Thermotoga naphthophila
Thermotoga naphthophila es un heterótrofo fermentativo hipertermófilo , anaeróbico, no formador de esporas y en forma de varilla,con la cepa tipo RKU-10 T. [1]
La información taxonómica de Thermotoga naphthophila es la siguiente: dominio, bacterias [2] ; Phylum, Thermotogae [3] ; Orden, Termotogales [3] ; Familia Thermotogaceae [4] ; Género Thermotoga [4] ; Especie, T. naphthophila [3] . Thermotoga naphthophila es un hipertermófilo anaeróbico , fijador de compuestos de azufre . [2] [3] El nombre de la especie es originalmente griego. El término "nafta" significa una sustancia de petróleo ligero que diluye minerales en betún y "-philos" significa amor. Esta traducción del nombre de la especie se combina para formar "amante del betún". [3] [5]
Thermotoga naphthophila se puede encontrar en los tipos de cepas RKU-10, DSM-13996 y JCM-10882T. El tamaño de las células de T. naphthophila varía entre 2 y 7 micrómetros ( m) de largo por 0,7 a 1,0 m de ancho. [3] Basado en secuencias de rDNA 16S , Thermotoga petrophila , cepa RKU-1, es el pariente más cercano a T.naphthophila . [3] Otros parientes cercanos de T. naphthophila incluyen Thermotoga maritima y Thermotoga napolitano según el análisis de rDNA 16S. [3] T. maritima tiene una longitud promedio de 5 m . [6] Las cepas aisladas de yacimientos de petróleo, pero no consideradas como parte del clado T. naphthophila incluyen las siguientes especies: T. subterranean , T. hypogea y T. elfii . [3]
Thermotoga naphthophila fue descubierto por Takahata et.al. en el depósito de petróleo subterráneo Kubiki de Niigata, Japón. [2] [3] [5] Este organismo se encontró con otra bacteria llamada Thermotoga petrophila , RKU-1 [3] . Para transportar las muestras de especies, se colocaron en botellas de vidrio estériles en cajas más frías con hielo. [3] Después de llegar al laboratorio, las especies se aislaron en un medio de extracto de levadura al 0,2% en agua de mar artificial a un pH de 7. [3] Se añadió ácido clorhídrico (HCl) a la muestra a temperatura ambiente después de extraer el extracto de levadura. Se colocaron recipientes de medio líquido en tubos de 30 mililitros y posteriormente se expusieron a calor de horno de cobre reducido con H2 con nitrógeno libre de oxígeno . [3] Luego, el sulfuro de sodio llevó el pH del medio a un rango de 6,9 a 7,1 y las especies se purificaron con placas de Gelrite, un sustituto del agar. [3] Thermotoga naphthophila naturalmente tiene un rango de pH de crecimiento de 5.4-9.0, pero óptimamente prefiere un pH de 7.0. [3]
Los rangos de tolerancia de Thermotoga naphthophila para el pH y las concentraciones de cloruro de sodio (NaCl) se encontraron utilizando medios YE inoculados incubados a 80 ° C para ver el crecimiento de la especie. [3] Takahata y col. expuso las bacterias a varios tampones para comprender mejor los efectos del pH. Se utilizaron varias fases de gas para exponer el crecimiento de la especie en medios de 10 mL. [3] Además, el crecimiento de la especie se expuso a celulosa al 1% , queroseno, aceite ligero, quitina , aceite crudo y aceite pesado A en duplicados de medios de 30 ml. [3] Takahata y col. utilizó una cromatografía líquida de alta resolución(HPLC) y concentraciones de guanina y citosina (GC) para recopilar datos de productos metabólicos de la especie. Se investigaron aceptores de electrones como sulfato, tiosulfato y azufre elemental en medios basados en YE. [3] Se utilizó una técnica de reacción en cadena de la polimerasa ( PCR ) para amplificar la secuencia de bases del ADN y recolectar el gen de la subunidad de girasa B ( gyrB ) de los microorganismos verdaderos identificados anteriormente. [3]