Apache Taverna es una herramienta de software de código abierto para diseñar y ejecutar flujos de trabajo , creada inicialmente por el proyecto myGrid con el nombre Taverna Workbench , ahora un proyecto bajo la incubadora Apache . Taverna permite a los usuarios integrar muchos componentes de software diferentes, incluidos los servicios web WSDL SOAP o REST , como los proporcionados por el Centro Nacional de Información Biotecnológica , el Instituto Europeo de Bioinformática , el Banco de datos de ADN de Japón (DDBJ) , SoapLab, BioMOBY y EMBOSS .. El conjunto de servicios disponibles no es finito y los usuarios pueden importar nuevas descripciones de servicios en Taverna Workbench. [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8]
Taverna Workbench proporciona un entorno de creación de escritorio y un motor de promulgación para flujos de trabajo científicos. El motor de flujo de trabajo de Taverna también está disponible por separado, como API de Java, herramienta de línea de comandos o como servidor.
Taverna es utilizado por usuarios en muchos dominios, como bioinformática , [9] [10] quimioinformática , [11] medicina , astronomía , [12] ciencias sociales , música y preservación digital . [13]
Algunos de los servicios para su uso en los flujos de trabajo de Taverna se pueden descubrir a través de BioCatalogue , un registro público, centralizado y seleccionado de servicios web de ciencias de la vida. Los flujos de trabajo de Taverna también se pueden compartir con otras personas a través del sitio web social myExperiment para científicos. [14] BioCatalogue y myExperiment son otros dos productos del consorcio myGrid .
Taverna se utiliza en más de 350 organizaciones de todo el mundo, tanto académicas como comerciales. A partir de 2011, ha habido más de 80 000 descargas de Taverna en diferentes versiones.
Los flujos de trabajo de Taverna pueden invocar servicios web generales SOAP / WSDL o REST , y servicios web SADI, BioMart, BioMoby y SoapLab más específicos . También puede invocar servicios estadísticos R , código Java local, herramientas externas en máquinas locales y remotas (a través de ssh ), hacer XPath y otra manipulación de texto, importar una hoja de cálculo e incluir subflujos de trabajo.