myExperiment es un sitio web social para investigadores que comparten objetos de investigación , como flujos de trabajo científicos . [2] [3] [4] [5]
Contenido | |
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Descripción | myExperiment |
Contacto | |
Centro de Investigación | Departamento de Ciencias de la Computación, Universidad de Manchester |
Cita primaria | Goble & al. (2010) [1] |
Acceso | |
Sitio web | http://www.myexperiment.org |
El sitio web myExperiment se lanzó en noviembre de 2007 y contiene una colección significativa de flujos de trabajo científicos para una variedad de sistemas de flujo de trabajo, sobre todo Taverna , pero también otras herramientas como Bioclipse . myExperiment tiene una API REST y se basa en una base de código Ruby on Rails de código abierto . Es compatible con datos vinculados y tiene un SPARQL Endpoint, con un tutorial interactivo . [6] [7] [8]
El proyecto myExperiment está dirigido por David De Roure en la Universidad de Oxford y es una de las actividades del consorcio myGrid liderado por Carole Goble de la Universidad de Manchester , Reino Unido y del consorcio regional e-Research South UK liderado por Oxford e- Centro de Investigaciones . Originalmente fue financiado por Jisc en el marco del programa Virtual Research Environment y por Microsoft Technical Computing Initiative . myExperiment se está mejorando con el proyecto workflows for ever (Wf4Ever) [9] [10], que tiene como objetivo proporcionar nuevas funciones para respaldar la preservación de los objetos de investigación junto con el marco de la biblioteca digital dLibra . [11] [12]
Referencias
- ^ Goble, CA ; Bhagat, J .; Aleksejevs, S .; Cruickshank, D .; Michaelides, D .; Newman, D .; Borkum, M .; Bechhofer, S .; Roos, M .; Li, P .; De Roure, D. (2010). "MyExperiment: un repositorio y red social para el intercambio de flujos de trabajo bioinformáticos" . Investigación de ácidos nucleicos . 38 (Problema del servidor web): W677 – W682. doi : 10.1093 / nar / gkq429 . PMC 2896080 . PMID 20501605 .
- ^ Bechhofer, S .; Buchan, I .; De Roure, D .; Missier, P .; Ainsworth, J .; Bhagat, J .; Couch, P .; Cruickshank, D .; Delderfield, M .; Dunlop, I .; Gamble, M .; Michaelides, D .; Owen, S .; Newman, D .; Sufi, S .; Goble, C. (2011). "Por qué los datos vinculados no son suficientes para los científicos" (PDF) . Sistemas informáticos de futura generación . 29 (2): 599. doi : 10.1016 / j.future.2011.08.004 . S2CID 16783450 .
- ^ De Roure, D .; Goble, C .; Stevens, R. (2009). "El diseño y realización del entorno de investigación virtual myExperiment para el intercambio social de flujos de trabajo" (PDF) . Sistemas informáticos de futura generación . 25 (5): 561–567. doi : 10.1016 / j.future.2008.06.010 .
- ^ Roure, DD ; Goble, C .; Bhagat, J .; Cruickshank, D .; Goderis, A .; Michaelides, D .; Newman, D. (2008). "MyExperiment: Definición del entorno de investigación virtual social". 2008 IEEE Cuarta Conferencia Internacional sobre Ciencia Electrónica (PDF) . págs. 182-189. doi : 10.1109 / eScience.2008.86 . ISBN 978-1-4244-3380-3. S2CID 11104419 .
- ^ De Roure, D .; Goble, C. (2009). "Diseño de software para empoderar a los científicos" (PDF) . Software IEEE . 26 : 88–95. doi : 10.1109 / MS.2009.22 . S2CID 33191938 .
- ^ Gewin, Virginia (2008). "El nuevo nexo de redes: una gran cantidad de sitios web está facilitando más que nunca la creación de redes entre científicos". Naturaleza . 451 (7181): 1024–1025. doi : 10.1038 / nj7181-1024a . PMID 18363200 .
- ^ Hendler, J. (2008). "Reinventar la publicación académica, parte 3" . Sistemas inteligentes IEEE . 23 : 2-3. doi : 10.1109 / MIS.2008.12 .
- ^ Stein, LD (2008). "Hacia una ciberinfraestructura para las ciencias biológicas: avances, visiones y desafíos". Nature Reviews Genética . 9 (9): 678–688. doi : 10.1038 / nrg2414 . PMID 18714290 . S2CID 339653 .
- ^ "Inicio - wf4ever" . Consultado el 19 de junio de 2012 .
- ^ Bechhofer, S .; Buchan, I .; De Roure, D .; Missier, P .; Ainsworth, J .; Bhagat, J .; Couch, P .; Cruickshank, D .; Delderfield, M .; Dunlop, I .; Gamble, M .; Michaelides, D .; Owen, S .; Newman, D .; Sufi, S .; Goble, C. (2011). "Por qué los datos vinculados no son suficientes para los científicos" (PDF) . Sistemas informáticos de futura generación . 29 (2): 599. doi : 10.1016 / j.future.2011.08.004 . S2CID 16783450 .
- ^ https://www.newscientist.com/article/mg19225745.500-myspace-for-the-dudes-in-lab-coats.html MySpace para los tipos en batas de laboratorio en la revista New Scientist , número 2574, página 29. 21 de octubre de 2006.
- ^ http://www.timeshighereducation.co.uk/story.asp?storycode=404834 Artículo de Times Higher Education "Inicie sesión en un laboratorio global: las herramientas web 2.0 permiten a los investigadores compartir ideas, datos y resultados" por Sarah Collinson y Zoe Corbyn en la sección "Inteligencia de investigación", página 22 (1 de enero de 2009).