Región determinante de la complementariedad
Las regiones determinantes de la complementariedad ( CDR ) forman parte de las cadenas variables de inmunoglobulinas (anticuerpos) y receptores de células T , generadas por células B y células T respectivamente , donde estas moléculas se unen a su antígeno específico. Un conjunto de CDR constituye un paratope . Como las partes más variables de las moléculas, las CDR son cruciales para la diversidad de especificidades antigénicas generadas por los linfocitos .
Hay tres CDR (CDR1, CDR2 y CDR3), dispuestos de forma no consecutiva, en la secuencia de aminoácidos de un dominio variable de un receptor de antígeno. Dado que los receptores de antígenos se componen típicamente de dos dominios variables (en dos cadenas polipeptídicas diferentes, cadena pesada y cadena ligera ), hay seis CDR para cada receptor de antígeno que pueden entrar en contacto colectivamente con el antígeno. Una sola molécula de anticuerpo tiene dos receptores de antígeno y, por lo tanto, contiene doce CDR en total. Hay tres bucles de CDR por dominio variable en los anticuerpos. Sesenta CDR se pueden encontrar en una molécula de IgM pentamérica.
Dado que la mayoría de las variaciones de secuencia asociadas con las inmunoglobulinas y los receptores de células T se encuentran en las CDR, estas regiones a veces se denominan regiones hipervariables . [1] Dentro del dominio variable , CDR1 y CDR2 se encuentran en la región variable (V) de una cadena polipeptídica, y CDR3 incluye parte de V, todas las regiones de diversidad (D, cadenas pesadas solamente) y unión (J). [2] CDR3 es el más variable.
La estructura terciaria de un anticuerpo es importante para analizar y diseñar nuevos anticuerpos. Las estructuras tridimensionales de las CDR no H3 de anticuerpos han sido agrupadas y clasificadas por Chothia et al. [3] y más recientemente por North et al. [4] El modelado de homología es un método computacional para construir estructuras terciarias a partir de secuencias de aminoácidos. Las llamadas reglas H3 son reglas empíricas para construir modelos de CDR3. [5]
