Las Streptomycetaceae son una familia de Actinobacterias , que forman el orden monotípico Streptomycetales . Incluye el importante género Streptomyces . Esta fue la fuente original de muchos antibióticos , a saber, la estreptomicina , el primer antibiótico contra la tuberculosis .
Streptomycetaceae | |
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Cultivo de portaobjetos de una especie de Streptomyces | |
clasificación cientifica | |
Reino: | |
Filo: | |
Clase: | Actinobacterias |
Pedido: | Streptomycetales Cavalier-Smith 2002 [1] |
Familia: | Streptomycetaceae Waksman y Henrici 1943 (listas aprobadas 1980) [2] |
Géneros [3] | |
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Sinónimos | |
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Genómica
Los alineamientos de secuencia de genomas actinobacterianos han llevado a la identificación de tres indeles de firma conservados que son exclusivos del orden Streptomycetales. La enzima PBGD contiene una inserción de cuatro aminoácidos que está presente en todas las especies de Streptomyces y Kitasatospora setae , pero no en ninguna otra Actinobacteria. De manera similar, una inserción de un aminoácido está presente en una región conservada de adenilato quinasa y se encuentra en todas las especies de Streptomyces y K. setae , pero no se encuentra en ninguna otra Actinobacteria. También se han identificado cinco proteínas de firma conservadas que están presentes en varias especies de Streptomyces secuenciadas , pero no en K. setae ; sin embargo, como aún no se ha secuenciado el genoma completo de K. setae , estas proteínas pueden estar presentes en K. setae . Además, se han identificado 11 proteínas de firma conservadas que se encuentran en todas las especies de Streptomyces secuenciadas y K. setae . Se cree que estas proteínas son exclusivas del orden Streptomycetales, por lo que proporcionan marcadores moleculares que pueden usarse para distinguir este grupo del resto de Actinobacteria. Los árboles filogenéticos indican que el orden Catenulisporales está estrechamente relacionado con el orden Streptomycetales. Esta inferencia está respaldada por un indel de firma conservado de un aminoácido que se encuentra únicamente en todas las especies de Streptomycetales y Catenulisporales acidiphilia , la única especie de Catenulisporales cuyo genoma completo ha sido secuenciado. Además, se han identificado tres proteínas de firma conservadas que se encuentran en todas las especies de Streptomycetales y C. acidiphilia . Tanto el indel de firma conservado como las proteínas de firma conservadas proporcionan evidencia de que los órdenes Streptomycetales y Catenulisporales están estrechamente relacionados. [4]
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN). [3] La filogenia se basa en el análisis del genoma completo. [5] [a]
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Notas
- ^ Allostreptomyces no se incluye en este árbol filogenético.
Referencias
- ^ Cavalier-Smith T. (2002). "El origen neomurano de las arqueobacterias, la raíz negibacteriana del árbol universal y la megaclasificación bacteriana". Int J Syst Evol Microbiol . 52 : 7-76.
- ^ Waksman SA, Henrici AT. (1943). "La nomenclatura y clasificación de los actinomicetos ". J Bacteriol . 46 : 337–341.Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ a b Euzéby JP, Parte AC. " Streptomycetaceae " . Lista de nombres procariotas con posición en nomenclatura (LPSN) . Consultado el 9 de junio de 2021 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ^ Gao, B .; Gupta, RS (2012). "Marco filogenético y firmas moleculares para los principales clados del Phylum Actinobacteria" . Revisiones de Microbiología y Biología Molecular . 76 (1): 66–112. doi : 10.1128 / MMBR.05011-11 . PMC 3294427 . PMID 22390973 .
- ^ Nouioui I, Carro L, García-López M, Meier-Kolthoff JP, Woyke T, Kyrpides NC, Pukall R, Klenk HP, Goodfellow M, Markus Göker M. (2018). "Clasificación taxonómica basada en el genoma del Phylum Actinobacteria " . Parte delantera. Microbiol . 9 : 2007. doi : 10.3389 / fmicb.2018.02007 . PMC 6113628 . PMID 30186281 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )