Superfamilia facilitadora principal


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La superfamilia de facilitadores principales ( MFS ) es una superfamilia de proteínas de transporte de membrana que facilitan el movimiento de pequeños solutos a través de las membranas celulares en respuesta a gradientes quimiosmóticos . [1] [2]

Función

La superfamilia facilitadora principal (MFS) son proteínas de membrana que se expresan de manera ubicua en todos los reinos de la vida para la importación o exportación de sustratos diana. Originalmente se creía que la familia MFS funcionaba principalmente en la absorción de azúcares, pero estudios posteriores revelaron que los miembros de la familia MFS transportaban fármacos, metabolitos, oligosacáridos , aminoácidos y oxianiones . [3] Estas proteínas impulsan energéticamente el transporte utilizando el gradiente electroquímico del sustrato objetivo ( uniportador ), o actúan como un cotransportador donde el transporte se acopla al movimiento de un segundo sustrato.

Pliegue

El pliegue básico del transportador MFS se construye alrededor de 12, [4] o en algunos casos, 14 hélices transmembrana [5] (TMH), con dos haces de 6 (o 7) hélices formados por los dominios homólogos terminales N y C [6] del transportador que están conectados por un bucle citoplasmático extendido. Las dos mitades de la proteína se compactan entre sí en forma de concha, sellando mediante interacciones en los extremos de las hélices transmembrana y los bucles extracelulares. [7] [8] Esto forma una gran cavidad acuosa en el centro de la membrana, que alternativamente está abierta al citoplasma o al periplasma / espacio extracelular. Revestimiento de esta cavidad acuosa son losaminoácidos que se unen a los sustratos y definen la especificidad del transportador. [9] [10] Se cree que muchos transportadores de MFS son dímeros mediante métodos in vitro e in vivo , con algunas pruebas que sugieren un papel funcional para esta oligomerización . [11]

Mecanismo

El mecanismo de acceso alterno que se cree que subyace al transporte de la mayor parte del transporte MFS se describe clásicamente como el mecanismo de "interruptor basculante". [7] [8] En este modelo, el transportador se abre al espacio extracelular o al citoplasma y simultáneamente sella la cara opuesta del transportador, evitando una vía continua a través de la membrana. Por ejemplo, en el transportador MFS mejor estudiado, LacY , la lactosa y los protones se unen típicamente desde el periplasma a sitios específicos dentro de la hendidura acuosa. Esto impulsa el cierre de la cara extracelular y la apertura del lado citoplásmico, permitiendo que el sustrato entre en la célula. Tras la liberación del sustrato, el transportador se recicla a la orientación de cara periplásmica.

Estructura de LacY abierta al periplasma (izquierda) o al citoplasma (derecha). Los análogos de azúcar se muestran unidos en la hendidura de ambas estructuras.

Los exportadores y antiportadores de la familia MFS siguen un ciclo de reacción similar , aunque los exportadores se unen al sustrato en el citoplasma y lo extruyen al espacio extracelular o periplásmico, mientras que los antiportadores se unen al sustrato en ambos estados para impulsar cada cambio conformacional. Si bien la mayoría de las estructuras MFS sugieren cambios estructurales de cuerpo grandes y rígidos con unión al sustrato, los movimientos pueden ser pequeños en los casos de sustratos pequeños, como el transportador de nitrato NarK. [12]

Transporte

Las reacciones de transporte generalizadas catalizadas por los porteros MFS son:

  1. Uniport: S (salida) ⇌ S (entrada)
  2. Symport: S (salida) + [H + o Na + ] (salida) ⇌ S (entrada) + [H + o Na + ] (entrada)
  3. Antiport: S 1 (salida) + S 2 (entrada) ⇌ S 1 (entrada) + S 2 (salida) (S 1 puede ser H + o un soluto)

Especificidad del sustrato

Aunque inicialmente se identificó como transportadores de azúcar, una función conservada de los procariotas [10] a los mamíferos, [13] la familia MFS es notable por la gran diversidad de sustratos transportados por la superfamilia. Estos van desde pequeños oxianiones [14] [15] [16] hasta grandes fragmentos de péptidos. [17] Otros transportadores de MFS se destacan por la falta de selectividad, extruyendo amplias clases de fármacos y xenobióticos. [18] [19] [20] Esta especificidad de sustrato está determinada en gran medida por cadenas laterales específicas que recubren la bolsa acuosa en el centro de la membrana. [9] [10]Si bien a menudo se usa un sustrato de particular importancia biológica para nombrar el transportador o la familia, también puede haber iones o moléculas co-transportados o filtrados. Estos incluyen moléculas de agua [21] [22] o los iones de acoplamiento que impulsan energéticamente el transporte.

Estructuras

Reproducir medios
Estructura cristalina de GlpT en el estado orientado hacia adentro, con dominios helicoidales N y C coloreados de púrpura y azul respectivamente. Lazos de color verde.

Se han caracterizado las estructuras cristalinas de varios transportadores MFS. Las primeras estructuras fueron del intercambiador de glicerol 3-fosfato / fosfato GlpT [8] y el simportador lactosa - protón LacY , [7] que sirvieron para dilucidar la estructura general de la familia de proteínas y proporcionaron modelos iniciales para comprender el mecanismo de transporte de MFS. Desde estas estructuras iniciales, se han resuelto otras estructuras MFS que ilustran la especificidad del sustrato o estados dentro del ciclo de reacción. [23] [24] Si bien las estructuras iniciales de MFS resueltas fueron de transportadores bacterianos, recientemente se han publicado estructuras de las primeras estructuras eucariotas . Estos incluyen un transportador de fosfato fúngico PiPT, [16] transportador de nitrato vegetal NRT1.1, [11] [25] y el transportador de glucosa humana GLUT1 . [26]

Evolución

El origen del pliegue del transportador MFS básico está actualmente bajo un intenso debate. Todas las permeasas de MFS actualmente reconocidas tienen los dos dominios de seis TMH dentro de una única cadena polipeptídica, aunque en algunas familias de MFS están presentes dos TMH adicionales. La evidencia sugiere que las permeasas MFS surgieron por un evento de duplicación intragénica en tándem en los procariotas tempranos. Este evento generó la topología de las 12 hélices transmembrana a partir de un dímero de 6 hélices primordial (presunto). Además, el motivo específico de MFS bien conservado entre TMS2 y TMS3 y el motivo relacionado pero menos conservado entre TMS8 y TMS9 resulta ser una característica de prácticamente todas las más de 300 proteínas MFS identificadas. [27]Sin embargo, el origen del dominio primordial de 6 hélices está bajo un intenso debate. Si bien alguna evidencia funcional y estructural sugiere que este dominio surgió de un dominio de 3 hélices más simple, [28] [29] falta evidencia bioinformática o filogenética que apoye esta hipótesis. [30] [31]

Importancia médica

Los miembros de la familia MFS son fundamentales para la fisiología humana y desempeñan un papel importante en una serie de enfermedades, a través de una acción aberrante, transporte de fármacos o resistencia a los fármacos. El transportador OAT1 transporta varios análogos de nucleósidos fundamentales para la terapia antiviral. [32] La resistencia a los antibióticos es con frecuencia el resultado de la acción de los genes de resistencia al MFS. [33] También se ha descubierto que las mutaciones en los transportadores de MFS causan enfermedades neurodegerativas, [34] trastornos vasculares del cerebro, [35] y enfermedades por almacenamiento de glucosa. [36]

Mutaciones de enfermedades

Se han encontrado mutaciones asociadas a enfermedades en varios transportadores de MFS humanos; los anotados en Uniprot se enumeran a continuación.

Proteínas MFS humanas

Hay varias proteínas MFS en humanos, donde se las conoce como portadores de solutos (SLC) y SLC atípicos . [62] Actualmente existen 52 familias de SLC, [63] de las cuales 16 familias incluyen proteínas MFS; SLC2, 15 16, 17, 18, 19, SLCO (SLC21), 22, 29, 33, 37, 40, 43, 45, 46 y 49. [62] Las SLC atípicas son proteínas MFS, que comparten similitudes de secuencia y origen evolutivo con SLC, [62] [64] [65] [66] pero no se nombran de acuerdo con el sistema de raíces SLC, que se origina en el sistema de nomenclatura del gen hugo (HGNC). [67] Todos los SLC atípicos se enumeran en detalle en, [62] pero son: MFSD1, [66] MFSD2A , [68] MFSD2B , MFSD3 , [66] MFSD4A , [69] MFSD4B , [70] MFSD5 , [64] MFSD6 , [65] MFSD6L , MFSD8 , [71] MFSD9 , [65] [69 ] MFSD10 , [65] [72] MFSD11 , [64] MFSD12 , MFSD13A , MFSD14A , [65] [73] MFSD14B , [65] [73] UNC93A, [74] [75] [76] UNC93B1 , [77] SV2A , SV2B , SV2C , SVOP , SVOPL , SPNS1 , [78] SPNS2 , SPNS3 y CLN3 . [79] Dado que existe una alta identidad de secuencia y semejanza filogenética entre las SLC atípicas del tipo MFS, se pueden dividir en 15 AMTF (familias transportadoras atípicas de MFS), lo que sugiere que hay al menos 64 familias diferentes que incluyen proteínas SLC de tipo MFS. [80]

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