CD1D es el gen humano que codifica la proteína CD1d , [5] un miembro de la familia CD1 (grupo de diferenciación 1) de glicoproteínas expresadas en la superficie de varias células presentadoras de antígenos humanos . Son no clásicos de MHC de las proteínas, los relacionados con las MHC de clase I proteínas, y están involucrados en la presentación de lípidos antígenos a las células T . CD1d es el único miembro del grupo 2 moléculas CD1.
CD1D |
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Estructuras disponibles |
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PDB | Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB |
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Lista de códigos de identificación de PDB |
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4WO4 , 1ZT4 , 2PO6 , 3HUJ , 3SDX , 3TZV , 3U0P , 3VWJ , 3VWK , 4EN3 , 4LHU , 4MNG , 4MQ7 , 4WW2 |
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Identificadores |
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Alias | CD1D , CD1A, R3, R3G1, molécula CD1d |
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Identificaciones externas | OMIM : 188410 MGI : 107674 HomoloGene : 1337 GeneCards : CD1D |
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Ubicación de genes ( humanos ) |
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| Chr. | Cromosoma 1 (humano) [1] |
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| Banda | 1q23.1 | Comienzo | 158.178.030 pb [1] |
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Final | 158.186.427 pb [1] |
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Ubicación de genes ( ratón ) |
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| Chr. | Cromosoma 3 (ratón) [2] |
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| Banda | 3 F1 | 3 37,91 cm | Comienzo | 86,995,834 pb [2] |
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Final | 86,999,441 pb [2] |
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Patrón de expresión de ARN |
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| Más datos de expresión de referencia |
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Ontología de genes |
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Función molecular | • unión beta-2-microglobulina • unión lipopéptido • unión histona • endógena de lípidos de unión a antígeno • lípido de unión a antígeno • exógena de lípidos de unión a antígeno • unión molécula de adhesión celular • GO: proteína de unión 0001948
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Componente celular | • citoplasma • componente integral de la membrana • endosoma • membrana del retículo endoplásmico • membrana • componente integral de la membrana plasmática • superficie celular • membrana lisosomal • membrana plasmática basolateral • lisosoma • membrana endosómica • membrana plasmática • retículo endoplásmico • espacio extracelular • lado externo del plasma membrana
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Proceso biológico | • Proceso del sistema inmunológico • Selección de células T • Adhesión célula-célula heterotípica • Regulación positiva de la proliferación de células T • Detección de bacterias • Regulación positiva de la respuesta inmune innata • Procesamiento y presentación de antígenos, antígeno lipídico exógeno vía MHC clase Ib • Respuesta inmune innata • GO: 0022415 proceso viral • procesamiento y presentación de antígenos, antígeno lipídico endógeno a través del MHC clase Ib • regulación de la respuesta inmune • regulación positiva de la citotoxicidad mediada por células T • respuesta inmune
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Fuentes: Amigo / QuickGO |
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Ortólogos |
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Especies | Humano | Ratón |
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Entrez | | |
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Ensembl | | |
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UniProt | | |
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RefSeq (ARNm) | |
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NM_001766 NM_001319145 NM_001371761 NM_001371762 NM_001371763 |
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NM_007639 NM_001379501 NM_001379502 NM_001379503 |
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RefSeq (proteína) | |
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NP_001306074 NP_001757 NP_001358690 NP_001358691 NP_001358692 |
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NP_031665 NP_001366430 NP_001366431 NP_001366432 |
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Ubicación (UCSC) | Crónicas 1: 158,18 - 158,19 Mb | Crónicas 3:87 - 87 Mb |
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Búsqueda en PubMed | [3] | [4] |
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Wikidata |
Ver / editar humano | Ver / Editar mouse |
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Los antígenos lipídicos presentados por CD1d activan una clase especial de células T, conocidas como células T asesinas naturales (NKT) , a través de la interacción con el receptor de células T presente en las membranas NKT. [5] Cuando se activan, las células NKT producen rápidamente citocinas Th1 y Th2 , típicamente representadas por la producción de interferón-gamma e interleucina 4 .
CD1d también se conoce como R3G1
Algunos de los ligandos conocidos para CD1d son:
- α - galactosilceramida (α-GalCer), un compuesto derivado originalmente de la esponja marina Agelas mauritanius [6] sin función fisiológica pero de gran utilidad en la investigación.
- α- glucuronil y α- galacturonyl- ceramidas , una familia de compuestos de origen microbiano que se pueden encontrar, por ejemplo, en la pared celular de Sphingomonas , una ubicua Gram-negativas bacteria . [7] La β-D- glucopiranosilceramida relacionada se acumula en las células presentadoras de antígeno después de la infección, donde sirve para activar las NKT invariantes (iNKT), un tipo especial de NKT.
- iGb3 , un autoantígeno que se ha implicado en la selección de iNKT. [8]
- HS44, un análogo sintético de ceramida aminociclitólica que tiene menos contacto con el TCR, activa iNKT de una manera más restringida que la α-GalCer (especialmente en relación con la producción de citocinas Th2) y por lo tanto más interesante para uso terapéutico. [9]
Los tetrámeros de CD1d son construcciones de proteínas compuestas por cuatro moléculas de CD1d unidas y normalmente marcadas con fluorescencia , que se utilizan para identificar células NKT u otras células reactivas a CD1d. En particular, las células NKT de tipo I y algunas células NKT de tipo II se tiñen con ellas. Se puede obtener una diferenciación de estos dos tipos en humanos utilizando un anticuerpo contra la cadena Vα24 de TCR, que es específico de las células NKT de tipo I. [10]
Aunque son los oligómeros CD1d más utilizados, en ocasiones se utilizan dímeros CD1d (dos unidades) o pentámeros (cinco unidades). [10]