DivisionesÁrbol

DivisionesÁrbol
Desarrollador (es)	Daniel Huson y David Bryant

Lanzamiento estable	4.17.1 / 2021
Versión de vista previa	5.3 / 2021

Sistema operativo	Windows, Linux, Mac OS X
Escribe	Bioinformática
Licencia	Propiedad
Sitio web	https://uni-tuebingen.de/fakultaeten/mathematisch-naturwissenschaftliche-fakultaet/fachbereiche/informatik/lehrstuehle/algorithms-in-bioinformatics/software/splitstree/

SplitsTree es un popular programa gratuito para inferir árboles filogenéticos , redes filogenéticas o, más generalmente, gráficos de divisiones , a partir de varios tipos de datos, como una alineación de secuencia , una matriz de distancia o un conjunto de árboles. ^[1]^[2] SplitsTree implementa métodos publicados como descomposición dividida , ^[3] redes vecinas , redes de consenso, ^[4] métodos de súper redes o métodos para calcular la hibridación o redes de recombinación simple . Utiliza el formato de archivo NEXUS. El gráfico de divisiones se define mediante un bloque de datos especial (bloque SPLITS).

Un ejemplo de una red filogenética de red de vecinos generada por SplitsTree v4.6.

Ver también

^ Vestido, A .; KT Huber; V. Moulton (2001). "Espacios métricos en matemáticas puras y aplicadas" (PDF) . Documenta Mathematica : 121-139.
^ Huson, DH; D. Bryant (2006). "Aplicación de redes filogenéticas en estudios evolutivos" . Mol. Biol. Evol . 23 (2): 254-267. doi : 10.1093 / molbev / msj030 . PMID 16221896 .
^ Bandelt, HJ; Vestido, AW (1992). "Descomposición dividida: un enfoque nuevo y útil para el análisis filogenético de datos de distancia". Filogenética molecular y evolución . 1 (3): 242–252. doi : 10.1016 / 1055-7903 (92) 90021-8 . ISSN 1055-7903 . PMID 1342941 .
^ Holanda, Barbara; Moulton, Vincent (2003). Benson, Gary; Page, Roderic DM (eds.). "Redes de consenso: un método para visualizar incompatibilidades en colecciones de árboles". Algoritmos en Bioinformática . Apuntes de conferencias en Ciencias de la Computación. Springer Berlín Heidelberg. 2812 : 165-176. doi : 10.1007 / 978-3-540-39763-2_13 . ISBN 9783540397632.

Página de inicio de SplitsTree (Nuevo sitio web para obtener información sobre SplitsTree)
Página de descarga alternativa para la última versión (4.15) y el manual (junio de 2019), alojado por el Departamento de Ciencias de la Computación de la Universidad Eberhard Karls de Tübingen
Algoritmos en bioinformática , el grupo de trabajo de Daniel Huson que desarrolla SplitsTree y otro software de bioinformática
Lista de software de filogenia , alojado en la Universidad de Washington
El mundo genealógico de las redes filogenéticas proporciona una amplia gama de ejemplos de gráficos divididos, la mayoría de los cuales se generaron con SplitsTree
Who is Who en Phylogenetic Networks enumera software, investigadores y literatura que se ocupa de las redes filogenéticas

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