La proteína 21 rica en prolina (PRR21) es una proteína de la familia de proteínas ricas en prolina . Está codificado por el gen PRR21, que se encuentra en el cromosoma 2 humano , banda 2q37.3. [2] El gen existe en varias especies, tanto vertebrados como invertebrados , incluidos los humanos. [3] Sin embargo, la proteína tiene pocas regiones conservadas entre las especies.
PRR21 |
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Identificadores |
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Alias | PRR21 , proteína rica en prolina 21, rica en prolina 21 |
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Identificaciones externas | HomoloGene : 135702 GeneCards : PRR21 |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | | |
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RefSeq (proteína) | | |
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Ubicación (UCSC) | n / A | n / A |
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Búsqueda en PubMed | [1] | n / A |
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Wikidata |
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PRR21 consta de 389 aminoácidos o 1170 pares de bases , todos encontrados dentro de un exón . Como otras proteínas ricas en prolina, contiene una secuencia repetida de aminoácidos que contiene varios residuos de prolina . [4] La secuencia repetida en tándem de PRR21 tiene 28 aminoácidos de longitud y se repite en su totalidad 11 veces, con pocas variaciones. A continuación se muestra un logotipo que muestra las variaciones de la repetición. [5] Las repeticiones constituyen casi toda la proteína, excepto el principio y una cola corta.
Secuencia repetida de PRR21 humano.
Polimorfismo
Se predicen muchos polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) para el gen, y varios de ellos causan mutaciones sin sentido . [6] Esto permite variaciones personales dentro de la población y contribución a la "singularidad" de cada individuo. [7]
Modificaciones postraduccionales
PRR21 tiene 28 posibles sitios de fosforilación . [8] Estos siguen los patrones de la secuencia repetida. [9] 22 de los 28 sitios de fosforilación se encuentran en las serinas de las posiciones 9 y 24 de la repetición, ambos muy conservados. Sin embargo, estos SNP pueden cambiar estas serinas. [10] La fosforilación generalmente activa o inactiva una proteína. [11] La proteína no tiene sitios potenciales de modificación de GPI. [12] No se prevé que PRR21 interactúe con otras proteínas.
Ilustración de los sitios de fosforilación previstos.
PRR21 no tiene parálogos y pocos ortólogos . Los ortólogos están mal conservados, ya que las proteínas ricas en prolina carecen de la necesidad de especificidad. [4] Lo más importante es que tienen una estructura suelta y contienen muchas prolina. Las repeticiones a menudo funcionan como espaciadores solo para hacer que la proteína sea lo suficientemente grande como para interactuar con otras proteínas. [4] Por lo tanto, los ortólogos a menudo se ven diferentes.
Existe una probabilidad del 99,97% de que PRR21 entre en las mitocondrias . [13] PRR21 puede estar involucrado en respuestas de estrés que están relacionadas con la fosforilación de proteínas mitocondriales. [14] El gen se expresa de forma ubicua, ya que casi todas las células eucariotas contienen mitocondrias. [15] PRR21 puede ser una proteína salival, ya que la secuencia repetida en tándem constituye casi la proteína completa, que es una característica común de las proteínas salivales ricas en prolina. [4]
Hay varios tipos de proteínas ricas en prolina, que pueden incluir secuencias cortas repetitivas o secuencias repetidas en tándem . Tienen en común que las repeticiones, y solo las repeticiones, contienen cantidades inusuales de prolina. Tienen una estructura suelta, causada por varias características; las prolinas tienen una forma que hace que la cadena gire, y sobre todo previene las hélices alfa . Además, las proteínas contienen muchos residuos cargados positivamente que se repelen entre sí. Esto da como resultado proteínas sueltas que son adecuadas como proteínas de unión. Estas interacciones de unión pueden ser interacciones hidrófobas ya que las proteínas ricas en prolina tienden a tener regiones hidrófobas expuestas. Las propias prolinas funcionan como sitios de unión adicionales para los enlaces de hidrógeno al ser fuertes aceptores de hidrógeno. [4]