Los genes myb son parte de una gran familia de factores de transcripción que se encuentran en animales y plantas. En los seres humanos, incluye el protooncogén Myb como 1 y la proteína B relacionada con Myb además del MYB propiamente dicho. [5] [6] Los miembros de la familia SANT / Myb ampliada también incluyen el dominio SANT y otros dominios similares a homeobox totalmente helicoidales .
Dominio de unión al ADN similar a Myb | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | Enlace de Myb_DNA | |||||||
Pfam | PF00249 | |||||||
InterPro | IPR001005 | |||||||
CATH | 1irz | |||||||
SCOP2 | 1irz / SCOPe / SUPFAM | |||||||
CDD | cd00167 | |||||||
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MI B | |||||||||||||||||||||||||
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Identificadores | |||||||||||||||||||||||||
Alias | MYB , Cmyb, c-myb, c-myb_CDS, efg, protooncogén MYB, factor de transcripción | ||||||||||||||||||||||||
Identificaciones externas | OMIM : 189990 MGI : 97249 HomoloGene : 31311 GeneCards : MYB | ||||||||||||||||||||||||
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Ortólogos | |||||||||||||||||||||||||
Especies | Humano | Ratón | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 6: 135,18 - 135,22 Mb | Crónicas 10: 21,12 - 21,16 Mb | |||||||||||||||||||||||
Búsqueda en PubMed | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
Wikidata | |||||||||||||||||||||||||
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Función
Viral
La familia de genes Myb lleva el nombre del gen homónimo del virus de la mieloblastosis aviar . El Myb viral (v-Myb, P01104 ) reconoce la secuencia 5'- Y AAC K G-3 '. Causa mieloblastosis (leucemia mieloide) en pollos. [7] En comparación con el Myb celular animal normal (c-myb), v-myb contiene deleciones en el dominio regulador C-terminal, lo que conduce a una activación aberrante de otros oncogenes. [8]
Animales
La proteína del protooncogén myb es un miembro de la familia de factores de transcripción MYB ( my elo b lastosis) . La proteína contiene tres dominios, un dominio de unión al ADN N-terminal , un dominio de activación transcripcional central y un dominio C-terminal involucrado en la represión transcripcional . Puede desempeñar un papel en la regulación del ciclo celular. Al igual que la versión viral, este gen es un oncogén y los reordenamientos del gen (que a menudo implican una deleción en el dominio C-terminal) provocan cáncer. [8]
Plantas
Los factores MYB representan una familia de proteínas que incluye el dominio de unión al ADN MYB conservado. Las plantas contienen una subfamilia de proteínas MYB que se caracteriza por el dominio MYB de tipo R2R3. [9]
En el maíz, los flobafenos se sintetizan en la vía sintética de flavonoides [10] a partir de la polimerización de flavan-4-ols [11] [12] que codifica un activador transcripcional R2R3 similar a myb [13] del gen A1 que codifica el dihidroflavonol 4- reductasa (que reduce los dihidroflavonoles en flavan-4-oles) [14] mientras que otro gen (Supresor de la pigmentación del pericarpio 1 o SPP1) actúa como supresor . [15] El gen P del maíz codifica un homólogo de Myb que reconoce la secuencia CCWACC, en marcado contraste con el YAACGG unido por proteínas Myb de vertebrados. [dieciséis]
En el sorgo, el gen correspondiente de la semilla amarilla 1 (y1) [17] también codifica un tipo R2R3 de proteína de dominio Myb que regula la expresión de los genes de calcona sintasa , calcona isomerasa y dihidroflavonol reductasa necesarios para la biosíntesis de 3-desoxiflavonoides . [18]
Ruby es un activador transcripcional MYB de genes que producen antocianina en frutas cítricas. En la mayoría de las variedades de cítricos, Ruby no es funcional, pero en las naranjas sanguinas regula al alza la producción de antocianinas para producir el color rojo característico de la fruta. [19]
Ver también
- EZH1
Referencias
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118513 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019982 - Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Chen Y, Xu H, Liu J, Zhang C, Leutz A, Mo X (julio de 2007). "El c-Myb funciona como un objetivo aguas abajo de la señal de supervivencia mediada por PDGF en las células del músculo liso vascular". Biochem Biophys Res Commun . 360 (2): 433–6. doi : 10.1016 / j.bbrc.2007.06.078 . PMID 17599807 .
- ^ "Entrez Gene: homólogo de oncogén viral de mieloblastosis v-myb (aviar)" .
- ^ Klempnauer KH, Symonds G, Evan GI, Bishop JM (junio de 1984). "Localización subcelular de proteínas codificadas por oncogenes del virus de la mieloblastosis aviar y el virus de la leucemia aviar E26 y por el gen c-myb de pollo". Celular . 37 (2): 537–47. doi : 10.1016 / 0092-8674 (84) 90384-2 . PMID 6327074 . S2CID 46196167 .
- ^ a b George OL, Ness SA (octubre de 2014). "Conciencia situacional: regulación del factor de transcripción myb en la diferenciación, el ciclo celular y la oncogénesis" . Cánceres . 6 (4): 2049–71. doi : 10.3390 / cancers6042049 . PMC 4276956 . PMID 25279451 .
- ^ Stracke R, Werber M, Weisshaar B (octubre de 2001). "La familia de genes R2R3-MYB en Arabidopsis thaliana". Curr. Opin. Plant Biol . 4 (5): 447–56. doi : 10.1016 / s1369-5266 (00) 00199-0 . PMID 11597504 .
- ^ Himi E, Mares DJ, Yanagisawa A, Noda K (julio de 2002). "Efecto del gen del color del grano (R) sobre la latencia del grano y la sensibilidad del embrión al ácido abscísico (ABA) en el trigo" . J. Exp. Bot . 53 (374): 1569–74. doi : 10.1093 / jxb / erf005 . PMID 12096095 .
- ^ Winkel-Shirley B (junio de 2001). "Biosíntesis de flavonoides. Un modelo colorido de genética, bioquímica, biología celular y biotecnología" . Plant Physiol . 126 (2): 485–93. doi : 10.1104 / pp.126.2.485 . PMC 1540115 . PMID 11402179 .
- ^ Chopra S, Cocciolone SM, Bushman S, Sangar V, McMullen MD, Peterson T (marzo de 2003). "El factor inestable del maíz para orange1 es un modificador epigenético dominante de un alelo tisular específicamente silencioso del color del pericarpio1" . Genética . 163 (3): 1135–46. doi : 10.1093 / genetics / 163.3.1135 . PMC 1462483 . PMID 12663550 .
- ^ Análisis estructural y transcripcional del clúster complejo P1-wr en maíz. Wolfgang Goettel, Joachim Messing. XVI Conferencia de Genomas de Plantas y Animales Archivado el 18 de febrero de 2012 en la Wayback Machine.
- ^ Dong X, Braun EL, Grotewold E (septiembre de 2001). "Conservación funcional de las enzimas metabólicas secundarias de las plantas revelada por la complementación de mutantes flavonoides de Arabidopsis con genes de maíz" (PDF) . Plant Physiol . 127 (1): 46–57. doi : 10.1104 / pp.127.1.46 . PMC 117961 . PMID 11553733 .
- ^ Lee EA, Harper V (2002). "Supresor de la pigmentación del pericarpio 1 (SPP1), un nuevo gen implicado en la acumulación de flobafeno en el pericarpio de maíz (Zea mays L.)". Maydica . 47 (1): 51–58. INIST : 13772300
- ^ Grotewold E, Drummond BJ, Bowen B, Peterson T (1994). "El gen P homólogo a myb controla la pigmentación del flobafeno en los órganos florales del maíz activando directamente un subconjunto de genes biosintéticos de flavonoides". Celular . 76 (3): 543–554. doi : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90117-1 . PMID 8313474 . S2CID 42197232 .
- ^ Boddu J, Svabek C, Ibraheem F, Jones AD, Chopra S (2005). "Caracterización de un alelo de deleción de una semilla amarilla del gen Myb de sorgo que muestra pérdida de 3-desoxiflavonoides". Ciencia de las plantas . 169 (3): 542–552. doi : 10.1016 / j.plantsci.2005.05.007 . INIST : 16983977
- ^ Boddu J, Jiang C, Sangar V, Olson T, Peterson T, Chopra S (enero de 2006). "Caracterización comparativa estructural y funcional de duplicaciones de sorgo y maíz que contienen reguladores de transcripción de myb ortólogos de la biosíntesis de 3-desoxiflavonoides". Plant Mol. Biol . 60 (2): 185–99. doi : 10.1007 / s11103-005-3568-1 . PMID 16429259 . S2CID 23841582 .
- ^ Butelli E, Licciardello C, Zhang Y, Liu J, Mackay S, Bailey P, Reforgiato-Recupero G, Martin C (2012). "Los retrotransposones controlan la acumulación de antocianinas dependiente del frío y específica de la fruta en las naranjas sanguinas" . Célula vegetal . 24 (3): 1242–55. doi : 10.1105 / tpc.111.095232 . PMC 3336134 . PMID 22427337 .
Otras lecturas
- Oh IH, Reddy EP (1999). "La familia de genes myb en el crecimiento celular, diferenciación y apoptosis" . Oncogén . 18 (19): 3017–33. doi : 10.1038 / sj.onc.1202839 . PMID 10378697 .
- Nicolaides NC, Gualdi R, Casadevall C, Manzella L, Calabretta B (1991). "Autorregulación positiva de la expresión de c-myb a través de sitios de unión de Myb en la región flanqueante 5 'del gen c-myb humano" . Mol. Célula. Biol . 11 (12): 6166–76. doi : 10.1128 / mcb.11.12.6166 . PMC 361795 . PMID 1944282 .
- Kalkbrenner F, Guehmann S, Moelling K (1990). "Activación transcripcional por genes humanos c-myb y v-myb". Oncogén . 5 (5): 657–61. PMID 2189102 .
- Westin EH, Gorse KM, Clarke MF (1990). "Empalme alternativo del gen c-myb humano". Oncogén . 5 (8): 1117–24. PMID 2202948 .
- Dasgupta P, Reddy EP (1990). "Identificación de transcripciones empalmadas alternativamente para c-myb humano: clonación molecular y análisis de secuencia de secuencias del exón 9A de c-myb humano". Oncogén . 4 (12): 1419–23. PMID 2687764 .
- Janssen JW, Vernole P, de Boer PA, Oosterhuis JW, Collard JG (1986). "Sublocalización de c-myb a 6q21 ---- q23 por hibridación in situ y expresión de c-myb en un teratocarcinoma humano con reordenamientos 6q". Cytogenet. Cell Genet . 41 (3): 129–35. doi : 10.1159 / 000132217 . PMID 3007038 .
- Slamon DJ, Boone TC, Murdock DC, Keith DE, Press MF, Larson RA, Souza LM (1986). "Estudios del gen c-myb humano y su producto en leucemias agudas humanas". Ciencia . 233 (4761): 347–51. Código Bibliográfico : 1986Sci ... 233..347S . doi : 10.1126 / science.3014652 . PMID 3014652 .
- Majello B, Kenyon LC, Dalla-Favera R (1987). "Protooncogén c-myb humano: secuencia de nucleótidos del cDNA y organización del locus genómico" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 83 (24): 9636–40. doi : 10.1073 / pnas.83.24.9636 . PMC 387195 . PMID 3540945 .
- Szczylik C, Skorski T, Ku DH, Nicolaides NC, Wen SC, Rudnicka L, Bonati A, Malaguarnera L, Calabretta B (1993). "Regulación de la expresión de proliferación y citocinas de fibroblastos de médula ósea: papel de c-myb" . J. Exp. Med . 178 (3): 997–1005. doi : 10.1084 / jem.178.3.997 . PMC 2191153 . PMID 7688794 .
- Krieg J, Oelgeschläger M, Janknecht R, Lüscher B (1995). "Unión de ADN de alta afinidad de c-Myb de longitud completa nativa y sensibilidad proteolítica diferencial de sus dominios N- y C-terminales". Oncogén . 10 (11): 2221–8. PMID 7784067 .
- Jacobs SM, Gorse KM, Westin EH (1994). "Identificación de un segundo promotor en el protooncogén c-myb humano". Oncogén . 9 (1): 227–35. PMID 8302584 .
- Favier D, Gonda TJ (1994). "Detección de proteínas que se unen al motivo de cremallera de leucina de c-Myb". Oncogén . 9 (1): 305-11. PMID 8302594 .
- Glaser R, Lafuse WP, Bonneau RH, Atkinson C, Kiecolt-Glaser JK (1993). "Modulación asociada al estrés de la expresión de protooncogén en leucocitos de sangre periférica humana". Behav. Neurosci . 107 (3): 525–9. doi : 10.1037 / 0735-7044.107.3.525 . PMID 8329139 .
- Dash AB, Orrico FC, Ness SA (1996). "El motivo EVES media la regulación intermolecular e intramolecular de c-Myb" . Genes Dev . 10 (15): 1858–69. doi : 10.1101 / gad.10.15.1858 . PMID 8756344 .
- Vorbrueggen G, Lovrić J, Moelling K (1997). "Análisis funcional de fosforilación en serina 532 de c-Myb humano por MAP quinasa". Biol. Chem . 377 (11): 721-30. doi : 10.1515 / bchm3.1996.377.11.721 . PMID 8960373 .
- Tavner FJ, Simpson R, Tashiro S, Favier D, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Macmillan EM, Lutwyche J, Keough RA, Ishii S, Gonda TJ (1998). "La clonación molecular revela que la proteína de unión a Myb p160 es una nueva proteína predominantemente nucleolar que puede desempeñar un papel en la transactivación por Myb" . Mol. Célula. Biol . 18 (2): 989–1002. doi : 10.1128 / MCB.18.2.989 . PMC 108811 . PMID 9447996 .
- Hedge SP, Kumar A, Kurschner C, Shapiro LH (1998). "c-Maf interactúa con c-Myb para regular la transcripción de un gen mieloide temprano durante la diferenciación" . Mol. Célula. Biol . 18 (5): 2729–37. doi : 10.1128 / mcb.18.5.2729 . PMC 110652 . PMID 9566892 .
- Leverson JD, Koskinen PJ, Orrico FC, Rainio EM, Jalkanen KJ, Dash AB, Eisenman RN, Ness SA (1998). "Pim-1 quinasa y p100 cooperan para mejorar la actividad de c-Myb". Mol. Celular . 2 (4): 417-25. doi : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80141-0 . PMID 9809063 .
- Thompson MA, Rosenthal MA, Ellis SL, Friend AJ, Zorbas MI, Whitehead RH, Ramsay RG (1998). "La regulación por disminución de c-Myb está asociada con la diferenciación de células de colon humano, apoptosis y disminución de la expresión de Bcl-2". Cancer Res . 58 (22): 5168–75. PMID 9823328 .
- Verbeek W, Gombart AF, Chumakov AM, Müller C, Friedman AD, Koeffler HP (1999). "C / EBPepsilon interactúa directamente con el dominio de unión al ADN de c-myb y activa cooperativamente la transcripción de promotores mieloides" . Sangre . 93 (10): 3327–37. doi : 10.1182 / sangre.V93.10.3327 . PMID 10233885 .
enlaces externos
- MYB + proteína, + humano en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- Drosophila Myb similar a un oncogén : la mosca interactiva
- Familia MYB de Arabidospsis thaliana en la base de datos de factores de transcripción de Arabidopsis (DATF)
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .