CNOT4

CNOT4
Estructuras disponibles PDB Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación de PDB 1E4U , 1UR6
Identificadores
Alias	Subunidad 4 del complejo de transcripción CNOT4 , CLONE243, NOT4, NOT4H, CCR4-NOT
Identificaciones externas	OMIM : 604911 MGI : 1859026 HomoloGene : 40870 GeneCards : CNOT4
Ubicación de genes ( humanos ) Chr. Chromosome 7 (human)[1] Band 7q33 Start 135,361,795 bp[1] End 135,510,127 bp[1]
Ubicación de genes ( ratón ) Chr. Chromosome 6 (mouse)[2] Band 6|6 B1 Start 35,022,065 bp[2] End 35,133,724 bp[2]
Ontología de genes Molecular function • ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948 protein binding • nucleic acid binding • metal ion binding • transferase activity • RNA binding Cellular component • cytosol • cytoplasm • CCR4-NOT complex • nucleus Biological process • protein ubiquitination • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • protein autoubiquitination • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of megakaryocyte differentiation Sources:Amigo / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano	Ratón
Entrez	4850	53621
Ensembl	ENSG00000080802	ENSMUSG00000038784
UniProt	O95628	Q8BT14
RefSeq (ARNm)	NM_001008225 NM_001190847 NM_001190848 NM_001190849 NM_001190850 NM_013316 NM_001393370 NM_001393371 NM_001393372 NM_001393373 NM_001393374 NM_001393375	NM_001164411 NM_001164412 NM_001164413 NM_001164414 NM_016877
RefSeq (proteína)	NP_001008226 NP_001177776 NP_001177777 NP_001177778 NP_001177779 NP_037448	NP_001157883 NP_001157884 NP_001157885 NP_001157886 NP_058573
Ubicación (UCSC)	Crónicas 7: 135,36 - 135,51 Mb	Crónicas 6: 35,02 - 35,13 Mb
Búsqueda en PubMed	[3]	[4]
Wikidata
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El complejo de transcripción CCR4-NOT, subunidad 4, es una proteína que en humanos está codificada por el gen CNOT4 . ^[5]

Función

La proteína codificada por este gen es una subunidad del complejo CCR4-Not , un regulador transcripcional global y deadenilasa . La proteína codificada interactúa con CNOT1 y tiene actividad de ubiquitina ligasa . Se han encontrado varias variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas para este gen [proporcionada por RefSeq, julio de 2010]. Las enfermedades asociadas con CNOT4 incluyen adenoiditis. ^[6]

Referencias

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000080802 - Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038784 - Ensembl , mayo de 2017
3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
4. "Referencia de PubMed del ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
5. "Entrez Gene: complejo de transcripción CCR4-NOT, subunidad 4" .
6. "Gen CNOT4 - GeneCards | Proteína CNOT4 | Anticuerpo CNOT4" . www.genecards.org . Consultado el 21 de junio de 2019 .

Lectura adicional

• Grönholm J, Kaustio M, Myllymäki H, Kallio J, Saarikettu J, Kronhamn J, Valanne S, Silvennoinen O, Rämet M (marzo de 2012). "Not4 mejora la expresión génica dependiente de la vía JAK / STAT en Drosophila y en células humanas". Revista FASEB . 26 (3): 1239–50. doi : 10.1096 / fj.11-195875 . PMID  22159038 . S2CID  25618632 .
• Winkler GS, Albert TK, Dominguez C, Legtenberg YI, Boelens R, Timmers HT (marzo de 2004). "Un par de enzima conjugadora de ubiquitina / ubiquitina-proteína ligasa de especificidad alterada". Revista de Biología Molecular . 337 (1): 157–65. doi : 10.1016 / j.jmb.2004.01.031 . PMID  15001359 .
• Lau NC, Kolkman A, van Schaik FM, Mulder KW, Pijnappel WW, Heck AJ, Timmers HT (septiembre de 2009). "Los complejos humanos Ccr4-Not contienen subunidades variables de deadenilasa" (PDF) . La revista bioquímica . 422 (3): 443–53. doi : 10.1042 / BJ20090500 . PMID  19558367 .
• Albert TK, Hanzawa H, Legtenberg YI, de Ruwe MJ, van den Heuvel FA, Collart MA, Boelens R, Timmers HT (febrero de 2002). "Identificación de una subunidad de ubiquitina-proteína ligasa dentro del complejo represor de la transcripción CCR4-NOT" . El diario EMBO . 21 (3): 355–64. doi : 10.1093 / emboj / 21.3.355 . PMC  125831 . PMID  11823428 .
• Dominguez C, Bonvin AM, Winkler GS, van Schaik FM, Timmers HT, Boelens R (abril de 2004). "Modelo estructural del complejo UbcH5B / CNOT4 revelado mediante la combinación de enfoques de RMN, mutagénesis y acoplamiento" . Estructura . 12 (4): 633–44. doi : 10.1016 / j.str.2004.03.004 . PMID  15062086 .
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (junio de 2002). "Análisis de etiquetas de secuencia expresada de RPE / coroides humanos para el Proyecto NEIBank: más de 6000 transcripciones no redundantes, genes novedosos y variantes de empalme". Visión molecular . 8 : 205-20. PMID  12107410 .
• Mersman DP, Du HN, Fingerman IM, South PF, Briggs SD (abril de 2009). "La poliubiquitinación de la desmetilasa Jhd2 controla la metilación de histonas y la expresión génica" . Genes y desarrollo . 23 (8): 951–62. doi : 10.1101 / gad.1769209 . PMC  2675863 . PMID  19346402 .
• Hanzawa H, de Ruwe MJ, Albert TK, van Der Vliet PC, Timmers HT, Boelens R (marzo de 2001). "La estructura del dedo anular C4C4 de NOT4 humano revela características distintas de las de los dedos ANULAR C3HC4" . La revista de química biológica . 276 (13): 10185–90. doi : 10.1074 / jbc.M009298200 . PMID  11087754 .
• Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz ​​R, Collart MA, Timmers HT (febrero de 2000). "Aislamiento y caracterización de ortólogos humanos de subunidades del complejo CCR4-NOT de levadura" . Investigación de ácidos nucleicos . 28 (3): 809-17. doi : 10.1093 / nar / 28.3.809 . PMC  102560 . PMID  10637334 .

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .

Este artículo sobre un gen en el cromosoma 7 humano es un fragmento . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo .

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