Terri Attwood


Teresa K. Attwood es profesora de Bioinformática en el Departamento de Ciencias de la Computación y la Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad de Manchester y miembro visitante del Instituto Europeo de Bioinformática (EMBL-EBI) . [5] Obtuvo una beca de investigación de la Royal Society University en University College London (UCL) de 1993 a 1999 y en la Universidad de Manchester de 1999 a 2002. [2]

Attwood obtuvo su Licenciatura en Biofísica de la Universidad de Leeds en 1982. [6] Se le otorgó un doctorado , también en Biofísica, dos años más tarde, en 1984 [3] bajo la supervisión de John E. Lydon [7] estudiando mesofases cromónicas .

Attwood realizó una investigación postdoctoral en Leeds hasta 1993, cuando se trasladó al University College London [8] durante cinco años antes de trasladarse a la Universidad de Manchester en 1999. Su investigación [9] [10] se refiere a la alineación de secuencias de proteínas y al análisis de proteínas .

Inspirado por la creación de PROSITE , Attwood desarrolló un método de identificación de proteínas y lo utilizó para establecer la base de datos PRINTS [11] [12] [13] . Con Amos Bairoch , buscó unificar el trabajo sobre clasificación y anotación de familias de proteínas, y finalmente obtuvo una subvención de la Unión Europea con Rolf Apweiler para establecer InterPro , [14] [15] con Pfam , ProDom y Swiss-Prot / TrEMBL como socios del consorcio en 1997 . [16]

Attwood ha liderado proyectos importantes como el consorcio de minería de textos BioMinT FP5 [17] , el consorcio de educación bioinformática EMBER [18] (que incluye a EBI y el Instituto Suizo de Bioinformática como socios) y la plataforma EPSRC PARADIGM. [19] Es la investigadora principal de Manchester en los proyectos SeqAhead ( red de análisis de datos de secuenciación de próxima generación ) [20] y AllBio (infraestructura bioinformática para ciencias unicelulares, animales y vegetales), [21] y también fue investigadora principal de Manchester en EMBRACE [22 ]y EuroKUP (proteómica de riñón y orina). [23] Attwood fue miembro del Comité de Estrategia de Capacitación en Bioinformática de ELIXIR (Paquete de Trabajo 11) [24] durante la fase preparatoria de ELIXIR. Actualmente es Presidenta de EMBnet Global Bioinformatics Network, fue miembro de los Comités Ejecutivos de la Sociedad Internacional de Biocuración., y la Red de Capacitación en Bioinformática, y recientemente fue elegido miembro de la Junta Directiva de la Sociedad Internacional de Biología Computacional. En 2012, encabezó el establecimiento de una GOBLET (Organización Global para el Aprendizaje, Educación y Capacitación en Bioinformática), con las principales sociedades, redes y organizaciones de bioinformática, biología computacional y biocuración como socios. A partir de 2016 , Attwood es el presidente de la Junta Ejecutiva de GOBLET . [25] [26]

Además de ser una biocuradora [16] [27] , ha co-desarrollado herramientas para alinear y visualizar secuencias y estructuras de proteínas, incluyendo Ambrosia y CINEMA. [28] [29] El grupo está construyendo componentes de software reutilizables para crear aplicaciones bioinformáticas útiles a través de UTOPIA (herramientas bioinformáticas) , [30] [31] y está desarrollando nuevos enfoques para la anotación automática y minería de texto , como PRECIS, [32 ] METIS, [33] BioIE, [34] y enfoques semánticos para la integración de datos, [35] como el Semantic Biochemical Journal [36]publicado por Portland Press . Las herramientas UTOPIA sustentan tanto el Semantic Biochemical Journal como un proyecto de colaboración con Pfizer y AstraZeneca para desarrollar una interfaz del siglo XXI para la literatura biomédica y la gestión de datos.