Translocador nuclear del receptor de hidrocarburos arilo

ARNT
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 4PKY , 1X0O , 2A24 , 2B02 , 2HV1 , 2K7S , 3F1N , 3F1O , 3F1P , 3H7W , 3H82 , 4EQ1 , 4GHI , 4GS9 , 4H6J , 4LPZ , 4XT2
Identificadores
Alias	ARNT , HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, translocador nuclear del receptor de hidrocarburos arilo
Identificaciones externas	OMIM : 126110 MGI : 88071 HomoloGene : 1261 GeneCards : ARNT
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Cromosoma 1 (humano) [1] Banda 1q21.3 Comienzo 150,809,713 pb [1] Fin 150.876.708 pb [1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Cromosoma 3 (ratón) [2] Banda 3 F2.1 | 3 40.74 cm Comienzo 95,434,388 pb [2] Fin 95.497.240 pb [2]
Patrón de expresión de ARN Más datos de expresión de referencia
Ontología de genes Función molecular • Unión de ADN de secuencia específica • Unión de ADN • Actividad de dimerización de proteínas • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Actividad del factor de transcripción de unión al ADN • GO: 0001105 Actividad de coactivador de la transcripción • Unión del receptor de aril hidrocarburo • Factor de transcripción unión • GO: proteína de unión 0001948 • actividad heterodimerización proteína • actividad del factor de transcripción, la ARN polimerasa II potenciador secuencia-específica distal unión • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 ADN vinculante actividad del factor de transcripción, la ARN polimerasa II-específico • actividad de homodimerización de proteínas • unión de ADN de doble hebra específica de secuencia • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 actividad del receptor nuclear Componente celular • citoplasma • complejo regulador de la transcripción • nucleoplasma • complejo de factor de transcripción ARN polimerasa II • núcleo celular • cuerpo nuclear Proceso biológico • regulación positiva de la vía de señalización del receptor del factor de crecimiento endotelial vascular • diferenciación celular • respuesta a la hipoxia • regulación de la transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la proliferación de células endoteliales • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II en respuesta al estrés oxidativo • regulación positiva de diferenciación de eritrocitos • desarrollo de placenta embrionaria • transcripción de ARNm del promotor de ARN polimerasa II • regulación positiva de la sumoilación de proteínas • transcripción, plantilla de ADN • regulación positiva de la transcripción, plantilla de ADN • vía de señalización del receptor intracelular • regulación de la transcripción del promotor de la ARN polimerasa II en respuesta a la hipoxia • regulación positiva de la producción del factor de crecimiento endotelial vascular • regulación positiva del proceso glucolítico • regulación positiva de la transcripción de la ARN polimerasa II promotor • regulación positiva del proceso biosintético hormonal • proceso metabólico xenobiótico Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	405	11863
Ensembl	ENSG00000143437	ENSMUSG00000015522
UniProt	P27540	P53762
RefSeq (ARNm)	NM_001197325 NM_001286035 NM_001286036 NM_001668 NM_178426 NM_178427 NM_001350224 NM_001350225 NM_001350226	NM_001037737 NM_009709
RefSeq (proteína)	NP_001184254 NP_001272964 NP_001272965 NP_001659 NP_848514 NP_001337153 NP_001337154 NP_001337155	NP_001032826 NP_033839
Ubicación (UCSC)	Crónicas 1: 150,81 - 150,88 Mb	Crónicas 3: 95,43 - 95,5 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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El gen ARNT codifica la proteína translocadora nuclear del receptor de hidrocarburo de arilo que forma un complejo con el receptor de hidrocarburo de arilo unido a ligando (AhR), y es necesario para la función del receptor. La proteína codificada también se ha identificado como la subunidad beta de un factor de transcripción heterodimérico, el factor 1 inducible por hipoxia (HIF1). Una translocación t (1; 12) (q21; p13), que da como resultado una proteína de fusión TEL-ARNT , se asocia con leucemia mieloblástica aguda . Se han descrito tres variantes empalmadas alternativamente que codifican diferentes isoformas para este gen.

El receptor de hidrocarburos arilo (AhR) participa en la inducción de varias enzimas que participan en el metabolismo xenobiótico . La forma citosólica libre de ligando del receptor de hidrocarburo de arilo forma un complejo con la proteína de choque térmico 90 . La unión del ligando, que incluye dioxinas e hidrocarburos aromáticos policíclicos , da como resultado la translocación de la subunidad de unión al ligando solo en ^[5] el núcleo. La inducción de enzimas implicadas en el metabolismo xenobiótico se produce mediante la unión del AhR unido al ligando a elementos sensibles a xenobióticos en los promotores de genes para estas enzimas.

Interacciones

Se ha demostrado que el translocador nuclear del receptor de hidrocarburos arilo interactúa con:

• AIP , ^{[6] [7]}
• AHR , ^{[8] [9] [10] [11]}
• EPAS1 , ^[12]
• HIF1A , ^{[12] [13]}
• NCOA2 , ^[14]
• SIM1 , ^{[13] [15]} y
• SIM2 . ^{[13] [15] [16] [17]}

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000143437 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015522 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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Lectura adicional

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• Ema M, Taya S, Yokotani N, Sogawa K, Matsuda Y, Fujii-Kuriyama Y (1997). "Un nuevo factor bHLH-PAS con una estrecha similitud de secuencia con el factor 1 alfa inducible por hipoxia regula la expresión de VEGF y está potencialmente implicado en el desarrollo pulmonar y vascular" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 94 (9): 4273–8. doi : 10.1073 / pnas.94.9.4273 . PMC  20712 . PMID  9113979 .
• Moffett P, Reece M, Pelletier J (1997). "El producto del gen murino Sim-2 inhibe la transcripción por represión activa e interferencia funcional" . Mol. Celda. Biol . 17 (9): 4933–47. doi : 10.1128 / mcb.17.9.4933 . PMC  232345 . PMID  9271372 .

Enlaces externos

• Aryl + Hydrocarbon + Receptor + Nuclear + Translocator en la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU. Medical Subject Headings (MeSH)

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .