Las rubrobacterias son una de las cinco clases de Actinobacterias que contienen un orden, una familia, un género y siete especies. [1]
Rubrobacterias | |
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clasificación cientifica | |
Dominio: | |
Filo: | |
Clase: | Rubrobacterias Suzuki 2013 enmienda. Foesel y col. 2015b |
Orden, familia y género | |
Sinónimos | |
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Filogenia
La filogenia se basa en la liberación 123 de LTP basada en ARNr 16S del proyecto 'The All-Species Living Tree' . [2]
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Taxonomía
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) [1] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [3]
- Clase Rubrobacteria Suzuki 2013 enmienda. Foesel y col. 2015b [Rubrobacteridae Rainey et al. 1997 enmienda. Zhi, Li y Stackebrandt 2009
- Orden Rubrobacterales Rainey et al. 1997 enmienda. Foesel y col. 2015b [Rubrobacterineae]
- Familia Rubrobacteraceae Rainey et al. 1997 enmienda. Foesel y col. 2015b
- Género Rubrobacter Suzuki et al. 1989 enmienda. Albuquerque y col. 2014
- Especie R. aplysinae Kämpfer et al. 2014
- Especie R. bracarensis Jurado et al. 2013 enmienda. Albuquerque y col. 2014
- Especie R. calidifluminis Albuquerque et al. 2014
- Especie R. naiadicus Albuquerque et al. 2014
- Especie R. radiotolerans (Yoshinaka et al. 1973) Suzuki et al. 1989
- Especie R. taiwanensis Chen et al. 2004
- Especie R. xylanophilus Carreto et al. 1996
- Especie " R. wessexii " ♠
- Género Rubrobacter Suzuki et al. 1989 enmienda. Albuquerque y col. 2014
- Familia Rubrobacteraceae Rainey et al. 1997 enmienda. Foesel y col. 2015b
- Orden Rubrobacterales Rainey et al. 1997 enmienda. Foesel y col. 2015b [Rubrobacterineae]
Notas:
♠ Cepas encontradas en el NCBI, pero no incluidas en el LSPN
Ver también
Referencias
- ^ a b J.P. Euzéby. "Rubrobacterias" . Lista de nombres procariotas con posición en nomenclatura (LPSN) . Consultado el 20 de marzo de 2016 .
- ^ Proyecto 'El árbol vivo de todas las especies' . "Lanzamiento 123 de LTP basado en rRNA 16S (árbol completo)" (PDF) . Base de datos completa de ARN ribosómico de Silva . Consultado el 20 de marzo de 2016 .
- ^ Sayers; et al. "Rubrobacterias" . Base de datos de taxonomía NCBI . Consultado el 20 de marzo de 2016 .
- ^ "AnnoTree v1.2.0" . AnnoTree .
- ^ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). "AnnoTree: visualización y exploración de un árbol de la vida microbiano anotado funcionalmente" . Investigación de ácidos nucleicos . 47 (9): 4442–4448. doi : 10.1093 / nar / gkz246 . PMC 6511854 . PMID 31081040 .
- ^ "GTDB release 05-RS95" . Base de datos de taxonomía del genoma .
- ^ Parks, DH; Chuvochina, M; Chaumeil, PA; Rinke, C; Mussig, AJ; Hugenholtz, P (septiembre de 2020). "Una taxonomía completa de dominio a especie para bacterias y arqueas" . Biotecnología de la naturaleza . 38 (9): 1079–1086. bioRxiv 10.1101 / 771964 . doi : 10.1038 / s41587-020-0501-8 . PMID 32341564 . S2CID 216560589 .