La materia oscura biológica es un término informal para el material genético no clasificado o poco entendido. Este material genético puede referirse a material genético producido por microorganismos no clasificados . Por extensión, la materia oscura biológica también puede referirse al microorganismo no aislado cuya existencia solo puede inferirse del material genético que producen. Es posible que parte del material genético no pertenezca a los tres dominios de la vida existentes: bacterias , arqueas y eucariotas ; así, se ha sugerido que un posible cuarto dominio de la vida aún puede ser descubierto, [1] [2] aunque también son probables otras explicaciones. Alternativamente, el material genético puede referirse aADN no codificante (el llamado "ADN basura") [3] [4] [5] y ARN no codificante producido por organismos conocidos. [6] [7] [8]
Materia oscura genómica
Se cree que gran parte de la materia oscura genómica se origina a partir de elementos transponibles antiguos y de otros elementos repetitivos de baja complejidad. [9] [10] El material genético no categorizado se encuentra en humanos y muchas otras especies. [1] [11] Su novedad filogenética podría indicar los organismos celulares o virus de los que evolucionaron. [12]
Microorganismos no clasificados
Hasta el 99% de todos los microorganismos vivos no se pueden cultivar , [13] [14] [15] [16] [17], por lo que existen pocos conocimientos funcionales sobre el potencial metabólico de estos organismos.
Las secuencias que se cree que se derivan de microbios desconocidos se denominan materia oscura microbiana, [18] viroma oscuro, [19] u hongos de materia oscura. [20] Estas secuencias no son raras. Se ha estimado que en material procedente de humanos, entre el 40 y el 90% de las secuencias virales son de materia oscura. [21] [22] [23] La sangre humana contiene más de tres mil secuencias de ADN diferentes que aún no se pueden identificar. [24]
Se han desarrollado algoritmos que examinan las secuencias en busca de similitudes con secuencias de ARN 16S bacterianas, [25] similitudes de K-mer con virus conocidos, [26] características específicas del uso de codones , [27] o para inferir la existencia de proteínas. [28] Estos enfoques han sugerido, por ejemplo, la existencia de un nuevo bacteriófago de la familia microviridae , [28] y un nuevo fago similar a los bacterioidales. [29] Otros estudios han sugerido la existencia de 264 nuevos géneros virales, descubiertos en bases de datos disponibles públicamente, [30] y un estudio de sangre humana sugirió que el 42% de las personas tienen al menos un virus previamente desconocido cada una, sumando 19 diferentes nuevos géneros. [31] Un estudio exhaustivo de las secuencias de ADN de múltiples muestras humanas infirió la existencia de 4.930 especies de microbios, de las cuales el 77% no se había informado previamente. [32] Los hallazgos relacionados con la salud incluyen un profago que podría estar asociado con la cirrosis del hígado, [26] y siete secuencias novedosas de niños con diabetes tipo 1 que tienen características de virus. [33] Aunque podrían existir, no se han descubierto en la materia oscura organismos que claramente causen enfermedades humanas.
Ver también
- Cultivo microbiológico : método para permitir que los microorganismos se multipliquen en un medio controlado
- Biosfera en la sombra : una hipotética biosfera microbiana de la Tierra que utilizaría procesos bioquímicos y moleculares radicalmente diferentes a los de la vida conocida actualmente.
- Taxonomía : ciencia de nombrar, definir y clasificar organismos
- Xenobiología : ciencia de las formas de vida sintéticas
Referencias
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