familia NiCoT


Las proteínas que actualmente se sabe que pertenecen a la familia de transportadores Ni 2+ -Co 2+ (NiCoT) ( TC# 2.A.52 ) se pueden encontrar en organismos que van desde bacterias gramnegativas y grampositivas hasta arqueas y algunos eucariotas . Los miembros de esta familia catalizan la captación de Ni 2+ y/o Co 2+ en un proceso dependiente de la fuerza motriz del protón . [1]

Estas proteínas varían en tamaño de aproximadamente 300 a 400 residuos de aminoacilo y poseen 6, 7 u 8 segmentos transmembrana (TMS), que se cree que son el resultado de una duplicación intragénica de 4 TMS, seguida de una eliminación de uno o dos TMS en los casos de las 7 o 6 proteínas TMS. Los análisis topológicos con el transportador HoxN Ni 2+ de Ralstonia eutropha ( Alcaligenes eutrophus ) sugieren que posee 8 TMS con sus terminales N y C en el citoplasma. El transportador Co 2+ (Ni 2+ ) de Rhodococcus rhodochrous , NhlF, exhibe ocho TMS putativos y ocho TMS aparentes revelados por hidropatíaanálisis de múltiples alineaciones de secuencias de proteínas familiares. Un motivo HX 4 DH en la hélice 2 de la proteína HoxN se ha implicado en la unión de Ni 2+ , y tanto la hélice 1 como la hélice 2, que interactúan espacialmente, forman el filtro de selectividad. [2] En el homólogo NixA de Helicobacter pylori , se ha demostrado que varios motivos conservados son importantes para la unión y el transporte de Ni 2+ . [1] [3]

Varias proteínas caracterizadas pertenecen a la familia de transportadores Ni 2+ -Co 2+ (NiCoT) (TC# 2.A.43). En la base de datos de clasificación de transportadores se puede encontrar una lista completa de estas proteínas junto con sus números de identificación de clasificación de transportadores (TCID), dominio, reino/filo y algunos ejemplos .