La aminometiltransferasa es una enzima que cataboliza la creación de metilentetrahidrofolato . Es parte del complejo de glicina descarboxilasa .
AMT |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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1WSR , 1WSV |
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Identificadores |
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Alias | AMT , aminometiltransferasa, GCE, GCST, GCVT, NKH |
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Identificaciones externas | OMIM : 238310 MGI : 3646700 HomoloGene : 409 GeneCards : AMT |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 3 (humano) [1] |
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| Banda | 3p21.31 | Comienzo | 49.416.778 pb [1] |
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Final | 49,422,685 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 9 (ratón) [2] |
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| Banda | 9 | 9 F1 | Comienzo | 108,296,853 pb [2] |
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Final | 108.302.302 pb [2] |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | |
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NM_000481 NM_001164710 NM_001164711 NM_001164712 |
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RefSeq (proteína) | |
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NP_000472 NP_001158182 NP_001158183 NP_001158184 |
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Ubicación (UCSC) | 3: 49,42 - 49,42 Mb | Crónicas 9: 108,3 - 108,3 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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2.1.2.10 |
37257-08-2 |
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Vista IntEnz |
Entrada BRENDA |
NiceZyme vista |
Entrada KEGG |
camino metabólico |
perfil |
RCSB PDB PDBe PDBsum |
AmiGO / QuickGO |
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artículos | artículos | proteinas |
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Estructura cristalográfica de AMT humana. [5] |
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AMT |
275 |
AMT 473 AMT |
238310 |
1WSR |
NM_000481 |
P48728 |
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2.1.2.10 |
Chr. 3 p21.2-21.1 |
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El gen tiene aproximadamente 6 kb de longitud y consta de nueve exones . La región flanqueante 5 'del gen carece de la secuencia TATAA típica, pero tiene un único sitio de inicio de la transcripción definido detectado por el método de extensión del cebador. Están presentes dos elementos putativos que responden a glucocorticoides y un elemento putativo que responde a la hormona tiroidea. El gen AMT se ha localizado en 3p21.2-p21.1 mediante hibridación in situ con fluorescencia. [6] El marco de lectura abierto de 1209 pares de bases codifica la proteína precursora de 403 aminoácidos, y la secuencia de aminoácidos deducida del péptido maduro muestra 90 y 68% de homología con la de la contraparte bovina y de pollo, respectivamente. [7]
La proteína codificada por este gen tiene su estructura cristalina resuelta a 2 Angstroms . El modelo más reciente contiene dos monómeros relacionados por un eje doble no cristalográfico, 1176 moléculas de agua y 11 moléculas de iones sulfato en una unidad asimétrica. Se observan varias interacciones diméricas entre los residuos en el bucle N-terminal, en la hélice α D y el flanco a cada lado de la cadena β 8 de los dos monómeros. [8]
La proteína codificada por AMT cataliza la liberación de amoníaco y la transferencia de una unidad de carbono de metileno a un resto tetrahidrofolato. El intermedio de aminometilo es el producto de la descarboxilación de glicina catalizada por la proteína P. En la reacción inversa, la proteína T cataliza la formación del intermedio lipoato de aminometilo unido a proteína H a partir de 5,10-CH2-H4folato, amoníaco y proteína H reducida a través de un mecanismo Ter Bi ordenado, en el que la proteína H reducida es el primer sustrato en unirse seguido por 5,10-CH2-H4folato y amoníaco. [9] [10]
Las mutaciones en el gen AMT están asociadas con la encefalopatía por glicina , también conocida como hiperglicinemia no cetósica (NKH), que es un error innato del metabolismo de la glicina definido por la actividad deficiente de la enzima de escisión de la glicina y, como consecuencia, la acumulación de grandes cantidades de glicina en todos los tejidos corporales, incluido el cerebro. La mayoría de las encefalopatías por glicina se presentan en el período neonatal (85% como forma neonatal grave y 15% como forma neonatal atenuada). De los que se presentan en la infancia, el 50% tiene la forma infantil atenuada y el 50% tiene la forma infantil severa. En general, el 20% de todos los niños que se presentan como recién nacidos o bebés tienen un desenlace menos grave, definido como un cociente de desarrollo superior a 20. Una minoría de pacientes tiene formas leves o atípicas de encefalopatía por glicina. [11] La forma neonatal se manifiesta en las primeras horas hasta los días de vida con letargo progresivo, hipotonía y espasmos mioclónicos que conducen a apnea y, a menudo, a la muerte. Los bebés que sobreviven tienen una discapacidad intelectual profunda y convulsiones intratables. La forma infantil se caracteriza por hipotonía, retraso en el desarrollo y convulsiones. Las formas atípicas van desde una enfermedad más leve, con inicio desde la infancia tardía hasta la edad adulta, hasta una enfermedad grave y de progresión rápida con inicio tardío. Se sospecha encefalopatía por glicina en individuos con concentraciones elevadas de glicina en sangre y LCR. Un aumento en la concentración de glicina en el LCR junto con un aumento en la proporción de glicina entre el LCR y el plasma sugiere el diagnóstico. [12] [13] La confirmación enzimática del diagnóstico se basa en la medición de la actividad enzimática del sistema de escisión de glicina (GCS) en el hígado obtenida por biopsia abierta o autopsia. [14] [15] La mayoría de las personas afectadas no tienen actividad enzimática detectable. Los tres genes en los que se sabe que las mutaciones bialélicas causan encefalopatía por glicina son: GLDC (que codifica el componente de proteína P del complejo GCS y representa el 70% -75% de la enfermedad), AMT (representa aproximadamente el 20% de la enfermedad), y GCSH (que codifica el componente de proteína H del complejo GCS y representa <1% de la enfermedad). Aproximadamente el 5% de las personas con encefalopatía por glicina probada por enzimas no tienen una mutación en ninguno de estos tres genes y tienen una forma variante de encefalopatía por glicina. [16] [17] [18]