John Moore nació en una de las familias nobles de Moore más antiguas de Inglaterra en 1599. A principios de la década de 1640, John Moore (que ahora era miembro del Parlamento de Liverpool ) estaba muy involucrado en el comercio marítimo inicial , forjando conexiones en Barbados . Cuando estalló la Guerra Civil Inglesa en Inglaterra en 1642, Moore juró lealtad a los parlamentarios Roundhead , al igual que la mayoría de los burgueses de Liverpool, que eran en gran parte de origen puritano . Los nobles y la nobleza formaban la mayor parte de los Cavaliers.(que tenía el control del castillo y la torre de Liverpool ), incluido el alcalde, John Walker. El castillo y el municipio fueron entregados a Lord Derby para los realistas .
En mayo de 1643, sin embargo, John Moore y sus parlamentarios se dispusieron a derribar el castillo, lo que lograron, sufriendo solo 7 muertos frente a los 80 muertos y 300 prisioneros de los realistas. La facción realista de Lancashire colapsó poco después. Después de que el castillo fue tomado, John Moore asumió el control tanto de él como del área que lo abarcaba, tomando el título de gobernador de Liverpool para sí mismo. Cromwell lo recompensó con el rango de coronel en su ejército parlamentario y también lo nombró vicealmirante del Parlamento de Cheshire y Lancashire .
Sin embargo, la victoria de Moore no iba a durar mucho tiempo, y Liverpool fue derrotado por debajo de él el 13 de junio de 1644 cuando el príncipe realista Rupert del Rin y su ejército de 10,000 forzaron una entrada a la ciudad alrededor del área de Old Hall Street. Los parlamentarios hicieron una fuerte defensa y se cobraron la vida de unos 1.500 realistas. Para cuando el príncipe Rupert llegó a la ciudad, John Moore y las tropas parlamentarias restantes ya habían abandonado la ciudad por la piscina.
Cuando las fuerzas parlamentarias de Sir John Meldrum recuperaron la ciudad seis meses después, John Moore volvió a estar al mando como gobernador .
Moore fue un partidario de Pride's Purge y, además de ayudar a organizar los arreglos de seguridad en el juicio del Rey Carlos. Fue signatario de la sentencia de muerte del rey en 1649.
En 1649, Moore luchó en Irlanda contra James Butler, primer duque de Ormonde y se convirtió en gobernador de Dublín . Murió allí de fiebre en 1650.