Una estructura supersecundaria es una estructura de proteína tridimensional compacta de varios elementos adyacentes de una estructura secundaria que es más pequeña que un dominio de proteína o una subunidad . Las estructuras secundarias pueden actuar como nucleaciones en el proceso de plegamiento de proteínas .
Ejemplos de
Estructuras supersecundarias de hélice
Horquilla de hélice
Una horquilla de hélice, también conocida como horquilla alfa-alfa, se compone de dos hélices alfa antiparalelas conectadas por un bucle de dos o más residuos. Fiel a su nombre, se asemeja a una horquilla. Un bucle más largo tiene un mayor número de posibles conformaciones. Si hebras cortas conectan las hélices, las hélices individuales se agruparán a través de sus residuos hidrófobos. Se desconoce la función de una horquilla helicoidal; sin embargo, un paquete de cuatro hélices se compone de dos horquillas de hélice, que tienen importantes sitios de unión de ligandos. [1]
Esquina de la hélice
Una esquina de hélice, también llamada esquina alfa-alfa, tiene dos hélices alfa casi en ángulo recto entre sí conectadas por un corto "bucle". Este bucle se forma a partir de un residuo hidrófobo . Se desconoce la función de una esquina de hélice. [1]
Hélice-bucle-hélice
La estructura de hélice-bucle-hélice tiene dos hélices conectadas por un 'bucle'. Estos son bastante comunes y generalmente se unen a ligandos . Por ejemplo, el calcio se une a los grupos carboxilo de las cadenas laterales dentro de la región del bucle entre las hélices. [1]
Hélice-vuelta-hélice
La hélice-giro-hélice motivo es importante para la unión de ADN y por lo tanto se encuentra en muchas proteínas de unión al ADN. [1]
Estructuras supersecundarias de hoja beta
Horquilla beta
Una horquilla beta es un motivo supersecundario común compuesto por dos hebras beta antiparalelas conectadas por un bucle. La estructura se asemeja a una horquilla y se encuentra a menudo en proteínas globulares.
El bucle entre las hebras beta puede oscilar entre 2 y 16 residuos. Sin embargo, la mayoría de los bucles contienen menos de siete residuos. [2] Los residuos en las horquillas beta con bucles de 2, 3 o 4 residuos tienen conformaciones distintas. Sin embargo, se puede ver una amplia gama de conformaciones en bucles más largos, que a veces se denominan 'bobinas aleatorias'. Un meandro beta consiste en hebras consecutivas antiparalelo-beta unidas por horquillas. [3]
Dos bucles de residuos se denominan giros beta o giros inversos. Los giros inversos de Tipo I 'y Tipo II' ocurren con mayor frecuencia porque tienen menos impedimento estérico que los giros de Tipo I y Tipo II. Se desconoce la función de las horquillas beta. [2]
Esquina beta
Una horquilla beta tiene dos hebras beta antiparalelas que forman un ángulo de aproximadamente 90 grados entre sí. Está formado por una horquilla beta que cambia de dirección con una hebra que tiene un residuo de glicina y la otra hebra que tiene una protuberancia beta . Las esquinas beta no tienen ninguna función conocida. [2]
Motivo de llave griega
Un motivo de clave griega tiene cuatro características:
- Cuatro hebras beta conectadas secuencialmente son adyacentes, no necesariamente alineadas geométricamente entre sí.
- La hoja beta es antiparalela y hebras alternas corren en direcciones opuestas.
- La primera hebra y la última hebra están una al lado de la otra y unidas por enlaces de hidrógeno.
- Los bucles de conexión pueden ser largos e incluir otras estructuras secundarias.
El motivo de la llave griega tiene su nombre porque la estructura se parece al patrón que se ve en las urnas griegas. Este motivo no tiene ninguna función conocida.
Otro
Las láminas β (compuestas por múltiples cadenas β individuales unidas por hidrógeno) a veces se consideran una estructura secundaria o supersecundaria.
Estructuras supersecundarias mixtas
Motivos beta-alfa-beta
Un motivo beta-alfa-beta se compone de dos hebras beta unidas por una hélice alfa a través de bucles de conexión. Las hebras beta son paralelas y la hélice también es casi paralela a las hebras. Esta estructura se puede ver en casi todas las proteínas con hebras paralelas. Los bucles que conectan las hebras beta y la hélice alfa pueden variar en longitud y, a menudo, se unen a ligandos.
Las hélices beta-alfa-beta pueden ser zurdas o diestras. Cuando se ve desde el lado N-terminal de las hebras beta, de modo que una hebra esté encima de la otra, un motivo beta-alfa-beta para zurdos tiene la hélice alfa en el lado izquierdo de las hebras beta. El motivo diestro más común tendría una hélice alfa en el lado derecho del plano que contiene las hebras beta. [4]
![](http://wikiimg.tojsiabtv.com/wikipedia/commons/thumb/3/31/Rossman_fold.png/220px-Rossman_fold.png)
Pliegue de Rossman
Los pliegues de Rossman, que llevan el nombre de Michael Rossman , consisten en 3 hebras beta y 2 hélices de forma alterna: hebra beta, hélice, hebra beta, hélice, hebra beta. Este motivo tiende a invertir la dirección de la cadena dentro de una proteína. Los pliegues de Rossman tienen una función biológica importante en la unión de nucleótidos como NAD dentro de la mayoría de las deshidrogenasas. [4]
Ver también
Referencias
- ^ a b c d "Estructuras supersecundarias de la hélice" . biomedapps.curtin.edu.au . Consultado el 31 de enero de 2020 .
- ^ a b c "Estructuras supersecundarias de hoja beta" . biomedapps.curtin.edu.au . Consultado el 31 de enero de 2020 .
- ^ Cooper, J. (26 de enero de 1995). "Estructura secundaria" . Material del curso VSNS-PPS . Consultado el 14 de marzo de 2020 .
- ^ a b "Estructuras de hélice y hebra beta mixtas" . biomedapps.curtin.edu.au . Consultado el 31 de enero de 2020 .
Otras lecturas
- Chiang YS, Gelfand TI, Kister AE, Gelfand IM (2007). "Nueva clasificación de estructuras supersecundarias de proteínas tipo sándwich descubre patrones estrictos de ensamblaje de cadenas". Las proteínas . 68 (4): 915–921. doi : 10.1002 / prot.21473 . PMID 17557333 .