El COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK) es un grupo de agencias de salud pública e instituciones académicas del Reino Unido creado en abril de 2020 [1] [2] [3] para recopilar, secuenciar y analizar genomas del SARS-CoV -2 como parte de la respuesta a la pandemia de COVID-19 . El consorcio comprende las cuatro agencias de salud pública del Reino Unido, organizaciones del Servicio Nacional de Salud, socios académicos y el Instituto Wellcome Sanger . El consorcio es conocido por identificar por primera vez la variante alfa del SARS-CoV-2 (en ese momento, denominada Variante de preocupación 202012/01) en noviembre de 2020. [4] A partir de enero de 2021, el 45 % de todos los SARS-CoV- 2 secuencias subidas alLa base de datos de secuenciación de GISAID se originó en COG-UK. [5] [6] [7]
En abril de 2021, COG-UK comenzó la transición planificada de secuenciación a un servicio nacional, que se completará en septiembre de 2021. [8] COG-UK ha declarado que sus prioridades después de esta transición son el enlace de datos, la investigación y la capacitación internacional. [9]
La secuenciación nacional coordinada temprana y a gran escala de los genomas virales del SARS-CoV-2, junto con el intercambio abierto y rápido de datos genómicos, tuvo el siguiente impacto en los primeros 12 meses del Respuesta a la pandemia de COVID-19: [10]
COG-UK cuenta con el apoyo de £ 20 millones de fondos del Departamento de Salud y Atención Social , Investigación e Innovación del Reino Unido (UKRI) y el Instituto Wellcome Sanger , [1] administrado por UKRI. [ cita requerida ] El consorcio también recibió el respaldo del Fondo de Innovación de Pruebas del Departamento de Salud y Atención Social el 16 de noviembre de 2020 para facilitar la capacidad de secuenciación del genoma necesaria para satisfacer el creciente número de casos de COVID-19 en el Reino Unido durante el período de invierno. [20]
Los socios del consorcio incluyen el Wellcome Sanger Institute , el Quadram Institute y 15 más [21] universidades, incluidas la Queen's University Belfast , la Universidad de Birmingham , la Universidad de Cardiff , la Universidad de Cambridge , la Universidad de Edimburgo , la Universidad de Exeter , la Universidad de Glasgow , Universidad de Liverpool , Universidad de Northumbria , Universidad de Nottingham , Universidad de Oxford , Universidad de Portsmouth ,University College London , Imperial College London y la Universidad de Sheffield . [22]
La directora ejecutiva del consorcio es Sharon Peacock , profesora y microbióloga de la Universidad de Cambridge . [23] [5] Desde el comienzo de la pandemia hasta septiembre de 2021, Peacock estuvo adscrita a tiempo parcial a Public Health England como Directora de Ciencias, donde se centró en el desarrollo de la secuenciación de patógenos a través de COG-UK. [24]