Las Pectobacteriaceae son una familia de bacterias Gram-negativas que consisten en gran parte en patógenos de plantas. Esta familia es miembro del orden Enterobacterales en la clase Gammaproteobacteria del phylum Proteobacteria . [1] La especie tipo de esta familia es Pectobacterium . [2]
El nombre Pectobacteriaceae se deriva del término latino Pectobacterium , refiriéndose al género tipo de la familia y el sufijo "-aceae", una terminación utilizada para denotar una familia. En conjunto, Pectobacteriaceae se refiere a una familia cuyo tipo nomenclatural es el género Pectobacterium . [1]
Los miembros de la familia producen ácido a partir de N-acetilglucosamina y son negativos para arginina dihidrolasa, ortinina descarboxilasa y lisina descarboxilasa. Estas bacterias son catalasa positivas, oxidasa negativas y no producen disulfuro de hidrógeno.
Los análisis genómicos identificaron cuatro indeles característicos conservados (CSI) que son específicos de esta familia en las proteínas activadoras transcripcionales RhaS , la proteína motora flagelar MotB, una proteína sensora de histidina quinasa de dos componentes y una proteína hipotética. [1] Estas firmas moleculares proporcionan un medio molecular fiable para distinguir a los miembros de la familia Pectobacteriaceae de otras familias del orden Enterobacterales y otras bacterias.
Pectobacteriaceae , a partir de 2021, contiene ocho géneros válidamente publicados. [2] Los miembros de esta familia eran originalmente miembros de la familia Enterobacteriaceae , un gran grupo de especies sin relación filogenética con características bioquímicas distintas y diferentes nichos ecológicos. La asignación original de las especies a la familia Enterobacteriaceae se basó en gran medida en los análisis de la secuencia del genoma del ARNr 16S, que se sabe que tiene un poder discriminatorio bajo y cuyos resultados dependen del algoritmo y la información del organismo utilizada. A pesar de esto, los análisis aún exhibieron ramificaciones polifiléticas, lo que indica la presencia de distintos subgrupos dentro de la familia. [1]
En 2016, Adeolu et al. propuso la división de Enterobacteriaceae en 7 nuevas familias basadas en análisis genómicos comparativos y el patrón de ramificación de varios árboles filogenéticos construidos a partir de secuencias genómicas conservadas, secuencias de ARNr 16S y análisis de secuencias multilocus. Marcadores moleculares, indeles de firma específicamente conservados , específicos de esta familia también se identificaron como evidencia que respalda la división independiente de los árboles filogenéticos. [1]