Las secretoglobinas (SCGB) son una familia de proteínas diméricas unidas por disulfuro , pequeñas, de hélice alfa , que se encuentran solo en mamíferos. Esta familia se conocía anteriormente como la familia de 10 kDa de células Uteroglobina / Clara , en honor a los dos alias de su miembro fundador Uteroglobina.
Secretoglobina | ||||||||
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Identificadores | ||||||||
Símbolo | Secretoglobina | |||||||
Pfam | PF01099 | |||||||
InterPro | IPR016126 | |||||||
PROSITE | PS51311 | |||||||
SCOP2 | d1utra_ / SCOPe / SUPFAM | |||||||
CDD | cd00633 | |||||||
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Estructura y función
Las proteínas son en su mayoría alfa-helicoidales y el dímero se forma de forma antiparalela. La interfaz del dímero presenta una cavidad formada a través de los dos monómeros, que puede acomodar ligandos de tamaño pequeño a mediano como esteroides y fosfolípidos. [1] La unión y la liberación pueden ir acompañadas del estado redox de las cistinas, es decir, la presencia de estos enlaces disulfuro. [2]
Muchos tienen funciones reguladoras.
Clasificación
La familia fue clasificada por homología de secuencia en 6 subfamilias en 2006. [3] Los genomas humanos y de ratón solo contienen las primeras tres familias, según una actualización de 2011. No todas las familias son monofiléticas. [4]
Subfamilia | Grupo | Miembro | |||||
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Símbolo [4] | Nombre | Ligando (s) | |||||
1 | UGB | A | UGB | SCGB1A1 | Uteroglobina (UGB); blastoquinina, CCSP | fosfatidilcolina, fosfatidilinositol, PCB | |
B | ABPA -como | ||||||
C | |||||||
D | lipofilina A / B | ||||||
2 | A | ||||||
B | ABPBG -como | ||||||
3 | Similar a UGB | A | Similar a UGB | SCGB3A1 | |||
SCGB3A2 |
La prostateína de rata es una proteína de tres componentes construida a partir de tres genes similares a la lipofilina en los grupos 2 y 3. [3]
Subfamilias adicionales
Las subfamilias 4 a 6 no se encuentran en humanos o ratones, y también podrían ser duplicados de grupos existentes. [3]
Se suponía que la subfamilia 6 incluiría la rata RYD5, [3] ahora reasignada Scgb1c1. [4]
La subfamilia 4 incluía anteriormente lo que ahora se conoce como grupo 1B y 2B como grupo 4A. Los pares de genes 1B / 2B (ABP) están ordenados uno al lado del otro en el cromosoma en "módulos" que se han duplicado de forma independiente. [4]
Se suponía que Fel d 1 estaba dividido en dos subfamilias: la cadena 1 en la subfamilia 4 y la cadena 2 en la subfamilia 5. [3] Aunque no se menciona en la actualización de 2011, las coincidencias de InterPro sugieren que CH1 es similar a 1B y CH2 es similar a 2B. [5] La investigación computacional adicional confirma la similitud, posiblemente invalidando las subfamilias 4 y 5 también. [6]
Referencias
- ^ Umland TC, Swaminathan S, Singh G, Warty V, Furey W, Pletcher J, Sax M (agosto de 1994). "Estructura de un complejo de ligando-proteína de unión a fosfolípidos de células de Clara humana con una resolución de 1,9 A". Biología estructural de la naturaleza . 1 (8): 538–45. doi : 10.1038 / nsb0894-538 . PMID 7664082 . S2CID 28261246 .
- ^ Härd T, Barnes HJ, Larsson C, Gustafsson JA, Lund J (noviembre de 1995). "Estructura de la solución de una proteína de unión a PCB de mamífero en un complejo con un PCB". Biología estructural de la naturaleza . 2 (11): 983–9. doi : 10.1038 / nsb1195-983 . PMID 7583672 . S2CID 10369347 .
- ^ a b c d e Klug J, Beier HM, Bernard A, Chilton BS, Fleming TP, Lehrer RI, et al. (25 de enero de 2006). "Familia de proteínas de 10 kDa de células de Uteroglobina / Clara: informe del comité de nomenclatura". Anales de la Academia de Ciencias de Nueva York . 923 (1): 348–54. doi : 10.1111 / j.1749-6632.2000.tb05549.x . PMID 11193777 . S2CID 38862724 .
- ^ a b c d Jackson BC, Thompson DC, Wright MW, McAndrews M, Bernard A, Nebert DW, Vasiliou V (octubre de 2011). "Actualización de la superfamilia de genes de secretoglobina humana (SCGB) y un ejemplo de 'floración evolutiva' de genes de proteínas de unión a andrógenos dentro de la superfamilia de genes Scgb de ratón" . Genómica humana . 5 (6): 691–702. doi : 10.1186 / 1479-7364-5-6-691 . PMC 3251818 . PMID 22155607 .
- ^ "Fel d 1 cadena 1", Mus musculus , "Fel d 1 cadena 2", Mus musculus . InterPro .
- ^ Durairaj R, Pageat P, Bienboire-Frosini C (2018). "Otro juego del gato y el ratón: descifrar la evolución de la superfamilia SCGB y explorar la similitud molecular del alérgeno felino principal Fel d 1 y ABP de ratón utilizando enfoques computacionales" . PLOS ONE . 13 (5): e0197618. Código bibliográfico : 2018PLoSO..1397618D . doi : 10.1371 / journal.pone.0197618 . PMC 5957422 . PMID 29771985 .