Metallosphaera hakonensis
Metallosphaera hakonensis es una arquea termoacidofílica gramnegativadescubierta en las aguas termales del Parque Nacional Hakone , Kanagawa, Japón . [1]
Metallosphaera hakonensis fue aislada en 1996 por Takayanagi et al. de una fuente termal en el Parque Nacional Hakone en Kanagawa, Japón. [1] Originalmente clasificado como miembro del género Sulfolobus , [1] Kurosawa et al. determinó mediante pruebas genéticas que el organismo pertenece al género Metallosphaera en 2003. [2] Takayanagi et al. determinaron un 92% de similitud con especies de S ulfolobus ; sin embargo, Kurosawa et al. determinó un 98% de similitud con especies de Metallosphaera . [1] [2]Usando el método de cromatografía líquida de alto rendimiento más preciso , Kurosawa et al. también determinó un nuevo contenido de G+C (43,29%) que es característico de las especies de Metallosphaera . [2]
Takayanagi et al . recolectó una muestra de agua de una fuente termal en el Parque Nacional Hakone en Kanagawa, Japón, con un pH de 1,5 y una temperatura de 91,5 °C. [1] Se preparó una dilución de 1:10 ml de la muestra y medio de Allen modificado, un medio conocido por sustentar especies de Sulfolobus , y se incubó a 70 °C durante aproximadamente una semana. [1] Luego, esta muestra se usó para formar una dilución de 1:9 ml con medio de Allen y una porción se sembró en placas de Geltrite al 1,0 % que contenían medio de Allen durante el crecimiento exponencial. [1] Después de la incubación a 70 °C, se utilizó una colonia aislada de M. hakonensis para inocular caldo fresco, se incubó y se sembró en placas. [1]Este procedimiento se realizó una vez más para aislar las arqueas. [1]
M. hakonensis puede crecer en temperaturas entre 50 °C y 80 °C y entre valores de pH de 1,0 y 4,0. [1] Las condiciones óptimas de crecimiento de M. hakonensis son 70 °C y pH 3,0. [1] Algunas especies de Metallosphaera , como M. prunae , son móviles por medio de flagelos ; sin embargo, M. hakonensis no tiene flagelo. [2] M. hakonensis es gramnegativo y tiene células esféricas o irregulares con forma de poliedro (células con forma de lóbulo), que tienen un diámetro de 0,9 a 1,1 m. [1]
M. hakonensis tiene un genoma de aproximadamente 2,3 Mbps de largo y tiene un contenido de G+C del 43,29 % determinado a través de Ion Torrent Sequencing y ensamblado con el software Newbler v. 2.8 . [3] [4] El genoma de M. hakonensis contiene 3357 genes que codifican proteínas y 57 genes de ARN determinados mediante los métodos de llamada de genes del Joint Genome Institute y la canalización de anotaciones de IMG [3] Los vecinos cercanos incluyen Metallosphaera prunae, M. sedula y M. yellowstonensis . [2] M. hakonensis tiene una similitud del 98 % en la secuencia del ARNr 16S con los otros miembros del género Metallosphaera' . [2]
La secuenciación del genoma de M. hakonensis ha revelado la presencia de genes que codifican la enzima ureasa , con genes presentes para las subunidades A y B. [3] La ureasa cataliza la degradación de la urea a amoníaco y bicarbonato . [5] Las secuencias también revelaron la presencia de genes para la haloacetato deshalogenasa . [3] La haloacetato deshalogenasa cataliza la conversión de haloacetato en glicolato y el ion haluro (p. ej., fluoruro ). [3] M. hakonensis también contiene el gen de la maleilacetato reductasa, un componente clave en la degradación biológica de compuestos orgánicos aromáticos halogenados. [6] [3]