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Iniciativa GISAID
Logotipo oficial de GISAID
AbreviaturaGISAID
FormaciónMayo de 2008 ; Hace 12 años (May 2008)
EscribeOrganización sin fines de lucro Asociación
público-privada
ObjetivoSalud global , investigación , educación
SedeMúnich , alemania
Área de servicio
Mundial
MétodoDonaciones y subvenciones
Gente clave
Peter Bogner, (presidente) [1] Ron AM Fouchier y John W. McCauley (copresidentes del Consejo Asesor Científico) [2]
Sitio webgisaid.org

GISAID es una iniciativa científica mundial y la principal fuente establecida en 2008 que ofrece acceso abierto a los datos genómica de influenza virus [3] y el coronavirus responsable de la COVID-19 pandemia. [4] [5] El 10 de enero de 2020, las primeras secuencias del genoma completo del SARS-CoV-2 se pusieron a disposición en GISAID, lo que permitió respuestas globales a la pandemia, [6] incluido el desarrollo de las primeras vacunas [7 ] y pruebas de diagnóstico [8] para detectar el SARS-CoV-2. GISAID facilita la epidemiología genómica y la vigilancia en tiempo real para monitorear la aparición de nuevas cepas virales COVID-19 en todo el planeta. [6][9]

Desde su establecimiento como una alternativa al intercambio de datos sobre la influenza aviar [10] a través de archivos de dominio público convencionales, [3] [11] GISAID es reconocido por incentivar el intercambio rápido de datos sobre brotes [11] durante la pandemia de H1N1 [12] [13] en 2009, el H7N9 epidemia [14] [15] en 2013, y la COVID-19 pandemia [16] [17] en 2020.

GISAID fue reconocida por su importancia para la salud global por los ministros de salud del G20 en 2017, [18] y en 2020 el científico jefe de la Organización Mundial de la Salud calificó la iniciativa de ciencia de datos como "un cambio de juego". [4]

Origen [ editar ]

El GISAID siglas encontró primera mención en una carta correspondencia publicada en la revista Naturaleza en 2006, [19] proponer una aspiración inicial de la creación de un " consorcio " para una nueva g lobal i NICIATIVA en s Haring un Vian i nfluenza d ATA, mediante el cual sus miembros [11] publicarían datos en bases de datos disponibles públicamente hasta seis meses después del análisis y la validación. [20]

Taller de secuenciación de próxima generación de GISAID ( Instituto Pasteur , París 2015)

Aunque no se establecieron reglas básicas básicas para compartir, [21] la carta de correspondencia fue firmada por más de 70 científicos destacados, incluidos siete premios Nobel , porque el acceso a los datos genéticos más recientes del virus zoonótico H5N1 altamente patógeno a menudo estaba restringido, en parte debido a la vacilación de los estados miembros de la Organización Mundial de la Salud para compartir sus genomas de virus y poner en riesgo los derechos de propiedad. [22]

Se necesitarían otros 18 meses hasta que los gobiernos y los investigadores pudieran alcanzar un consenso internacional sobre las reglas reales del mecanismo de intercambio de GISAID. Por lo tanto, GISAID se lanzó oficialmente [9] en mayo de 2008 en Ginebra con motivo de la 61ª Asamblea Mundial de la Salud, como una base de datos de acceso público en lugar de un consorcio que requiere membresía. [11] [12]

Acercamiento [ editar ]

El modelo GISAID de incentivar y reconocer a quienes depositan datos ha sido recomendado como modelo para iniciativas futuras. [23] Una mayor transparencia y un intercambio más oportuno de datos de secuencia ha sido un objetivo de muchos investigadores y partes interesadas por igual. La plataforma GISAID abarca fronteras nacionales y disciplinas científicas, con líderes en los campos de la medicina veterinaria , la medicina humana , la bioinformática , la epidemiología y la propiedad intelectual.. Este esfuerzo interdisciplinario proporciona nuevos medios para comunicar y compartir información, ya que cada disciplina tiene intereses distintos pero también comparte objetivos similares. La Iniciativa se unió de una manera que da crédito a quienes envían datos y hace esfuerzos sustanciales para trabajar con ellos e incluirlos en análisis colaborativos sobre datos de secuencias virales, "inclinando aún más la balanza a favor de la colaboración". [23] La noción de compartir no solo datos, sino también los beneficios de la investigación resultante, representó un "cambio de paradigma" que coloca a los contribuyentes de entornos de recursos más altos y más bajos en una base más equitativa. [23]

Historia [ editar ]

Ceremonia oficial de firma con el presidente de GISAID, Peter Bogner (izquierda) y el secretario de Estado alemán, Robert Kloos. Fuente: BMELV ( Berlín , abril de 2010)

La Iniciativa GISAID fue financiada inicialmente por Peter Bogner, un asesor estratégico y ejecutivo de radiodifusión internacional, quien se desempeña como su fundador y facilitador principal. Bogner ha estado dirigiendo la construcción de esta plataforma reuniendo a los principales científicos y partes interesadas del mundo que están activamente comprometidos con acelerar la comprensión de esta posible pandemia humana al compartir rápidamente datos y resultados científicos. En enero de 2006, Bogner se reunió con el secretario de Seguridad Nacional de EE. UU., Michael Chertoff, en el Foro Económico Mundial en Davos , Suiza , y se le informó sobre el concepto de preparación del gobierno de EE. UU. Para hacer frente al potencial de una pandemia de gripe. [24]Aumentaron las preocupaciones sobre un escenario de pandemia. [25]

En noviembre de 2006, la Iniciativa recibió el respaldo tanto de la Royal Society como de la Academia de Ciencias Médicas . [26] En febrero de 2007, se anunció que GISAID y el Instituto Suizo de Bioinformática , que lidera un consorcio suizo para administrar la base de datos GISAID sobre cepas de virus de influenza, habían firmado un acuerdo de cooperación. [11] En virtud de este acuerdo, el instituto con sede en Ginebra debía proporcionar servicios para el almacenamiento seguro y el análisis de datos genéticos, epidemiológicos y clínicos.

En enero de 2007, Indonesia dejó de compartir todas las muestras clínicas de H5N1 con la OMS. En marzo de 2007, Siti Fadilah Supari , Ministra de Salud de Indonesia, anunció [27] que el gobierno indonesio apoya la formación de la Iniciativa global para compartir la base de datos de influenza aviar (GISAID) luego de una reunión de alto nivel de la OMS en Yakarta sobre prácticas responsables para compartir aves. Virus de la influenza. En abril de 2007, la Academia de Ciencias de Indonesia reafirmó su respaldo a GISAID, afirmando que comparte los mismos ideales con respecto al libre intercambio y el intercambio responsable de información sobre la influenza aviar y las enfermedades infecciosas emergentes.

En 2008, GISAID fue adoptado por los “Centros Colaboradores de la OMS para la Influenza” para ingresar datos de secuencia de muestras recibidas de los Centros Nacionales de Influenza (NIC) en el Sistema Global de Vigilancia y Respuesta a la Influenza de la OMS .

En abril de 2010, la República Federal de Alemania anunció durante la Séptima Conferencia Ministerial Internacional sobre Gripe Aviar y Pandemia en Hanoi , Vietnam , que la Iniciativa GISAID celebró un acuerdo de cooperación [28] con el gobierno alemán, convirtiendo a Alemania en el anfitrión a largo plazo. de la plataforma GISAID. [29] En virtud del acuerdo, Alemania, representada por el Ministerio Federal de Alimentación, Agricultura y Protección del Consumidor BMELV , garantizará la sostenibilidad de la iniciativa proporcionando a través de su Oficina Federal de Agricultura y Alimentación (BLE) las instalaciones técnicas de alojamiento [30]de la plataforma GISAID y la base de datos EpiFlu ™, ubicada en Bonn . Instituto Federal de Alemania para la Salud Animal del Loeffler Instituto Friedrich (FLI), ubicado en la Isla de Riems , se asegurará la plausibilidad y la curación de los datos científicos en GISAID para cumplir con los estándares científicos.

El 10 de enero de 2020, el Centro Chino para el Control y la Prevención de Enfermedades publicó las primeras secuencias genéticas del SARS-CoV-2 y se compartieron a través de GISAID. [7] A lo largo de 2020, se han agregado a la base de datos GISAID enormes volúmenes de secuencias del genoma del SARS-CoV-2 muestreadas y analizadas en todo el mundo, que los laboratorios de todo el mundo comparten rápidamente. [31] [32]

Gobernanza [ editar ]

La estructura de gobierno de GISAID [33] prevé varios órganos organizativos que operan de forma independiente entre sí, con el objetivo de protegerse contra los prejuicios en la toma de decisiones. Los asuntos administrativos de GISAID son supervisados ​​por una junta de fideicomisarios que se espera que minimice los posibles conflictos de intereses relacionados con las fuentes de financiación de GISAID. La supervisión científica de la iniciativa proviene de su Consejo Asesor Científico compuesto por directores de los principales laboratorios de salud pública, incluidos los seis Centros Colaboradores de la OMS para la Influenza, y directores de laboratorios de referencia en salud animal para la investigación de la influenza aviar para la Organización Mundial de Sanidad Animal.y la Organización de las Naciones Unidas para la Agricultura y la Alimentación . Esta estructura de gobierno está destinada a mejorar las capacidades funcionales de la base de datos EpiFlu ™ administrada por el Grupo Técnico de Bases de Datos de GISAID, compuesto por expertos en secuenciación de virus y bioinformática , quienes representan a la comunidad de usuarios para interactuar con software y desarrolladores de herramientas de análisis. [34]

Acceso y propiedad intelectual [ editar ]

A diferencia de las bases de datos de dominio público como GenBank y EMBL , los usuarios de GISAID deben tener su identidad confirmada y aceptar un Acuerdo de acceso a la base de datos [35] que rige la forma en que se pueden utilizar los datos de GISAID. Estos Términos de uso evitan que los usuarios compartan datos con otros usuarios que no hayan aceptado los Términos de uso. Los Términos de uso requieren que los usuarios de los datos reconozcan a los generadores de datos en el trabajo publicado y también hagan un intento razonable de colaborar con los generadores de datos e involucrarlos en la investigación y el análisis que utiliza sus datos.

Una dificultad que el Acuerdo de acceso a datos de GISAID intenta abordar es que muchos investigadores temen que compartir los datos de la secuencia de la influenza pueda facilitar su apropiación indebida a través de reclamos de propiedad intelectual por parte de la industria de vacunas y otros, lo que dificulta el acceso a vacunas y otros artículos en los países en desarrollo, ya sea a través de altos costos o evitando la transferencia de tecnología. Si bien la mayoría de los expertos en interés público están de acuerdo con GISAID en que los datos de la secuencia de la influenza deben hacerse públicos, y este es el tema del acuerdo de muchos investigadores, algunos brindan la información solo después de presentar solicitudes de patente, mientras que otros han dicho que el acceso a la misma debe ser solo por parte de los investigadores. condición de que no se presenten patentes u otras reclamaciones de propiedad intelectual. El Acuerdo de acceso a datos de GISAID aborda esto directamente para promover el intercambio de datos. Los procedimientos de GISAID sugieren además que quienes acceden a la base de datos EpiFlu consulten los países de origen de las secuencias genéticas y los investigadores que descubrieron las secuencias.

Como resultado, la licencia GISAID ha cambiado el campo del análisis de datos de secuencias virales. Por ejemplo, la licencia tiene el efecto de que no existen sitios web públicos que permitan visualizar o analizar secuencias de GISAID, excepto los aprobados por determinadas personas dentro de GISAID. A los investigadores que muestran secuencias de GISAID en otras plataformas web se les ha eliminado rápidamente el acceso a los datos y se les han enviado cartas legales de las oficinas de abogados. [36]El software de investigación de asignación de linaje debe cifrar las secuencias GISAID internamente, lo que significa que los resultados son imposibles de depurar por otros investigadores. La licencia también prohíbe explícitamente la vinculación de bases de datos públicas a datos GISAID, por lo que es difícil encontrar duplicados debido a envíos dobles. A diferencia de otros dominios de investigación con su tradición científica de atribuir el crédito donde se debe y permitir la creación y revisión de un ecosistema de herramientas de calidad variable, la licencia GISAID es un esfuerzo único para hacer cumplir la aprobación de análisis previo y el reconocimiento de datos en un todo. campo de investigación a través de una licencia de datos legales.

Referencias [ editar ]

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Enlaces externos [ editar ]

  • GISAID - Página oficial
  • Epidemiología genómica de hCoV-19 : la aplicación GISAID rastrea la propagación de cepas de SARS-CoV-2 en todo el mundo
  • Reuters Foundation AlertNet sobre la gripe aviar
  • El mashup de la naturaleza que integra datos sobre los brotes de gripe aviar hasta principios de 2006 de la OMS y la FAO en Google Earth
  • Documentos del Consejo Ejecutivo de la OMS sobre las mejores prácticas para compartir virus de influenza y datos de secuencia, enero de 2007