón que parezca excluir virus que son legítimamente miembros de ese taxón, excluir miembros que algún día podrían pertenecer a ese taxón o incluir virus que son miembros de diferentes taxones.

Reglas para taxones [ editar ]

Especies [ editar ]

El nombre de una especie debe constar de la menor cantidad de palabras posible, pero no debe consistir únicamente en un nombre de hospedador y la palabra virus . El nombre de una especie debe proporcionar una identificación inequívoca adecuada de la especie. Pueden usarse números, letras o combinaciones de los mismos como epítetos de especies cuando tales números y letras ya se usan ampliamente. Sin embargo, los números de serie, letras o combinaciones de los mismos recién designados no son aceptables por sí solos como epítetos de especies. Si existe una serie de números o letras, se puede continuar.

Genera [ editar ]

Un género de virus es un grupo de especies relacionadas que comparten algunas propiedades importantes y, a menudo, solo difieren en el rango de hospedadores y la virulencia. El nombre de un género debe ser una sola palabra terminada en el sufijo - virus . La aprobación de un nuevo género debe ir acompañada de la aprobación de una especie tipo .

Subfamilias [ editar ]

Una subfamilia es un grupo de géneros que comparten ciertos caracteres comunes. El taxón se utilizará solo cuando sea necesario para resolver un problema jerárquico complejo. El nombre de una subfamilia debe ser una sola palabra terminada en el sufijo - virinae .

Familias [ editar ]

Una familia es un grupo de géneros, estén o no organizados en subfamilias, que comparten ciertos caracteres comunes entre sí. Un apellido debe ser una sola palabra terminada en el sufijo - viridae .

Pedidos [ editar ]

Una orden es un grupo de familias que comparten ciertos caracteres en común. El nombre de un pedido debe ser una sola palabra terminada en el sufijo - virales .

Reglas para agentes subvirales [ editar ]

Las reglas relativas a la clasificación de virus también se aplicarán a la clasificación de viroides . Las terminaciones formales de los taxones de viroides son la palabra viroide para especies, el sufijo -viroide para géneros, el sufijo -viroinae para subfamilias, si se necesita este taxón, y -viroidae para familias.

Los retrotransposones se consideran virus en clasificación y nomenclatura. Los satélites y priones no se clasifican como virus, pero se les asigna una clasificación arbitraria que parece útil para los trabajadores en los campos particulares.

Reglas de ortografía [ editar ]

  1. En el uso taxonómico formal, los nombres aceptados de órdenes, familias, subfamilias y géneros de virus están impresos en cursiva y las primeras letras de los nombres en mayúscula. [7]
  2. Los nombres de las especies están impresos en cursiva y tienen la primera letra de la primera palabra en mayúscula. Otras palabras no se escriben con mayúscula a menos que sean nombres propios o partes de nombres propios.
  3. En el uso formal, el nombre del taxón debe preceder al término de la unidad taxonómica.

Clasificación de virus descubiertos por metagenómica [ editar ]

Reconociendo la importancia de la metagenómica viral, el ICTV reconoce que los genomas ensamblados a partir de datos metagenómicos representan virus reales y alienta su clasificación oficial siguiendo los mismos procedimientos que se usan para los virus aislados y caracterizados usando enfoques virológicos clásicos. [8] [9]

Informes de ICTV [ editar ]

La ICTV ha publicado informes de taxonomía de virus aproximadamente dos veces por década desde 1971 (enumerados a continuación: "Informes"). El noveno informe de ICTV se publicó en diciembre de 2011; [10] el contenido está ahora disponible gratuitamente a través del sitio web de ICTV. [11] A partir de 2017, el décimo informe de ICTV se publicará en línea en el sitio web de ICTV [12] y será de libre acceso con capítulos individuales actualizados de forma continua. La taxonomía de 2018 está disponible en línea [13], incluida una hoja de cálculo Excel descargable de todas las especies reconocidas.

Base de datos ICTVdb [ editar ]

ICTVdb es una base de datos de especies y aislamientos que se pretende que sirva como complemento de la base de datos de taxonomía de ICTV. El desarrollo de ICTVdB ha sido apoyado por ICTV desde 1991 y fue inicialmente destinado a ayudar a la investigación taxonómica. La base de datos clasifica los virus con base principalmente en sus características químicas, tipo genómico , replicación de ácidos nucleicos , enfermedades, vectores y distribución geográfica, entre otras características.

La base de datos fue desarrollada en la Universidad Nacional de Australia con el apoyo de la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU . Y patrocinada por la Colección de Cultivos Tipográficos de EE . Utiliza el sistema Description Language for Taxonomy ( DELTA ), un estándar mundial para el intercambio de datos taxonómicos, desarrollado por la Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO) de Australia. DELTA puede almacenar una amplia diversidad de datos y traducirlos a un lenguaje adecuado para informes tradicionales y publicación web. Por ejemplo, ICTVdB no contiene en sí mismo información de secuencia genómica, pero puede convertir datos DELTA al formato NEXUS. [14] También puede manejar grandes entradas de datos y es adecuado para compilar largas listas de propiedades de virus, comentarios de texto e imágenes.

ICTVdB ha crecido en concepto y capacidad para convertirse en un importante recurso de referencia y herramienta de investigación; en 1999 recibía más de 30.000 visitas en línea combinadas por día desde su sitio principal en la Universidad Nacional de Australia y dos sitios espejo con sede en el Reino Unido y Estados Unidos. [15]

En 2011, ICTV decidió suspender el proyecto y el sitio web de ICTVdb. Esta decisión se tomó después de que se hizo evidente que la taxonomía proporcionada en el sitio estaba desactualizada por muchos años, y que parte de la información en el sitio era inexacta debido a problemas con la forma en que se consultaba y procesaba la base de datos para respaldar el lenguaje natural. salida del sitio web ICTVdb. La ICTV ha iniciado discusiones sobre la mejor manera de solucionar estos problemas, pero decidió que el período de tiempo para las actualizaciones y la corrección de errores era lo suficientemente largo como para que lo mejor fuera cerrar el sitio en lugar de perpetuar la publicación de información inexacta. [ cita requerida ] En agosto de 2013, la base de datos permanece en espera. [3]Según algunos puntos de vista, "ICTV también debería promover el uso de una base de datos pública para reemplazar la base de datos de ICTV como un almacén de los metadatos primarios de virus individuales, y debería publicar resúmenes de los informes de ICTV en esa base de datos, para que estén abiertos Acceso'." [3]

Ver también [ editar ]

  • Glosario de denominación científica
  • Clasificación de virus
  • Bioinformática

Informes [ editar ]

  • Virus, Comité Internacional de Nomenclatura de; Wildy, Peter (1971). Clasificación y nomenclatura de virus . 1er informe. Agotado
  • Virus, Comité Internacional de Taxonomía de; Fenner, Frank (1976). Clasificación y nomenclatura de virus . 2do informe. ISBN 978-3805524186.
  • Virus, Comité Internacional de Taxonomía de; Matthews, Richard Ellis Ford; Sección de Virología, Asociación Internacional de Sociedades Microbiológicas (1979). Clasificación y nomenclatura de virus . 3er informe. ISBN 978-3805505239.
  • Ellis, Richard; Matthews, Ford, eds. (mil novecientos ochenta y dos). Clasificación y nomenclatura de virus . 4to informe. Karger. pag. 199. ISBN 9783805535571.
  • Virus, Comité Internacional de Taxonomía de; Francki, RI B (1991). Clasificación y nomenclatura de virus . 5to informe. ISBN 978-3211822869.
  • Murphy, Frederik A (1995). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus . 6to informe. ISBN 978-3211825945.
  • Virus, Comité Internacional de Taxonomía de; Van Regenmortel, MH V; Fauquet, C. M; Obispo, DH L (2000). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus . Séptimo informe. ISBN 978-0123702005.
  • Fauquet, CM, ed. (2005). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus . Octavo informe. Elsevier / Academic Press. ISBN 978-0080575483.
  • King, Andrew MQ; Lefkowitz, Elliot; Adams, Michael J .; et al., eds. (2011). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus . Noveno informe. Elsevier / Academic Press. pag. 1338. ISBN 9780123846846.También disponible en línea. [11]
  • Décimo informe de ICTV (en línea) [12]

Referencias [ editar ]

  1. ^ Rey, Andrew MQ; Lefkowitz, E .; Adams, MJ; Carstens, EB (2012). Clasificación de taxonomía de virus y nomenclatura de virus: Noveno informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Elsevier. ISBN 978-0-12-384684-6. Archivado desde el original el 10 de diciembre de 2017 . Consultado el 13 de abril de 2017 .
  2. ↑ a b c d e Fauquet CM, Fargette D (2005). "Comité internacional de taxonomía de virus y las 3.142 especies no asignadas" . Virol. J . 2 : 64. doi : 10.1186 / 1743-422X-2-64 . PMC 1208960 . PMID 16105179 .  
  3. ↑ a b c Gibbs AJ (2013). "La taxonomía viral necesita una limpieza profunda; su era de exploración ha terminado" . Virol. J . 10 : 254. doi : 10.1186 / 1743-422X-10-254 . PMC 3751428 . PMID 23938184 .  
  4. ^ "Datos bancarios diversos: los orígenes de ICTVdB" . 13 de noviembre de 2005. Archivado desde el original el 13 de noviembre de 2005 . Consultado el 6 de abril de 2018 .
  5. ^ "Copia archivada" . Archivado desde el original el 30 de septiembre de 2007 . Consultado el 22 de junio de 2006 .Mantenimiento de CS1: copia archivada como título ( enlace )
  6. ^ "Comité internacional de taxonomía de virus (ICTV)" . talk.ictvonline.org . Consultado el 17 de septiembre de 2020 .
  7. ↑ Ali, Muhammad (2016). "Hacia una nomenclatura coherente de virus vegetales" . Virologica Sinica . 31 (3): 197-198. doi : 10.1007 / s12250-016-3741-5 . PMID 27052507 . 
  8. ^ Simmonds P, Adams MJ, Benkő M, Breitbart M , Brister JR, Carstens EB, Davison AJ, Delwart E, Gorbalenya AE, Harrach B, Hull R, King AMQ, Koonin EV, Krupovic M, Kuhn JH, Lefkowitz EJ, Nibert ML, Orton R, Roossinck MJ, Sabanadzovic S, Sullivan MB, Suttle CA, Tesh RB, van der Vlugt RA, Varsani A, Zerbini FM (2017). "Declaración de consenso: taxonomía de virus en la era de la metagenómica" (PDF) . Nature Reviews Microbiología . 15 (3): 161-168. doi : 10.1038 / nrmicro.2016.177 . PMID 28134265 . Archivado (PDF) desde el original el 23 de julio de 2018 . Consultado el 18 de octubre   2019 .
  9. ^ Adams MJ, Lefkowitz EJ, King AM, Harrach B, Harrison RL, Knowles NJ, Kropinski AM, Krupovic M, Kuhn JH, Mushegian AR, Nibert ML, Sabanadzovic S, Sanfaçon H, Siddell SG, Simmonds P, Varsani A, Zerbini FM, Orton RJ, Smith DB, Gorbalenya AE, Davison AJ (2017). "50 años del Comité Internacional de Taxonomía de Virus: avances y perspectivas" (PDF) . Archivos de Virología . 162 (5): 1441–1446. doi : 10.1007 / s00705-016-3215-y . PMID 28078475 . Archivado (PDF) desde el original el 23 de julio de 2018 . Consultado el 17 de septiembre de 2019 .  
  10. ^ Rey, Andrew MQ; et al., eds. (2012). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus: noveno informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus . Londres: Academic Press. ISBN 978-0123846846. Archivado desde el original el 11 de septiembre de 2014 . Consultado el 9 de diciembre de 2014 .
  11. ^ a b "Comité internacional de taxonomía de virus (ICTV)" . talk.ictvonline.org . Archivado desde el original el 2 de abril de 2019 . Consultado el 18 de octubre de 2019 .
  12. ^ a b "Comité internacional de taxonomía de virus (ICTV)" . talk.ictvonline.org . Archivado desde el original el 1 de julio de 2019 . Consultado el 18 de octubre de 2019 .
  13. ^ "Comité internacional de taxonomía de virus (ICTV)" . talk.ictvonline.org . Archivado desde el original el 4 de marzo de 2018 . Consultado el 18 de octubre de 2019 .
  14. ^ Maddison DR, Swofford DL, Maddison WP (diciembre de 1997). "NEXUS: un formato de archivo extensible para información sistemática" . Syst. Biol . 46 (4): 590–621. doi : 10.1093 / sysbio / 46.4.590 . PMID 11975335 . 
  15. ^ "Datos bancarios diversos: los orígenes de ICTVdB" . 13 de noviembre de 2005. Archivado desde el original el 13 de noviembre de 2005 . Consultado el 18 de octubre de 2019 .

Enlaces externos [ editar ]

  • Página web oficial
  • "Historia de la ICTVdB" (PDF) . Archivado desde el original (PDF) el 7 de septiembre de 2006 . Consultado el 22 de junio de 2006 .
  • Centro de recursos de bioinformática viral
  • Gibbs, Adrian J (9 de agosto de 2013). "La taxonomía viral necesita una limpieza profunda; su era de exploración ha terminado" . Virología . 10 : 254. doi : 10.1186 / 1743-422X-10-254 . PMC  3751428 . PMID  23938184 . Resumen: El Comité Internacional de Taxonomía de Virus ha cambiado recientemente su definición aprobada de especie viral y también ha interrumpido el trabajo en su base de datos de descripción de virus.