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Representación esquemática de proteínas transmembrana: 1. una proteína con una hélice α transmembrana única (es decir, una proteína de membrana bitópica ) 2. una proteína α helicoidal transmembrana politópica 3. una proteína de hoja β transmembrana politópica
La membrana está representada en marrón claro.

Las proteínas bitópicas (también conocidas como proteínas de un solo paso o de extensión única ) son proteínas transmembrana que abarcan la bicapa lipídica solo una vez. [1] Estas proteínas pueden constituir hasta el 50% de todas las proteínas transmembrana , dependiendo del organismo, y contribuyen significativamente a la red de interacciones entre diferentes proteínas en las células , incluidas las interacciones a través de hélices transmembrana . [2] Por lo general, incluyen uno o varios dominios solubles en agua situados en los diferentes lados de las membranas biológicas , por ejemplo, en un solo paso.receptores transmembrana . Algunos de ellos son pequeños y sirven como subunidades reguladoras o estabilizadoras de la estructura en grandes complejos transmembrana de múltiples proteínas, como los fotosistemas o la cadena respiratoria .

Clasificación basada en topología [ editar ]

Las proteínas bitópicas se clasifican en 4 tipos, según su topología transmembrana y la ubicación de la hélice transmembrana en la secuencia de aminoácidos de la proteína. Según Uniprot : [3]

  • El tipo I es una proteína bitópica con su extremo N en el lado extracelular de la membrana y el péptido señal eliminado ;
  • El tipo II es una proteína bitópica con su N-terminal en el lado citoplásmico de la membrana y la hélice transmembrana ubicada cerca del N-terminal, donde funciona como un ancla;
  • El tipo III es una proteína bitópica con su extremo N en el lado extracelular de la membrana y sin péptido señal ;
  • El tipo IV es una proteína bitópica con su extremo N en el lado citoplásmico de la membrana y la hélice transmembrana ubicada cerca del extremo C, donde funciona como ancla.

Por tanto, las proteínas de tipo I se anclan a la membrana lipídica con una secuencia de anclaje de parada-transferencia y sus dominios N-terminales se dirigen a la luz del RE durante la síntesis (y al espacio extracelular, si las formas maduras se encuentran en el plasmalema ). Los tipos II y III están anclados con una secuencia de anclaje de señal, con el tipo II dirigido al lumen del ER con su dominio C-terminal, mientras que el tipo III tiene sus dominios N-terminales dirigidos al lumen del ER. El tipo IV se subdivide en IV-A, con sus dominios N-terminales dirigidos al citosol y IV-B, con un dominio N-terminal dirigido a la luz. [4] Las implicaciones para la división en los cuatro tipos se manifiestan especialmente en el momento de la translocación y la traducción unida al ER, cuando la proteína debe pasar a través de la membrana del ER en una dirección que depende del tipo.

Bases de datos [ editar ]

Referencias [ editar ]

  1. ^ Biología estructural de la membrana: con fundamentos bioquímicos y biofísicos , por Mary Luckey, 2014, Cambridge University Press , página 91.
  2. ^ Zviling, Moti; Kochva, Uzi; Arkin, Isaiah T. (2007). "¿Qué importancia tienen las hélices transmembrana de las proteínas de la membrana bitópica?". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1768 (3): 387–392. doi : 10.1016 / j.bbamem.2006.11.019 . PMID  17258687 .
  3. ^ Definiciones de topología en Uniprot, consulte [1] , [2]
  4. ^ Harvey Lodish, etc .; Biología celular molecular , sexta edición, p.546