Pseudomonas


Pseudomonas es un género de Gram-negativas , Gammaproteobacteria , perteneciente a la familia Pseudomonadaceae y que contiene 191 especies válidamente descritas. [1] Los miembros del género demuestran una grandiversidad metabólica y, en consecuencia, pueden colonizar una amplia gama de nichos. [2] Su facilidad de cultivo in vitro y la disponibilidad de un número cada vez mayor desecuencias del genoma de la cepade Pseudomonas ha convertido al género en un foco excelente para la investigación científica; las especies mejor estudiadas incluyen P. aeruginosa en su papel de oportunistapatógeno humano , el patógeno vegetal P. syringae , la bacteria del suelo P. putida y el P. fluorescens , P. lini , P. migulae y P. graminis que promueven el crecimiento de las plantas . [3] [4]

Debido a su presencia generalizada en el agua y en semillas de plantas como las dicotiledóneas , las pseudomonas se observaron al principio de la historia de la microbiología . El nombre genérico creado por Pseudomonas para estos organismos fue definido en términos bastante vagos por Walter Migula en 1894 y 1900 como un género de bacterias gramnegativas, con forma de bastoncillo y flageladas polares con algunas especies esporulantes. [5] [6] La última afirmación se demostró más tarde que era incorrecta y se debía a los gránulos refractivos de los materiales de reserva. [7] A pesar de la vaga descripción, la especie tipo, Pseudomonas pyocyanea (basónimo dePseudomonas aeruginosa ), resultó ser el mejor descriptor. [7]

Como la mayoría de los géneros bacterianos, la pseudomónada [nota 1] último ancestro común vivió hace cientos de millones de años. Inicialmente se clasificaron a fines del siglo XIX cuando Walter Migula los identificó por primera vez . La etimología del nombre no se especificó en el momento y apareció por primera vez en la séptima edición del Bergey Manual de Bacteriología Sistemática (la principal autoridad en la nomenclatura bacteriana) como griegos pseudes (ψευδής) "falso" y -monas (μονάς / μονάδος) " una sola unidad ", que puede significar una unidad falsa; sin embargo, Migula posiblemente lo pretendió como falso Monas , un protista nanoflagelado [7](posteriormente, el término "mónada" se utilizó en la historia temprana de la microbiología para designar organismos unicelulares). Pronto, otras especies que coincidían con la descripción original algo vaga de Migula fueron aisladas de muchos nichos naturales y, en ese momento, muchas fueron asignadas al género . Sin embargo, desde entonces se han reclasificado muchas cepas, basándose en una metodología más reciente y en el uso de enfoques que implican estudios de macromoléculas conservadoras. [8]

Recientemente, el análisis de la secuencia del ARNr 16S ha redefinido la taxonomía de muchas especies bacterianas. [9] Como resultado, el género Pseudomonas incluye cepas anteriormente clasificadas en los géneros Chryseomonas y Flavimonas . [10] Otras cepas previamente clasificadas en el género Pseudomonas ahora se clasifican en los géneros Burkholderia y Ralstonia . [11] [12]

En 2020, un análisis filogenómico de 494 genomas completos de Pseudomonas identificó dos especies bien definidas ( P. aeruginosa y P. chlororaphis ) y cuatro grupos filogenéticos más amplios ( P. fluorescens, P. stutzeri, P. syringae, P. putida ) con un número suficiente de proteomas disponibles. [13] Los cuatro grupos evolutivos más amplios incluyen más de una especie, según la definición de especie según los niveles de identidad de nucleótidos promedio. [14] Además, el análisis filogenómico identificó varias cepas que se anotaron incorrectamente en la especie o grupo evolutivo incorrectos. [13] Este problema de anotación errónea también ha sido informado por otros análisis. [15]

En 2000, se determinó la secuencia completa del genoma de una especie de Pseudomonas ; más recientemente, se ha determinado la secuencia de otras cepas, incluidas las cepas de P. aeruginosa PAO1 (2000), P. putida KT2440 (2002), P. protegens Pf-5 (2005), P. syringae patovar tomate DC3000 (2003), P. syringae patovar syringae B728a (2005), P. syringae patovar phaseolica 1448A (2005), P. fluorescens Pf0-1 y P. entomophila L48. [8]