En enzimología , una fitoil-CoA dioxigenasa ( EC 1.14.11.18 ) es una enzima que cataliza la reacción química.
fitanoil-CoA dioxigenasa | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() La estructura de la PAHX humana ( PDB : 2A1X ). El cofactor Fe (II) se muestra como una esfera naranja, coordinada por dos residuos de histidina y un aspartato (mostrado en verde) y por el cosustrato de 2-oxoglutarato (mostrado en amarillo). [1] | ||||||||
Identificadores | ||||||||
CE no. | 1.14.11.18 | |||||||
No CAS. | 185402-46-4 | |||||||
Bases de datos | ||||||||
IntEnz | Vista IntEnz | |||||||
BRENDA | Entrada BRENDA | |||||||
FÁCIL | NiceZyme vista | |||||||
KEGG | Entrada KEGG | |||||||
MetaCyc | camino metabólico | |||||||
PRIAM | perfil | |||||||
Estructuras PDB | RCSB PDB PDBe PDBsum | |||||||
Ontología de genes | AmiGO / QuickGO | |||||||
|
fitoil-CoA 2-hidroxilasa | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
Identificadores | ||||||
Símbolo | PHYH | |||||
Alt. simbolos | PAHX | |||||
Gen NCBI | 5264 | |||||
HGNC | 8940 | |||||
OMIM | 602026 | |||||
RefSeq | NM_001037537 | |||||
UniProt | O14832 | |||||
Otros datos | ||||||
Lugar | Chr. 10 p15.3-10p12.2 | |||||
|
- fitoil-CoA + 2-oxoglutarato + O 22-hidroxiftanoil-CoA + succinato + CO 2
Los tres sustratos de esta enzima son phytanoyl-CoA , 2-oxoglutarate (2OG) y O 2 , mientras que sus tres productos son 2-hydroxyphytanoyl-CoA , succinato y CO 2 .
Esta enzima pertenece a la familia de las oxigenasas dependientes del hierro (II) , que normalmente incorporan un átomo de dioxígeno al sustrato y un átomo al grupo carboxilato succinato. El mecanismo es complejo, pero se cree que implica la unión ordenada de 2-oxoglutarato a la enzima que contiene hierro (II) seguida del sustrato. La unión del sustrato provoca el desplazamiento de una molécula de agua del cofactor de hierro (II), dejando una posición de coordinación vacante a la que se une el dioxígeno. Se produce un reordenamiento para formar una especie de hierro-oxígeno de alta energía (que generalmente se piensa que es una especie de hierro (IV) = O) que realiza la reacción de oxidación real. [2] [3]
Nomenclatura
El nombre sistemático de esta clase de enzimas es fitoil-CoA, 2-oxoglutarato: oxidorreductasa de oxígeno (2-hidroxilante) . Esta enzima también se llama fitoil-CoA hidroxilasa y fitoil-CoA alfa-hidroxilasa . [4]
Ejemplos de
En los seres humanos, hidroxilasa phytanoyl-CoA es codificada por el PHYH ( aka PAHX ) gen y es necesario para la alfa-oxidación de cadena ramificados ácidos grasos (por ejemplo, ácido fitánico ) en los peroxisomas . La deficiencia de PHYH da como resultado la acumulación de grandes reservas tisulares de ácido fitánico y es la principal causa de la enfermedad de Refsum . [5]
Enzimas relacionadas
Las oxigenasas dependientes de hierro (II) y 2OG son comunes en microorganismos , plantas y animales; el genoma humano se predice que contienen alrededor de 80 ejemplos, y el modelo de la planta Arabidopsis thaliana probablemente contiene más. [2] En plantas y microorganismos, esta familia de enzimas está asociada con una gran diversidad de reacciones oxidativas. [6]
Referencias
- ^ McDonough MA, Kavanagh KL, Butler D, Searls T, Oppermann U, Schofield CJ (diciembre de 2005). "La estructura de la fitoil-CoA 2-hidroxilasa humana identifica los mecanismos moleculares de la enfermedad de Refsum" . La revista de química biológica . 280 (49): 41101–10. doi : 10.1074 / jbc.M507528200 . PMID 16186124 .
- ^ a b Hausinger, Robert P. (2015). "CAPÍTULO 1. Diversidad bioquímica de oxigenasas dependientes de 2-oxoglutarato" . Oxigenasas dependientes de 2-oxoglutarato . Metalobiología. págs. 1-58. doi : 10.1039 / 9781782621959-00001 . ISBN 978-1-84973-950-4. S2CID 85596364 .
- ^ Martinez S, Hausinger RP (agosto de 2015). "Mecanismos catalíticos de Fe (II) - y oxigenasas dependientes de 2-oxoglutarato" . La revista de química biológica . 290 (34): 20702-11. doi : 10.1074 / jbc.R115.648691 . PMC 4543632 . PMID 26152721 .
- ^ "PHYH fitoil-CoA 2-hidroxilasa [Homo sapiens (humano)]" . Centro Nacional de Información Biotecnológica .
- ^ Mihalik SJ, Morrell JC, Kim D, Sacksteder KA, Watkins PA, Gould SJ (octubre de 1997). "Identificación de PAHX, un gen de la enfermedad de Refsum". Genética de la naturaleza . 17 (2): 185–9. doi : 10.1038 / ng1097-185 . PMID 9326939 . S2CID 39214017 .
- ^ McDonough MA, Loenarz C, Chowdhury R, Clifton IJ, Schofield CJ (diciembre de 2010). "Estudios estructurales sobre oxigenasas dependientes de 2-oxoglutarato humano". Opinión actual en biología estructural . 20 (6): 659–72. doi : 10.1016 / j.sbi.2010.08.006 . PMID 20888218 .
Otras lecturas
- Jansen GA, Mihalik SJ, Watkins PA, Jakobs C, Moser HW, Wanders RJ (marzo de 1998). "Caracterización de la fitoil-coenzima A hidroxilasa en hígado humano y medidas de actividad en pacientes con trastornos peroxisomales". Clinica Chimica Acta; Revista Internacional de Química Clínica . 271 (2): 203-11. doi : 10.1016 / S0009-8981 (97) 00259-3 . PMID 9565335 .
- Jansen GA, Mihalik SJ, Watkins PA, Moser HW, Jakobs C, Denis S, Wanders RJ (diciembre de 1996). "Phytanoyl-CoA hidroxilasa está presente en el hígado humano, ubicado en peroxisomas, y deficiente en el síndrome de Zellweger: evidencia directa e inequívoca de la nueva vía revisada de alfa-oxidación del ácido fitánico en humanos". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 229 (1): 205–10. doi : 10.1006 / bbrc.1996.1781 . PMID 8954107 .
- Jansen GA, Ofman R, Ferdinandusse S, Ijlst L, Muijsers AO, Skjeldal OH, Stokke O, Jakobs C, Besley GT, Wraith JE, Wanders RJ (octubre de 1997). "La enfermedad de Refsum es causada por mutaciones en el gen de la hidroxilasa de fitoil-CoA". Genética de la naturaleza . 17 (2): 190–3. doi : 10.1038 / ng1097-190 . PMID 9326940 . S2CID 5856245 .
- Mihalik SJ, Rainville AM, Watkins PA (septiembre de 1995). "Alfa-oxidación del ácido fitánico en peroxisomas de hígado de rata. La producción de alfa-hidroxiftanoil-CoA y formiato se mejora mediante cofactores de dioxigenasa". Revista europea de bioquímica / FEBS . 232 (2): 545–51. doi : 10.1111 / j.1432-1033.1995.545zz.x . PMID 7556205 .
enlaces externos
- Entrada de GeneReviews / NCBI / NIH / UW sobre la enfermedad de Refsum