La familia Nucleobase cation symporter-2 (NCS2), también llamada familia Nucleobase ascorbate transporter (NAT), [1] consta de más de 1000 proteínas secuenciadas derivadas de bacterias gramnegativas y gram positivas , arqueas, hongos, plantas y animales. La familia NCS2 / NAT es un miembro de la superfamilia APC de portadores secundarios. [2] De las cinco familias conocidas de transportadores que actúan sobre nucleobases, NCS2 / NAT es el único que está más extendido. [3] Muchos miembros funcionalmente caracterizados son específicos para nucleobases que incluyen tanto purinas como pirimidinas, pero otros son específicos de purina. Sin embargo, dos miembros de la familia de ratas / humanos estrechamente relacionados, SVCT1 y SVCT2, localizados en diferentes tejidos del cuerpo, co-transportan L-ascorbato ( vitamina C ) y Na + con un alto grado de especificidad y alta afinidad por la vitamina . [4] La agrupación de miembros de la familia NCS2 / NAT en el árbol filogenético es compleja, con proteínas bacterianas y proteínas eucariotas, cada una de las cuales se divide en al menos tres agrupaciones distintas. Las proteínas vegetales y animales se agrupan libremente, pero las proteínas fúngicas se ramifican a partir de uno de los tres grupos bacterianos formando una agrupación más estrecha. [5] E. coliposee cuatro miembros parálogos lejanos de la familia NCS2. [6]
Las proteínas de la familia NCS2 tienen una longitud de 414 a 650 residuos de amino acilo y probablemente poseen 14 TMS. Lu y col. (2011) han concluido a partir de la cristalografía de rayos X que UraA ( 2.A.40.1.1 ) tiene 14 TMS con dos repeticiones de 7 TMS invertidas. [7] Uracil se encuentra en la interfaz entre los dos dominios. [2]
Varias proteínas forman la familia NCS2 / NAT. Se puede encontrar una lista completa de estas proteínas en la base de datos de clasificación de transportadores . Algunos tipos de proteínas que componen la familia NCS2 / NAT incluyen: [6]