Vecino-red
NeighbourNet [1] es un algoritmo para construir redes filogenéticas que se basa libremente en el algoritmo de unión de vecinos . Al igual que la unión de vecinos, el método toma una matriz de distancia como entrada y funciona aglomerando grupos. Sin embargo, el algoritmo de NeighbourNet puede conducir a colecciones de grupos que se superponen y no forman una jerarquía , y se representan mediante un tipo de red filogenética llamada gráfico de divisiones . Si la matriz de distancia satisface las condiciones combinatorias de Kalmanson , Neighbour-net devolverá el orden circular correspondiente. [2] [3] El método se implementa en elPaquetes SplitsTree y R / Phangorn [4] [5] .
Se pueden encontrar ejemplos de la aplicación de Neighbour-net en virología, [6] horticultura, [7] genética de dinosaurios, [8] lingüística comparada , [9] y arqueología. [10]
